Body condition factor and diet the endemic ichthyofauna in streams of the Atlantic Forest inside and outside in an environmental protection area / Fator de condição corporal e dieta da ictiofauna endêmica em riachos da Mata Atlântica dentro e fora de uma área de proteção ambiental

This is paper we analyze the diet and body condition factor (Mi) of three endemic species inside and outside an environmental protection area, to compare the effectiveness of the protection area in providing a greater spectrum of food items and greater environmental well-being to ichthyofauna. The study area comprised streams of the Ribeira do Iguape River basin, Campos Gerais National Park (CGNP), Paraná state and its surroundings. Eleven streams were sampled inside and outside, using electric fishing. A Permutational Multivariate Analysis of Variance to investigate the composition of food items and a Permutational Analysis of Multivariate Dispersions was used to investigate the variability between food items. The Scaled Mass Index (Mi) of the body condition was used to determine the relative condition factor of each individual of each species. Regarding the diet, there were no significant differences between inside and outside in the composition and variability of food items, this similarity may be associated with existing environmental degradation inside. However, the Mi was significant, and only one species presented greater well-being inside, because inside streams receive greater allochthonous intake of riparian vegetation, but, when it comes to the two species that perform the link of the aquatic food web with the terrestrial, the opposite occurred. These results indicate that the studied fragment, under anthropic pressures, is currently unable to conserve its biodiversity. The inside has no Management Plan, the manager must elaborate and implement it as a first step so that the situation can be reverted and the conservation effectiveness ensured in this highly threatened area, characterized by being one of the most important remnants of the Atlantic Forest, having relevant ecosystem services from a rare humid forest of Araucaria.(AU)

Neste trabalho, analisamos dieta e fator de condição corporal (Mi) de três espécies endêmicas dentro e fora de uma área de proteção ambiental, para comparar a efetividade da área protegida em subsidiar maior espectro de itens alimentares e maior bem-estar ambiental à ictiofauna. A área de estudo compreendeu riachos que fazem parte da bacia hidrográfica do Rio Ribeira de Iguape, interior e imediações do Parque Nacional dos Campos Gerais (PNCG), estado do Paraná. Foram amostrados 11 riachos dentro e fora, com auxílio de pesca elétrica. A Análise de Variância Multivarada Permutacional foi usada para investigar a composição dos itens alimentares e a Análise Permutacional de Dispersões Multivariadas para investigar a variabilidade entre os itens alimentares. O Índice de Massa Escalonado (Mi) de condição corporal foi usado para determinar o fator de condição relativo de cada indivíduo de cada espécie. Para a dieta analisada não houve diferenças significavas entre dentro e fora, na composição e na variabilidade de itens alimentares, esta similaridade pode estar associada a degradação ambiental existente dentro. Entretanto, o Mi foi significativo, sendo que somente uma espécie apresentou maior bem-estar dentro, porque os riachos de cabeceira de dentro recebem maior aporte alóctone de vegetação ripária, porém, quando se trata das duas espécies que realizam o elo da teia alimentar aquática com a terrestre ocorreu o contrário. Esses resultados indicam que o fragmento estudado, submetido a pressões antrópicas, apresenta-se incapaz de conservar essa biodiversidade. O interior não tem plano de manejo, o gestor deve elaborá-lo e implementá-lo como um primeiro passo para que a situação possa ser revertida e a efetividade da conservação assegurada nessa área altamente ameaçada, caracterizada por ser um dos remanescentes mais importantes da Mata Atlântica, possuindo relevantes serviços ecossistêmicos oriundos de uma rara floresta úmida de Araucária.(AU)

Análise multivariada aplicada na discriminação de genótipos em caracteres do tempo de cozimento em feijão (Phaseolus vulgaris L) / Multivariate analysis applied to the discrimination of genotypes in cooking timetraitsin commonbean (Phaseolus vulgaris L)

As avaliações rotineiras do caráter tempo de cozimento em feijão (Phaseolus vulgarisL.) podem ser efetuadas de distintas maneiras resultando em diferentes variáveis. Por vez, a análise estatística univariada não considera as interdependêcias entre as variáveis, podendo omitir importantes informações a respeito dos genótipos. Com isso, o objetivo do trabalhofoi dispor uma proposta alternativa para análise do tempo de cozimento em feijão, permitindo a discriminação entre genótipos. O experimento utilizado para esta abordagem foi conduzido em condições de campo na safra agrícola do ano 2017/18em Lages, Santa Catarina, Brasil. Ostratamentos foram compostos por doze genótipos, sendo quatro genitores, estruturados em dois cruzamentos BAF50 x BAF07 e BAF09 x IPR 88 Uirapuru, com suas gerações F2, F3, F8e F9. O delineamento utilizado foi blocos casualizados, com dois blocos e duas observações em cada unidade experimental. Posteriormente a colheita, a variável resposta tempo de cocção dos grãos de feijão foi mensurada com o cozedor Mattson, sendo considerado o tempo de cocção das 13 hastes iniciais. Na análise multivariada, as variáveis tempo de cocção da segunda (TCH2), décima segunda (TCH12) e décima terceira haste (TCH13) foram utilizadas com base em sua significância pelo método de seleção de variáveis passo a passo (stepwise). A análise de variância multivariada demonstrou diferença entre os genótipos (P<0,05). A partir da matriz de dissimilaridade com as distâncias de Mahalanobis e o dendrograma de agrupamento, foi possível verificaras distâncias dos genótipos derivados dos cruzamentos BAF50 x BAF07 e BAF09 x IPR 88 Uirapuru. Comisso, a análise multivariada possibilitou a discriminação dos genótipos, adicionalmente o cruzamento BAF50 x BAF07 demonstrou maiores estimativas de dissimilaridade nas progênies.(AU)

Routine evaluations of cooking time traitin common bean (Phaseolus vulgarisL.) can be performed in different ways resulting in different variables. At the same time, the univariate statistical analysis does not consider the interdependencies between the variables, and may omit important information regarding the genotypes. With this,the objective of this work was to present an alternative proposal foranalysis of the cooking time in common bean, allowing the discrimination between genotypes. The experiment used for this approach was conducted under field conditions in the 2017/18 agricultural season in Lages, Santa Catarina, Brazil. The treatments consisted of twelve genotypes, (fourparents, structured in two crossings BAF50 x BAF07and BAF09 x IPR 88 Uirapuru, with their generations F2, F3, F8and F9). The design used was randomized blocks, with two blocks and two observations in each experimental unit. After the harvest, the response variable cooking time of thegrains was measuredwith a Mattson cooker, considering the cooking time of the 13 initial stems. In the multivariate analysis, the variables cooking time of the second (TCH2), twelfth (TCH12) and thirteenth stem (TCH13) were used based on their significance by the stepwise variable selection method. Multivariate analysis of variance showed differences between genotypes (P<0.05). From the dissimilarity matrix with the Mahalanobis distances and the clustering dendrogram, itwas possible to verify the distances of the genotypes derived from crosses BAF50 x BAF07 and BAF09 x IPR 88 Uirapuru. With that, the multivariate analysis enabled thegenotypes, additionally the crossing BAF50 x BAF07 showed higher estimates of dissimilarity in the progenies.(AU)

Ecomorphology and functional diversity of generalist and specialist bird assemblages in Amazonian whitesand ecosystem habitat patches / Ecomorfologia e diversidade funcional de assembleias de aves generalistas e especialistas em manchas de habitat de ecossistema de areia branca na Amazônia

Birds that inhabit white-sand ecosystems (WSE) in the Amazon are adapted to habitats distributed as isolated patches. These environments occur in sandy soils that are extremely poor in nutrients, have low floristic diversity and support bird assemblages restricted to WSE. We investigated whether bird species specialized in WSE have morphological or ecological traits that distinguish them from generalist birds that share the same habitat but are not restricted to WSE. We collected morphological and ecological data from 22 specialist and 102 generalist bird species from WSE and described their ecomorphological diversity using multivariate analyses and measures of functional diversity. Understory insectivorous species that move alone or in pairs, were the group with the most species among specialist birds from WSE. In contrast, canopy frugivorous species that form mono- or heterospecific groups were more frequent among generalist species. Specialist and generalist birds overlapped extensively in ecomorphological space, with specialists occupying a narrower space compared to generalists. Functional diversity, however, was not different between specialist and generalist species when controlling for the number of species within the communities. Further studies comparing the ecomorphological diversity of bird assemblages of other environments in the Amazon may highlight the ecological pressures leading to the functional diversity of specialist species in WSE observed in this study.(AU)

As aves que habitam os ecossistemas de areia branca (EAB) na Amazônia estão adaptadas a habitats distribuídos em manchas isoladas. Esses ambientes ocorrem em solos arenosos extremamente pobres em nutrientes, possuem baixa diversidade florística e suportam assembleias de aves restritas a EAB. Investigamos se espécies de aves especializadas em EAB possuem características morfológicas ou ecológicas que as distinguem de aves generalistas que compartilham o mesmo habitat, mas não estão restritas a EAB. Coletamos dados morfológicos e ecológicos de 22 espécies de aves especialistas e 102 generalistas de EAB, e descrevemos sua diversidade ecomorfológica usando análises multivariadas e medidas de diversidade funcional. Espécies insetívoras do sub-bosque que se movem solitárias ou em pares foram o grupo com maior número de espécies dentro das aves especialistas da EAB. Em contraste, espécies frugívoras de dossel que formam grupos mono ou heteroespecíficos foram mais frequentes entre as espécies generalistas. Aves especialistas e generalistas sobrepuseram-se extensivamente no espaço ecomorfológico, com especialistas ocupando um espaço mais estreito em comparação com generalistas. A diversidade funcional, no entanto, não foi diferente entre espécies especialistas e generalistas ao controlar o número de espécies dentro das comunidades. Estudos futuros comparando a diversidade ecomorfológica de assembleias de aves de outros ambientes na Amazônia podem destacar as pressões ecológicas que levam à diversidade funcional de espécies especialistas em EAB observadas neste estudo.(AU)

Canonical correlations between high and low heritability wheat traits via mixed models / Correlações canônicas entre caracteres de trigo de alta e baixa herdabilidade via modelos mistos

ABSTRACT: Canonical correlation analysis based on genotypic correlations allows determining the associations between groups of traits and carrying out the direct or indirect selection of superior genotypes. This study investigated the existence of linear and multivariate relationships between high and low heritability traits via canonical correlation analysis based on genotypic correlations. The experiment was conducted at the Professor Diogo Alves de Melo Experimental Field at the Universidade Federal de Viçosa, in Viçosa, MG. 90 wheat cultivars were evaluated under a 9 × 10 alpha-lattice design, with three replications and plots consisting of four rows of three meters spaced at 0.20 meters. Canonical groups were established between spike height and plant height, days for heading, number of spikelets per spike, and number of grains per spike (Group I) and, spike weight, spike grain mass, 100-grain mass, hectoliter weight, and grain yield (Group II). There was dependence between the established groups, which allowed the investigation of the relationships between traits based on their genotypic values. The traits cycle and plant height can be used for indirect selection of genotypes superior in hectoliter weight and grain yield, which are important factors for industries and farmers.

RESUMO: As análises de correlações canônicas baseadas nas correlações genotípicas, permitem determinar associações entre grupos de caracteres e realizar a seleção direta ou indireta de genótipos superiores. Objetivou-se com este trabalho investigar a existência de relações lineares e multivariadas entre caracteres de alta e baixa herdabilidade via análise de correlações canônicas com base nas correlações genotípicas. O experimento foi conduzido no Campo Experimental Professor Diogo Alves de Melo da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa, Minas Gerais. 90 cultivares de trigo foram avaliadas sob o delineamento alpha-lattice 9 × 10, com três repetições e parcelas constituídas por quatro linhas de três metros espaçadas a 0.20 metros. Os grupos canônicos foram estabelecidos entre altura de espiga e planta, dias para o espigamento, número de espiguetas por espiga e número de grãos por espiga (Grupo I) e, peso de espiga, massa de grãos da espiga, massa de 100 grãos, peso hectolitro e produtividade de grãos (Grupo II). Houve dependência entre os grupos estabelecidos, o que permitiu a investigação das relações entre os caracteres com base em seus valores genotípicos. Os caracteres ciclo e altura de plantas podem ser utilizados para a seleção indireta de genótipos superiores em peso hectolitro e produtividade, fatores estes importantes para indústrias e produtores.

Canonical correlations between high and low heritability wheat traits via mixed models / Correlações canônicas entre caracteres de trigo de alta e baixa herdabilidade via modelos mistos

Canonical correlation analysis based on genotypic correlations allows determining the associations between groups of traits and carrying out the direct or indirect selection of superior genotypes. This study investigated the existence of linear and multivariate relationships between high and low heritability traits via canonical correlation analysis based on genotypic correlations. The experiment was conducted at the Professor Diogo Alves de Melo Experimental Field at the Universidade Federal de Viçosa, in Viçosa, MG. 90 wheat cultivars were evaluated under a 9 × 10 alpha-lattice design, with three replications and plots consisting of four rows of three meters spaced at 0.20 meters. Canonical groups were established between spike height and plant height, days for heading, number of spikelets per spike, and number of grains per spike (Group I) and, spike weight, spike grain mass, 100-grain mass, hectoliter weight, and grain yield (Group II). There was dependence between the established groups, which allowed the investigation of the relationships between traits based on their genotypic values. The traits cycle and plant height can be used for indirect selection of genotypes superior in hectoliter weight and grain yield, which are important factors for industries and farmers.

As análises de correlações canônicas baseadas nas correlações genotípicas, permitem determinar associações entre grupos de caracteres e realizar a seleção direta ou indireta de genótipos superiores. Objetivou-se com este trabalho investigar a existência de relações lineares e multivariadas entre caracteres de alta e baixa herdabilidade via análise de correlações canônicas com base nas correlações genotípicas. O experimento foi conduzido no Campo Experimental Professor Diogo Alves de Melo da Universidade Federal de Viçosa, em Viçosa, Minas Gerais. 90 cultivares de trigo foram avaliadas sob o delineamento alpha-lattice 9 × 10, com três repetições e parcelas constituídas por quatro linhas de três metros espaçadas a 0.20 metros. Os grupos canônicos foram estabelecidos entre altura de espiga e planta, dias para o espigamento, número de espiguetas por espiga e número de grãos por espiga (Grupo I) e, peso de espiga, massa de grãos da espiga, massa de 100 grãos, peso hectolitro e produtividade de grãos (Grupo II). Houve dependência entre os grupos estabelecidos, o que permitiu a investigação das relações entre os caracteres com base em seus valores genotípicos. Os caracteres ciclo e altura de plantas podem ser utilizados para a seleção indireta de genótipos superiores em peso hectolitro e produtividade, fatores estes importantes para indústrias e produtores.

Clinical and laboratory indicators predictive of the negative outcome of gastrointestinal emergencies in cattle / Indicadores clínicos e laboratoriais preditivos do desfecho negativo de emergências gastrointestinais em bovino

This study aimed to identify clinical and laboratory variables that could help predict the negative outcome in cattle affected by gastrointestinal emergencies. A retrospective cohort study was carried out using multivariate logistic regression analysis based on data collected from the clinical records of cattle hospitalized at the Garanhuns Bovine Clinic, UFRPE campus. One hundred and twenty-two cattle met the inclusion criteria established for the study. Among the clinical variables, heart rate (HR) and abdominal distension are associated with the outcome in animals with right displaced abomasum (RDA), and anorexia and 10% dehydration in animals with an obstructive intestinal disorder. Among the laboratory variables, plasma fibrinogen (PF) and total leukocyte count were associated with the outcome in animals with RDA, while PF and plasma L-lactate were associated with animals with an obstructive intestinal disorder. HR and the total leukocyte count remained in the final model of the regression adjusted for animals with RDA. On the other hand, plasma L-lactate and PF remained in the final model in the adjusted model for animals with an obstructive intestinal disorder. Cattle with RDA and HR higher than 90 bpm present an increased chance of having a negative outcome whereas cattle with obstructive intestinal disorder and plasma L-lactate higher than 1.84 mmol/L or PF higher than 850 mg/dL have a higher chance of not survive. Therefore, clinical and laboratory variables such as HR, fibrinogen, and plasma L-lactate are useful to predict the negative outcome in cattle with gastrointestinal emergencies, especially RDA and obstructive intestinal disorders.(AU)

Este estudo teve como objetivo identificar variáveis clínicas e laboratoriais que pudessem ajudar a predizer o desfecho negativo em bovinos acometidos por emergências gastrointestinais. Foi realizado um estudo de coorte retrospectivo por meio de análise de regressão logística multivariada com base em dados coletados dos prontuários de bovinos internados na Clínica de Bovinos de Garanhuns, campus da UFRPE. Cento e vinte e dois bovinos atenderam aos critérios de inclusão estabelecidos para o estudo. Dentre as variáveis clínicas, a frequência cardíaca e a distensão abdominal estão associadas ao desfecho em animais com deslocamento de abomaso à direita (DAD), e anorexia e 10% de desidratação em animais com distúrbio intestinal obstrutivo. Entre as variáveis laboratoriais, o fibrinogênio plasmáticao (FP) e a contagem total de leucócitos foram associados ao desfecho em animais com DAD, enquanto o FP e o L-lactato plasmático foram associados a animais com distúrbio intestinal obstrutivo. A frequência cardíaca (FC) e a contagem total de leucócitos permaneceram no modelo final da regressão ajustada para animais com DAD. Por outro lado, o L-lactato plasmático e o FP permaneceram no modelo final ajustado para animais com distúrbio intestinal obstrutivo. Bovinos com DAD e FC maior que 90 bpm apresentam maior chance de ter um desfecho negativo, enquanto bovinos com distúrbio intestinal obstrutivo e L-lactato plasmático maior que 1,84 mmol/L ou FP maior que 850 mg/dL têm maior chance de não sobreviver. Portanto, variáveis clínicas e laboratoriais como FC, FP e L-lactato plasmático são úteis para predizer o desfecho negativo em bovinos com doenças emergências gastrointestinais, especialmente DAD e distúrbios intestinais obstrutivos.(AU)

Integrative analysis in toxicological assessment of the insecticide Malathion in Allium cepa L. system

Abstract For many centuries human populations have been suffering and trying to fight with disease-bearing mosquitoes. Emerging and reemerging diseases such as Dengue, Zika, and Chikungunya affect billions of people around the world and recently has been appealing to control with chemical pesticides. Malathion (MT) is one of the main pesticides used against mosquitoes, the vectors of these diseases. This study aimed to assess cytotoxicity and mutagenicity of the malathion for the bioindicator Allium cepa L. using a multivariate and integrative approach. Moreover, an appendix table was compiled with all available literature of insecticides assessed by the Allium cepa system to support our discussion. Exposures during 48h to 0.5 mg mL-1 and 1.0 mg mL-1 MT were compared to the negative control (distilled water) and positive control (MMS solution at 10 mg L-1). The presence of chromosomal aberrations, micronuclei frequency, and mitotic index abnormalities was evaluated. Anaphase bridges were the alterations with higher incidence and presented a significantly elevated rate in the concentration of 0.5 mg mL-1, including when compared to the positive control. The integrative discriminant analysis summarizes that MT in assessed concentrations presented effects like the positive control, corroborating its potential of toxicity to DNA. Therefore, it is concluded that MT in its pure composition and in realistic concentrations used, has genotoxic potential in the biological assessment of A. cepa cells. The multivariate integrative analysis was fundamental to show a whole response of all data, providing a global view of the effect of MT on DNA.

Resumo Por muitos séculos, as populações humanas sofrem e tentam combater os mosquitos transmissores de doenças. Doenças emergentes e reemergentes como Dengue, Zika e Chikungunya afetam bilhões de pessoas em todo o mundo e, recentemente, vem apelando ao controle com pesticidas químicos. O Malation (MT) é um dos principais pesticidas usados contra mosquitos, vetores dessas doenças. O objetivo deste estudo foi avaliar a citotoxicidade e a mutagenicidade do MT para o bioindicador Allium cepa L. usando uma abordagem multivariada e integrativa. Além disso, uma tabela suplementar foi compilada com toda a literatura disponível de inseticidas avaliada pelo sistema Allium cepa para apoiar nossa discussão. Exposições ao MT durante 48h a 0,5 mg mL-1 e 1,0 mg mL-1 foram comparadas a um controle negativo (água destilada) e um controle positivo (10 mg L-1 de MMS). Foram avaliadas a presença de aberrações cromossômicas, frequência de micronúcleos e anormalidades no índice mitótico. As pontes anafásicas foram as alterações com maior incidência e apresentaram uma taxa significativamente elevada na concentração de 0,5 mg mL-1, inclusive quando comparadas ao controle positivo. A análise discriminante integrativa resume que o MT nas concentrações avaliadas apresentou efeitos semelhantes ao controle positivo, corroborando seu potencial de toxicidade para o DNA. Portanto, conclui-se que o MT, em sua composição pura e nas concentrações realistas utilizadas, possui potencial genotóxico na avaliação biológica de células de A. cepa. A análise integrativa multivariada foi fundamental para mostrar uma resposta completa de todos os dados, fornecendo uma visão global do efeito da MT no DNA.

Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): an Invasive species in Central Punjab Pakistan

Abstract Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.

Resumo Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos dágua do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.

Estimation of cropland prices in Rio Grande do Sul by multiple linear regression and principal component analysis / Estimação do preço das lavouras no Rio Grande do Sul por meio de regressão linear múltipla e análise de componentes principais

ABSTRACT: This study aimed to price croplands in Rio Grande do Sul State (southern Brazil) and point which variables had the most significant impact on prices. The main purpose was achieved using multiple linear regression and principal component analysis. The variables used in this study were planted area, production, price, and yield of the commodities soybean, wheat, and corn. The period under analysis was from January 1994 to December 2017 (biannual observations). Multiple linear regression showed that five variables contributed to land pricing, being three related to soybean and two to wheat. Multivariate analysis grouped the investigated variables into clusters and indicated their influence, in addition to providing information on land prices and reducing variable dimensionality from fourteen original variables to three principal components to be analyzed. The two analyses complemented each other so that the croplands' price was explained by three variables, in which two corroborated in constructing the pricing model for croplands.

RESUMO: Este estudo teve como objetivo a precificação de terra para lavouras no Rio Grande do Sul e apresentar quais variáveis possuem maior impacto no preço. O objetivo foi alcançado por meio da aplicação da análise de regressão linear múltipla e de componentes principais. Variáveis relacionadas às commodities soja, trigo e milho, como a área plantada, produção, cotação e rendimento, formaram o banco amostral para as duas metodologias, compreendendo o período de janeiro de 1994 a dezembro de 2017, em observações bianuais. A regressão linear múltipla mostrou que três variáveis relacionadas à soja e duas ao trigo contribuem na precificação das terras. A análise multivariada agrupou as variáveis investigadas, indicando a influência entre as mesmas, fornecendo informações sobre o preço de terras e diminuindo a dimensionalidade do problema de 14 variáveis originais para três componentes a serem analisados. As duas análises se complementaram de forma que o preço de terras foi explicado por três variáveis e duas corroboraram na construção do modelo de precificação das lavouras.

Morphological diversity among Brazilian Capsicum peppers / Diversidade morfológica entre pimentas Capsicum brasileiras

ABSTRACT: This research aimed to morphologically characterize and estimate the genetic diversity of 21 Capsicum accessions belonging to the Capsicum Germplasm Active Bank at the Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI) using uni- and multivariate analysis. The experiment was carried out in a greenhouse, by completely randomized experimental design with four repetitions, with one plant per plot. Analysis of variance (ANOVA) and the comparison of means for seven quantitative variables were performed, followed by clustering the averages by the Scott-Knott test (P < 0.05). The analysis of the seven quantitative and thirteen qualitative descriptors was estimated based on the Gower distance. Later, it was performed the principal component analysis and the UPGMA hierarchical cluster method. Results characterized and identified a wide intra- and interspecific genetic variability related to the fruit size, colors, and shapes among the Brazilian Capsicum genotypes belonging to the BAGC-UFPI. The descriptors used in this research were effective in the discrimination of the pepper accessions, especially the closely related C. frutescens and C. chinense species.

RESUMO: Este trabalho teve como objetivo caracterizar e estimar a diversidade genética em 21 acessos de Capsicum pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI), por análises uni e multivariadas. O experimento foi conduzido em telado, utilizando-se o delineamento inteiramente ao acaso, com quatro repetições, sendo uma planta por parcela. Realizou-se análise de variância (ANOVA) e comparação da média para as setes variáveis quantitativas, seguidas do agrupamentos de médias pelo teste Scott-Knott (P < 0,05). A análise dos sete descritores quantitativos e treze qualitativos foi estimada com base na distância de Gower. Posteriormente, foi realizada a análise de componentes principais e o método de agrupamento hierárquico UPGMA. Os resultados caracterizaram e identificaram uma ampla variabilidade genética intra e interespecífica relacionada ao tamanho, cor e formato dos frutos entre os genótipos brasileiros de Capsicum do banco de germoplasma de pimentas BAGC-UFPI. Os descritores utilizados foram eficientes na discriminação dos acessos de pimentas, especialmente para espécies proximamente relacionadas C. frutescens e C. chinense.

Estimation of cropland prices in Rio Grande do Sul by multiple linear regression and principal component analysis / Estimação do preço das lavouras no Rio Grande do Sul por meio de regressão linear múltipla e análise de componentes principais

This study aimed to price croplands in Rio Grande do Sul State (southern Brazil) and point which variables had the most significant impact on prices. The main purpose was achieved using multiple linear regression and principal component analysis. The variables used in this study were planted area, production, price, and yield of the commodities soybean, wheat, and corn. The period under analysis was from January 1994 to December 2017 (biannual observations). Multiple linear regression showed that five variables contributed to land pricing, being three related to soybean and two to wheat. Multivariate analysis grouped the investigated variables into clusters and indicated their influence, in addition to providing information on land prices and reducing variable dimensionality from fourteen original variables to three principal components to be analyzed. The two analyses complemented each other so that the croplands' price was explained by three variables, in which two corroborated in constructing the pricing model for croplands.

Este estudo teve como objetivo a precificação de terra para lavouras no Rio Grande do Sul e apresentar quais variáveis possuem maior impacto no preço. O objetivo foi alcançado por meio da aplicação da análise de regressão linear múltipla e de componentes principais. Variáveis relacionadas às commodities soja, trigo e milho, como a área plantada, produção, cotação e rendimento, formaram o banco amostral para as duas metodologias, compreendendo o período de janeiro de 1994 a dezembro de 2017, em observações bianuais. A regressão linear múltipla mostrou que três variáveis relacionadas à soja e duas ao trigo contribuem na precificação das terras. A análise multivariada agrupou as variáveis investigadas, indicando a influência entre as mesmas, fornecendo informações sobre o preço de terras e diminuindo a dimensionalidade do problema de 14 variáveis originais para três componentes a serem analisados. As duas análises se complementaram de forma que o preço de terras foi explicado por três variáveis e duas corroboraram na construção do modelo de precificação das lavouras.

Quality of refrigerated raw milk according to the bulk transport conditions

Technical regulations that determine milk quality standards in Brazil establish the minimum criteria that the processing industry's raw material must present. These rules can challenge the logistics sector (transport) to maintain adequate milk conservation levels. We aimed to evaluate the influence of bulk transport and storage conditions on refrigerated raw milk quality. The experiment was carried out in a dairy industry in Santa Catarina State. Information and samples of refrigerated raw milk were collected from dairy farms, from isothermal compartments of milk trucks, and from the industry's storage silo. These samples were submitted to microbiological analysis, somatic cell count(SCC), and physicochemical analysis. The results were evaluated by ANOVA and multivariate analysis (factor analysis). The transport of raw milk in bulk and the transfer of raw material to the industrial silo worsened the milk's microbiological quality (p < 0.0001) for standard plate count (SPC) and psychrotrophic microorganism count(PMC), without affecting, the physicochemical characteristics of the milk (p > 0.05). Poor hygienic conditions in milk storage rooms, in the refrigeration bulk tanks of the dairy farms, and during the transport, as well as the transport on longer routes, were related to higher SPC and psychrotrophic count while receiving milk by the dairy industry with higher temperatures was only associated with higher SPC.(AU)

Using canonical correlation analysis to understand the rumen biohydrogenation patterns of linoleic and alpha-linolenic acids in the rumen fluid of bovines

The objective of this study was to determine the multivariate relationship among linoleic acid, alpha-linolenic acid, and their main rumen biohydrogenation (BH) intermediates and products in bovine rumen fluid using canonical correlation analysis (CCA). A dataset consisting of 1177 observations generated by 107 in vitro rumen incubation systems of pure and mixed linoleic acid (18:2-c9, c12) and alpha-linolenic acid (18:3-c9, c12, c15) was gathered. Two canonical variates were defined: A: composed of the nine main BH intermediates and products (18:2-c9, t11; 18:2-t11, c15; 18:1-t11; 18:1-t9; 18:1-t6; 18:1-c11; 18:1-c6; 18:1-c9; 18:0) of 18:2-c9, c12 and 18:3-c9, c12, c15 and B: composed of 18:2-c9, c12 and 18:3-c9, c12, c15. Two canonical functions between A and B with significant canonical correlations (R1=0.990 and R2=0.738; p <0.01) were obtained. However, only the first function was selected for CCA. Exploration of canonical loadings for first function, revealed the following quantitative significance (absolute value) order for fatty acids (FA) within their respective canonical variates: A: 18:0(0.958)>18:1-t9(0.837)>18:1-c11(0.835)>18:1-c6(0.824)>18:1-t11(0.747)>18:1-c9(0.738)>18:1-t6(0.415)>18:2-t11, c15(0.387)> 18:2-c9, t11(0.239); B: 18:2-c9, c12(0.667)>18:3-c9, c12, c15(0.488). The CCA showed that 18:2-c9, c12 has a greater contribution than that of 18:3-c9, c12, c15 on the production of the aforementioned BH intermediates, in which 18:0, as well as the groups of 18:1 cis and trans-FA were mainly affected.(AU)

Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): an invasive species in Central Punjab Pakistan / Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): uma espécie invasora no centro de Punjab, Paquistão

Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.

Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos d’água do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.

Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): an invasive species in Central Punjab Pakistan / Molecular Phylogenetics of Physa acuta (Pulmonata: Basommatophora): uma espécie invasora no centro de Punjab, Paquistão

Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.(AU)

Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos dágua do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.(AU)

Path analysis and near-infrared spectroscopy in canola crop / Análise de trilha e espectroscopia no infravermelho próximo na cultura da canola

ABSTRACT: This study measured the effect of the association between agronomic traits related to the yield of canola grains grown at different sowing dates through path analysis. Another objective was to obtain a method to predict the oil content in the grains, fitting a multivariate model through near-infrared (NIR) spectroscopy analysis. The experiment was conducted in the field using a randomized block design in plots subdivided by time, with four plots (sowing dates), six subplots (canola hybrids), and four replicates. In each hybrid, phenological observations were performed, and the grain yield was determined. The data were subjected to analysis of variance in the R environment using the F test at 5% probability. The oil content in the grains was determined by the traditional chemical method, and based on the NIR spectral signature of the grain samples, partial least squares regression (PLS-R) was established to estimate the oil content in the canola grains. The sowing dates influenced the production components and oil content of the grains of all hybrids. The trait number of grains in five plants (0.6857) and their height (0.4943) had greater estimates of positive correlations with grain yield, as well as higher values of positive direct effects on yield (0.2494 and 0.1595, respectively). The NIR technique combined with PLS-R was able to predict the oil content in the grains, resulting in good predictive models (R2 of 0.86 and root mean square error (RMSE) of 1.56 in external validation).

RESUMO: Objetivou-se mensurar o efeito da associação entre caracteres agronômicos relacionados à produtividade de grãos de canola cultivada em diferentes épocas de semeadura, através da análise de trilha. Assim como também objetivou-se obter um método para predizer o teor de óleo nos grãos, ajustando um modelo multivariado através da análise por espectroscopia na região do infravermelho próximo. O experimento foi conduzido em campo, utilizando-se o delineamento de blocos ao acaso, em parcelas subdivididas no tempo, sendo quatro parcelas (épocas de semeadura) e seis subparcelas (híbridos de canola), com quatro repetições. Em cada híbrido foram realizadas observações fenológicas e determinada a produtividade de grãos. Os dados foram submetidos à análise de variância em ambiente R pelo teste F, a cinco de probabilidade. O teor de óleo nos grãos foi determinado pelo método químico tradicional, e com base na assinatura espectral no infravermelho próximo de amostras dos grãos foi estabelecida regressão dos mínimos quadrados parciais (PLS-R) para estimar o teor de óleo nos grãos de canola. As épocas de semeadura influenciaram os componentes de produção e o teor de óleo dos grãos de todos híbridos. Os caracteres número de grãos em cinco plantas (0,6857) e altura (0,4943) apresentaram maiores estimativas de correlação positiva com a produtividade de grãos, assim como os maiores valores de efeito direto positivo sobre a produtividade, 0,2494 e 0,1595 respectivamente. Entretanto, o ciclo total (-0,7848), juntamente com dias em florescimento (-0,4520) apresentou correlação significativa negativa com a produtividade. A técnica NIR associada à PLS-R foi capaz de predizer o teor de óleo nos grãos, resultando em bons modelos preditivos (R2 de 0,86 e RMSE de 1,56 na validação externa) que podem ser usados com sucesso na análise da qualidade das amostras após colheita e nos programas de melhoramento genético.

Natural Growth Promoters Replacing Traditional Growth Promoters in Diets for Light Replacement Pullets: A Systematic Approach

The effect of using natural growth promoters (NGP) to replace traditional antimicrobials on performance, biometry of digestive and reproductive organs, sexual maturity and bone characteristics of replacement pullets was evaluated; and the relationship between these variables according to the diets was verified. Eight-week-old birds were randomly assigned to a completely randomized design and fed different diets: negative control (without growth promoters); positive control - conventional growth promoter; organic acids (OA); symbiotic (S); essential oil (EO); OA + S; and EO + S. The performance, relative weight of digestive and reproductive organs and length intestines, height and crest length, sternum length, bone quality and sexual maturity of birds were similar (p>0.05) between treatments. The heat map combined with cluster analysis showed a uniform static pattern with the formation of three horizontal groups formed by the treatments: 1) negative control, S and OA + S; 2) positive control and OE and 3) OA and OE + S. A null relationship between the treatments and the variables under study was observed. The principal components analysis revealed an association of variables in three components with 60.55% of variation. NGP can replace traditional promoters, as they do not interfere with performance, biometrics or sexual maturity. Height and length are predictive variables for the development of reproductive organs, especially the oviduct. A similarity was identified through multivariate techniques between symbiotic and organic + symbiotic acids; positive control and essential oils; and organic and symbiotic acids + essential oils.(AU)

Genetic divergence of cassava genotypes from Petrolina

This study aimed to evaluate cassava genotypes to identify the ones with the best nutritional values for ruminant diets. Nine genotypes were used: Amansa Burro (BGM 549), Aramaris (BGM 116), Brasília, Cambadinha (BRS Guaíra), Curvelinha, Engana Ladrão (BGM 1269), Trouxinha (BGM 1468), BRS Gema de Ovo, and BRS Dourada. A completely randomized block experimental design with nine treatments (genotypes) and three blocks (replicates) were employed. The roots were analyzed for dry matter production (DMP) in tonnes per hectare, crude protein (CP), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), starch, and in vitro dry matter digestibility (IVDMD). The multivariate analysis was carried out using Ward's hierarchical agglomerative clustering based on Mahalanobis distance. The groups formed were evaluated by Scott-Knott test. The group formed by genotype Engana Ladrão was chosen as the best one for having the highest DMP t ha-1 and IVDMD values and the lowest NDF and ADF contents.(AU)

Morphological diversity among Brazilian Capsicum peppers / Diversidade morfológica entre pimentas Capsicum brasileiras

This research aimed to morphologically characterize and estimate the genetic diversity of 21 Capsicum accessions belonging to the Capsicum Germplasm Active Bank at the Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI) using uni- and multivariate analysis. The experiment was carried out in a greenhouse, by completely randomized experimental design with four repetitions, with one plant per plot. Analysis of variance (ANOVA) and the comparison of means for seven quantitative variables were performed, followed by clustering the averages by the Scott-Knott test (P < 0.05). The analysis of the seven quantitative and thirteen qualitative descriptors was estimated based on the Gower distance. Later, it was performed the principal component analysis and the UPGMA hierarchical cluster method. Results characterized and identified a wide intra- and interspecific genetic variability related to the fruit size, colors, and shapes among the Brazilian Capsicum genotypes belonging to the BAGC-UFPI. The descriptors used in this research were effective in the discrimination of the pepper accessions, especially the closely related C. frutescens and C. chinense species.

Este trabalho teve como objetivo caracterizar e estimar a diversidade genética em 21 acessos de Capsicum pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma da Universidade Federal do Piauí (BAGC-UFPI), por análises uni e multivariadas. O experimento foi conduzido em telado, utilizando-se o delineamento inteiramente ao acaso, com quatro repetições, sendo uma planta por parcela. Realizou-se análise de variância (ANOVA) e comparação da média para as setes variáveis quantitativas, seguidas do agrupamentos de médias pelo teste Scott-Knott (P < 0,05). A análise dos sete descritores quantitativos e treze qualitativos foi estimada com base na distância de Gower. Posteriormente, foi realizada a análise de componentes principais e o método de agrupamento hierárquico UPGMA. Os resultados caracterizaram e identificaram uma ampla variabilidade genética intra e interespecífica relacionada ao tamanho, cor e formato dos frutos entre os genótipos brasileiros de Capsicum do banco de germoplasma de pimentas BAGC-UFPI. Os descritores utilizados foram eficientes na discriminação dos acessos de pimentas, especialmente para espécies proximamente relacionadas C. frutescens e C. chinense.

Morada Nova lambs' meat production potential description through morphometric evaluation / Descrição do potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio da avaliação morfométrica

Morada Nova breed has a low effective herd, and its white variety is in risk of extinction. The selection of individuals based on breed standard without correlation with productive aptitude is predominant today. We believe that the best way to rescue this valuable genetic resource is to describe its productive potential for commercial use. Thus, this study described the meat production potential of Morada Nova lambs through morphological and zoometric data, performance and carcass characteristics. Twenty-four non-castrated male lambs from two genetic groups were used: Morada Nova red (MNR) and crossbreed Morada Nova (red x Morada Nova white-MNF1) distributed in a completely randomized design. Univariate and multivariate analysis were used. The yields of commercial cuts and the physicochemical characteristics and qualitative measurements of the carcass were similar between the genetic groups. Seven of the 28 characteristics of the carcass were greater in MNF1 lambs. The chest height, rump height and anamorphosis index showed to be important variables in the choice of MN lambs with meat production potential. Based on factor and hierarchical cluster analysis, the Morada Nova beef morphometric index (MNBMI) was created. Both of groups have high thoracic development, ability to produce meat, weight gain, feeding efficiency and breathing capacity, infusing greater rusticity and adaptability; however, the application and validation of the developed index showed superiority for meat production in the crossed lambs. Thus, the MNF1 lambs are a sustainable option for sheep production in drylands.

A raça Morada Nova possui um baixo rebanho efetivo, e sua variedade branca está em risco de extinção. A seleção de indivíduos com base no padrão racial sem correlação com a aptidão produtiva é predominante até hoje. Acreditamos que a melhor forma de resgatar esse valioso recurso genético é descrever seu potencial produtivo para uso comercial. Assim, este estudo teve como objetivo descrever o potencial de produção de carne de cordeiros Morada Nova por meio de dados morfológicos e zoométricos, desempenho e características de carcaça. Foram utilizados 24 cordeiros machos não castrados de dois grupos genéticos: Morada Nova Vermelho (MNV) e mestiços Morada Nova (vermelho x Morada Nova branco-MNF1) distribuídos em delineamento inteiramente casualizado. Análises univariadas e multivariadas foram utilizadas. Os rendimentos dos cortes comerciais e as características físico-químicas e medidas qualitativas da carcaça foram semelhantes entre os grupos genéticos. Sete, das 28 características da carcaça, foram maiores nos cordeiros MNF1. A altura do peito, altura da garupa e índice de anamorfose mostraram-se variáveis ​​importantes na escolha de cordeiros MN com potencial de produção de carne. Com base na análise fatorial e hierárquica de agrupamento, foi elaborado o índice morfométrico da carne da raça Morada Nova (IMCMN). Ambos os grupos apresentam alto desenvolvimento torácico, capacidade de produção de carne, ganho de peso, eficiência alimentar e capacidade respiratória, infundindo maior rusticidade e adaptabilidade, porém, a aplicação e validação do índice desenvolvido mostrou superioridade para produção de carne nos cordeiros cruzados. Assim, os cordeiros MNF1 são uma opção sustentável para a produção ovina em terras áridas.