Diversity of avian species, their ecosystems and climate conditions in two zones of High Atlas (central Morocco) for ecotouristic purposes

The analysis of avian diversity and their natural ecosystems at a regional scale is the first step to understanding and classifying a specific region's ecological importance and, therefore, adopting sustainable economic activities and implementing suitable conservation measures. This study investigated the avian richness and natural ecosystems in Eastern and central High Atlas between 2015 and 2021. Transects and point-count methods were used to identify and estimate populations of birds and to delimit the nature of ecosystems. A total of 175 bird species among resident-breeders, migrantbreeders, migrant-winterers, and accidental-visitors were documented. These birds belong to 19 orders and are grouped into 51 families. Among recorded birds, 20 species were categorized as species of ectouristic interest due to their roles in birdwatching, hunting, racing sports, and trade activities. These species were observed in natural and human-made ecosystems, with the majority in wetlands. The abundance of a wide range of ecosystems and various bioclimatic stages is suggested to be behind the avian richness of these mountainous areas. Finally, these natural landscapes and their avian richness could be used for ecotouristic purposes. Visitors could profit from the view of landscapes and observation of the most iconic and rare animal species, which is suggested to increase the income for local populations and ensure the sustainable use of natural resources.

Fish functional trophic groups in headwater karst streams from the Upper Paraguay River basin

Data obtained by direct observation of organisms in their natural habitats can provide valuable contributions regarding intra- and inter-specific interactions, as well as spatial distribution and trophic relationships. However, relatively few such data are available for the Neotropical ichthyofauna relative to the great species diversity of this region. We present data on the ichthyofauna in karst environments of the Serra da Bodoquena, Upper Paraguay River basin regarding their categorization into functional trophic groups. We used direct observations that focused on the most frequent feeding tactics and their spatial (vertical and horizontal) distribution in the channel. We observed 83 fish species in 17 functional trophic groups. The greatest species richness was concentrated in the Characidae and Loricariidae in the categories Diurnal Backwater Drift Feeders and Grazers, respectively. Regarding horizontal depth stratification, we found a positive relationship between the association of small fish with the shallow marginal habitats. This work represents a contribution to a region known for its high tourist potential and to the important diversity of the entire ichthyofauna of the Upper Paraguay basin region that requires proper conservation strategies for sustaining these species.(AU)

Dados obtidos pela observação direta dos organismos em seus hábitats naturais podem fornecer valiosas contribuições com relação a interações intra e inter-específicas, além de distribuição espacial e relações tróficas. Entretanto, relativamente poucos dados estão disponíveis no que diz respeito à ictiofauna neotropical dada à grande diversidade dessa região. Apresentamos dados sobre a ictiofauna em ambientes cársticos da Serra da Bodoquena, bacia do alto rio Paraguai e a categorização das mesmas em grupos tróficos funcionais baseada em observações diretas relacionadas às táticas alimentares mais frequentes e à sua distribuição espacial (vertical e horizontal) no canal. Assim sendo, observamos 83 espécies de peixes alocadas em 17 grupos tróficos funcionais. A maior riqueza de espécies concentrou-se nas famílias Characidae e Loricariidae, abrangendo as categorias Catadores Diurnos de Itens Arrastados pela Corrente e Pastadores, respectivamente. Com relação à estratificação horizontal, encontramos a relação positiva entre a associação de peixes de pequeno porte com relação aos hábitats marginais. Esse trabalho representa uma contribuição a uma região conhecida pelo seu alto potencial turístico e à importante diversidade da ictiofauna da região da bacia do alto Paraguai que requer estratégias de conservação adequadas para sustentar essas espécies.(AU)

Cave-dwelling gastropods (Mollusca: Gastropoda) of Brazil, state of the art and conservation: a critical review

In 2022, Salvador and co-authors published an up-to-date list of gastropod species recorded from Brazilian caves. That list included 18 species (15 land and three freshwater species) that were considered by the authors to be restricted to caves (troglobitic). In this contribution we argue that only six of the species listed by them as truly troglobites can be classified in that category. We disagree with some characteristics listed by Salvador and co-authors to diagnose the species they classify as cave-restricted and argue that those species do not have truly troglomorphic traits (characteristic of subterranean habitats). Since the Brazilian legislation considers the degree of association with caves as a decisive attribute to preserve them, it is important to clarify the characteristics are sufficient and necessary for a species to be classified as cave-dependent.

The role of habitat complexity in the survival rates of migratory (native) and sedentary (non-native) species of fish larvae

The increasing losses of original features of many riverine environments and the consequent decline of native aquatic species are now a widely recognized problem. The main river basins of South America have been undergoing constant changes in their communities of fish, with native migratory species disappearing and the rising of sedentary exotic ones. However, few studies report experiments that qualify and/or quantify this correlation. Three experiments were conducted to evaluate the predation mortality of two species of fish larvae (native and non-native) regarding their habitat features. The hypothesis that natural features of habitat (aquatic vegetation and water turbidity) controls the survival rates of fish larvae was tested. The experiments highlight the importance of community structure on population dynamics. The native fish larvae showed to be more adapted than the non-native to using the aquatic plants for refuge. The habitat complexity can be closely related to the persistence of native migratory fish species.(AU)

Temporal variation in composition, abundance and biomass of the fish fauna after impact on subtropical transitional water

Transitional waters are characterized by large variations in salinity, temperature, turbidity, among other factors, such as tidal cycle, wind action and rainfall, that are constantly changing over time. The distribution of biota in these environments is regulated by these natural variations and also by human activities, such as pollution, overexploitation of resources, acceleration of urbanization, suppression of habitats and changes in hydrological dynamics. The objective of this study was to analyze the temporal dynamics of the fish fauna of the Saco dos Limões Cove, state of Santa Catarina, Brazil, after the construction of a highway. Fish community was evaluated over five years by annual and monthly variation in species richness, abundance and biomass. A total of 17,993 individuals were collected, distributed in 33 families, 59 genera and 79 species. The evaluated years were similar to each other in species composition. Community descriptors varied over time but did not show seasonal trends. In all years, abundance was higher than biomass, indicating both the disturbance and the ecosystem function as a nursery in the studied area. This was corroborated by the large number of juveniles of dominant species (Genidens genidens, Eucinostomus gula and Eucinostomus argenteus).(AU)

Feral dogs in Chitral gol national park, Pakistan: a potential threat to the future of threatened Kashmir Markhor (Capra falconeri cashmiriensis) / Cães ferozes no parque nacional Chitral gol, Paquistão: uma ameaça potencial para o futuro do Markhor da Caxemira ameaçado (Capra falconeri cashmiriensis)

Abstract Feral dogs are well-organized hunters of ungulates in many parts of the world, causing great damage to wildlife populations and ultimately to the ecosystem. In Pakistan, the impacts of feral dogs on the wildlife have not been documented yet. In a period of fifteen years (2006-2020), feral dogs have killed hundreds of threatened markhor in Chitral gol national park (CGNP), Pakistan. Despite direct predation other impacts including disturbance and competition with other natural predators, could compromise conservation and management efforts. The population of feral dogs seems to have been increased with the increase of dumping sites by communities. Our findings suggest that there are pressing needs of controlling the feral dogs population and eradicating them from the core zone of CGNP and surrounding buffer communities. Conventional culling of dogs should be coupled with modern techniques like castration and sterilization. Communities should be educated regarding the clean environment, proper disposal of home wastes and, biodiversity conservation.

Resumo Os cães ferozes são caçadores bem organizados de ungulados em muitas partes do mundo, causando grandes danos à população de animais selvagens e, em última instância, ao ecossistema. No Paquistão, os impactos dos cães selvagens na vida selvagem ainda não foram documentados. Em um período de 15 anos (2006-2020), cães selvagens mataram centenas de markhor ameaçados no parque nacional Chitral gol (CGNP), Paquistão. Apesar da predação direta, outros impactos, incluindo distúrbios e competições com outros predadores naturais podem comprometer os esforços de conservação e manejo. A população de cães selvagens parece ter aumentado com o aumento dos locais de despejo pelas comunidades. Nossas descobertas sugerem que há necessidades urgentes para controlar a população de cães selvagens e erradicá-los da zona central do CGNP e das comunidades-tampão vizinhas. O abate convencional de cães deve ser combinado com técnicas modernas como castração e esterilização. As comunidades devem ser educadas sobre o meio ambiente limpo, o descarte adequado de resíduos domésticos e a conservação da biodiversidade.

The influence of landscape at multiple spatial scales of the river basins at the Eastern Amazon fish assemblage

The Amazon River basins present distinct natural and anthropogenic characteristics that influence the structure of stream habitats and their associated biota. The influence of these characteristics can be evaluated through different spatial scales. We aimed to assess the influence (with and without the effect of spatial-geographical factors) of local, macroscale, and land-use variables in the structure of stream fish assemblages of Amazonian catchments with different deforestation levels. A partial redundancy analysis and a reduced metrics model were used to assess these influences. With geographic-spatial effects, we verified that the macroscale and local variables explained the variation in fish composition, and, without the effects, land use also explained the variation in this composition. In the forested catchments, the biota was associated with streams with natural characteristics (e.g., leaf banks). In the deforested catchments, it was associated with land use, sandy catchments with higher soil density (higher capacity of degradation), and less complex streams (fewer leaf banks, more sand). The associated fish have life features linked to these characteristics (e.g., Gymnorhamphichthys rondoni associated with sand). This configuration seems to be a result of both the impact of land use in the catchment (i.e., increased erosion, increased sedimentation) and the naturally sandy constitution of the catchment as well, reflecting the sandy substrate.

A Amazônia apresenta bacias hidrográficas com características naturais e antrópicas que estão presentes em distintas escalas espaciais da paisagem e que influenciam a estrutura do habitat de riachos e sua biota associada. Nosso objetivo foi verificar a influência (com e sem o efeito de fatores espaciais e geográficos) de variáveis locais, de macroescala e uso da terra na estrutura de assembleias de peixes de riachos de microbacias amazônicas com diferentes níveis de desmatamento. A análise de redundância parcial e modelo reduzido de métricas foram realizadas para verificar essas influências. Com os efeitos geográfico-espaciais, verificou-se que as variáveis de macroescala e locais explicavam a variação da composição dos peixes, e sem os efeitos, os usos da terra também explicaram. Nas microbacias florestadas, a biota foi associada a riachos com características naturais (e.g., bancos de folhas). Nas microbacias desmatadas, foi associada a usos da terra, a microbacias arenosas com maior densidade do solo (maior capacidade de degradação) e a riachos menos complexos (menos bancos de folhas e mais areia). Os peixes associados a essas microbacias desmatadas possuem aspectos de vida atrelados a essas características (e.g., Gymnorhamphichthys rondoni associado a areia). Essa configuração parece ser um reflexo tanto do impacto do uso da terra na microbacia (i.e., maior erosão, maior sedimentação) quanto da própria constituição natural arenosa da microbacia, refletindo o substrato arenoso.

Payment for ecosystem services (PES): a holistic tool for sustainable forest management-a case study from Pakistan / Pagamento por serviços ecossistêmicos (PES): uma ferramenta holística para o manejo florestal sustentável: um estudo de caso do Paquistão

Abstract Economic valuation of ecosystem services is a new concept in forest management. Economic valuation provides basis for payment for ecosystem services (PES). Therefore, objective of this study was to evaluate eco-tourism and carbon stock services of the Maindam valley, District Swat, Pakistan. For the carbon stock calculation, a sample size of 155 plots of 0.1 hectare (Ha) was taken using preliminary survey at 95% confidence interval and 10% allowable error. The data for tourism services was collected from owners of all the hotels, 100 tourists and key informants of the area at 10% sampling intensity on pretested questionnaire for twenty years period (1997-2017). Results showed that Miandam valley has carbon stock worth US$ 16,306,000 while the value of eco-tourism was US$ 1,578,458 on annual basis. The results also showed that trend of tourism has drastically declined after the 9/11 incident for foreigners and locals and the situation was further deteriorated during the era of Talibanization or militancy from 2008-2011. This study recommends implementation of PES strategy at the rate of 5%, thus a total of US$ 78,922 can be earned from eco-tourism and carbon crediting in the study area annually, which could play important role in sustainable forest management.

Resumo A valoração econômica dos serviços ecossistêmicos é um novo conceito no manejo florestal. A avaliação econômica fornece base para o pagamento por serviços ecossistêmicos (PES). Portanto, o objetivo deste estudo foi avaliar o ecoturismo e os serviços de estoque de carbono do vale de Miandam, distrito Swat, Paquistão. Para o cálculo do estoque de carbono, um tamanho de amostra de 155 parcelas de 0,1 hectare (ha) foi tirado, usando pesquisa preliminar com intervalo de confiança de 95% e erro admissível de 10%. Os dados para serviços de turismo foram coletados de proprietários de todos os hotéis, 100 turistas e informantes-chave da área em 10% de intensidade de amostragem em questionário pré-testado para um período de 20 anos (1997-2017). Os resultados mostraram que o vale de Miandam tem estoque de carbono no valor de US$ 16.306.000, enquanto o valor do ecoturismo foi de US$ 1.578.458 anualmente. Os resultados também mostraram que a tendência do turismo diminuiu drasticamente para estrangeiros e locais após o incidente de 11 de Setembro, e a situação se agravou ainda mais durante a era da talibanização ou militância de 2008-2011. Este estudo recomenda a implementação da estratégia de PES na taxa de 5%, portanto um total de US$ 78.922 pode ser ganho com ecoturismo e crédito de carbono na área de estudo anualmente, o que pode desempenhar um papel importante no manejo florestal sustentável.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR

Abstract Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

Resumo A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu subsequente sequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

Trap-nesting biology of an ectoparasitoid spider wasp, Auplopus subaurarius (Hymenoptera: Pompilidae): the importance of wooded environments for niche generalist species / Biologia de nidificação em ninhos-armadilha da vespa ectoparasitoide de aranhas Auplopus subaurarius (Hymenoptera: Pompilidae): a importância de ambientes arborizados para espécies generalistas de nicho

The insect group is one of the most diverse on the planet and due to habitat degradation, many of these species are becoming extinct, leaving a lack of information on the basic biology of each one. In this study, previously unseen information about nesting biology is revealed in Auplopus subaurarius trap nests. This is a solitary ectoparasitoid spider wasp that nests in preexisting cavities. We used a trap-nesting methodology to sample A. subaurarius in two different sampling periods (2017/2018 and 2020/2021) in three types of environment (forest, grassland and Eucalyptus plantation). In our study, the A. subaurarius nest building was more frequent during the hottest months of the year (November to March), with its highest abundance found within natural forest areas and in Eucalyptus plantation than in grassland areas. In addition, the species had two development times: a short one (three months) and a delayed one (up to one year). Moreover, females were larger than males (weight and size) and the species' sex ratio had a tendency toward female production. Auplopus subaurarius presented seven natural enemy species: Ceyxia longispina, Caenochrysis crotonis, Photochryptus sp.1, Photochryptus sp.2, Messatoporus sp., Ephuta icema and Sphaeropthalma sp. We emphasize the importance of wooded environments to maintain the A. subaurarius populations and their associated interactors, both spiders and natural enemies, as these environments can provide better life conditions than grassland areas. Furthermore, other solitary wasps that may have the same lifestyle of A. subaurarius can also be improved by natural forest conservation and by good silviculture plantation planning, which should consider ecological aspects of Atlantic Forest landscapes.

O grupo dos insetos é um dos mais diversos do planeta e devido à degradação dos habitats, muitas dessas espécies estão sendo extintas, deixando uma carência de informações sobre a biologia básica de cada uma. Neste estudo, informações inéditas sobre a biologia de nidificação em ninhos-armadilha de Auplopus subaurarius são reveladas. Essa espécie trata-se de uma vespa solitária ectoparasitóide de aranhas, que nidifica em cavidades preexistentes. Utilizamos a metodologia de ninhos-armadilha para amostrar A. subaurarius em dois períodos amostrais diferentes (2017/2018 e 2020/2021), em três tipos de ambientes (floresta, campo e plantação de Eucalyptus). Em nosso estudo, a nidificação de A. subaurarius foi mais frequente nos meses mais quentes do ano (Novembro a Março), com maior abundância encontrada em áreas de floresta nativa e em plantações de Eucalyptus comparados à áreas de campo. Além disso, a espécie apresentou dois tempos de desenvolvimento, um curto (três meses) e um longo (até um ano). Além disso, as fêmeas foram maiores que os machos (peso e tamanho) e a razão sexual da espécie apresentou tendência à produção de fêmeas. Auplopus subaurarius apresentou sete espécies de inimigos naturais: Ceyxia longispina, Caenochrysis crotonis, Photochryptus sp.1, Photochryptus sp.2, Messatoporus sp., Ephuta icema e Sphaeropthalma sp. Ressaltamos a importância de ambientes arborizados para manutenção das populações de A. subaurarius e seus interagentes associados, tanto aranhas quanto inimigos naturais, uma vez que estes ambientes podem apresentar melhores condições de vida comparados à áreas campestres. Além disso, outras vespas solitárias que podem ter o mesmo estilo de vida de A. subaurarius, também podem ser afetadas positivamente pela conservação das florestas naturais e por um bom planejamento de plantações de silvicultura, as quais devem considerar os aspectos ecológicos das paisagens da Mata Atlântica.

Medium and large-sized mammals of a private protected wetland in the Cerrado-Amazon biological corridor, Brazil / Mamíferos de médio e grande porte em uma área alagável protegida no corredor biológico Cerrado-Amazônia, Brasil

Abstract Brazil is the world's richest country in biodiversity, including mammal species. In the Brazilian Cerrado biome, mammalian diversity is vast, with about 251 species, 32 of them are endemic and 22 listed as threatened species. In this work, we investigated species diversity of medium- and large-sized mammals in the private protected area RPPN Pontal do Jaburu (RPPN-PJ) and its surroundings, which is a flooded area located in an important biological corridor in the Cerrado-Amazon ecotone zone, a priority area for biodiversity conservation in Brazil. We used camera-trapping, active search (night and day), and track survey during dry season (Apr - Aug 2016). We recorded 29 mammal species, being the Carnivora order the most representative with 11 species. Regarding threat status, 35.7% of the recorded species were listed as threatened in Brazil and 32.1% worldwide. We highlight the high relative frequency of threatened species records such as Tapirus terrestris, Panthera onca, Blastocerus dichotomus, Pteronura brasiliensis, Priodontes maximus, and other, as well as the presence of the newly described aquatic mammal species Inia araguaiaensis. We stress the importance of RPPN-PJ and its surroundings for mammal conservation, which include complex habitats (wetlands) located in an important ecotone zone.

Resumo O Brasil é o país mais rico em biodiversidade no mundo, incluindo espécies de mamíferos. No bioma Cerrado, a diversidade de mamíferos é enorme, com cerca de 251 espécies, sendo 32 delas endêmicas e 22 listadas como ameaçadas de extinção. Neste estudo, investigamos a diversidade de espécies de mamíferos de médio e grande porte da RPPN Pontal do Jaburu (RPPN-PJ) e seu entorno, que é uma floresta de inundação localizada em um importante corredor biológico na zona de ecótono Cerrado-Amazonia, uma área prioritária para conservação da biodiversidade no Brasil. Os dados foram coletados por armadilhas fotográficas, busca ativa (noturna e diurna) e identificação de pegadas durante a estação seca (abril - agosto de 2016). Registramos um grande número de espécies de mamíferos (n = 29), sendo a ordem carnívora a mais representativa com 11 espécies. Com relação ao status de ameaça, 34,5% das espécies registradas foram listadas como ameaçadas na lista vermelha do Brasil e 20,7% na lista vermelha da IUCN. Destacamos a alta frequência relativa de registros de espécies ameaçadas como Tapirus terrestris, Panthera onca, Blastocerus dichotomus, Pteronura brasiliensis, Priodontes maximus, bem como a presença da recém descrita espécie de mamífero aquático Inia araguaiaensis. Nós discutimos a importância da RPPN-PJ e seus arredores para a conservação de espécies de mamíferos, onde inclui habitats complexos (áreas de inundação) localizados em uma importante zona de ecótono.. Os resultados reforçam a relevância desta área para a conservação de mamíferos.

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu sub sequentesequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.(AU)

A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu sub sequentesequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).(AU)

The influence of primer choice on archaeal phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene PCR / A influência da escolha de iniciadores na filogenia de Archaea em ensaios de PCR para o gene rRNA 16S

Abstract Polymerase chain reaction (PCR) assays targeting 16S rRNA genes followed by DNA sequencing are still important tools to characterize microbial communities present in environmental samples. However, despite the crescent number of deposited archaeal DNA sequences in databases, until now we do not have a clear picture of the effectiveness and specificity of the universal primers widely used to describe archaeal communities from different natural habitats. Therefore, in this study, we compared the phylogenetic profile obtained when Cerrado lake sediment DNA samples were submitted to 16S rDNA PCR employing three Archaea-specific primer sets commonly used. Our findings reveal that specificity of primers differed depending on the source of the analyzed DNA. Furthermore, archaeal communities revealed by each primer pair varied greatly, indicating that 16S rRNA gene primer choice affects the community profile obtained, with differences in both taxon detection and operational taxonomic unit (OTU) estimates.

Resumo A amplificação de genes que codificam o rRNA 16S por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o seu subsequente sequenciamento consistem em uma ferramenta importante na caracterização de comunidades microbianas presentes em amostras ambientais. No entanto, apesar do crescente número de sequências de DNA de Archaea depositadas em bancos de dados, a especificidade e efetividade dos iniciadores de PCR descritos como universais e amplamente utilizados na descrição desse grupo ainda não está clara. Neste estudo foram comparados os perfis filogenéticos de comunidades de arqueias obtidos a partir amostras de DNA de sedimentos lacustres do Cerrado submetidas a ensaios de PCR empregando três pares de iniciadores específicos para Archaea, comumente utilizados neste tipo de estudo. Nossos resultados indicam que as comunidades de arqueias detectadas com cada par de iniciadores apresentaram grande variação filogenética, sugerindo que a escolha de iniciadores dirigidos ao gene de rRNA 16S tem efeito significativo no perfil da comunidade descrita, com diferenças tanto em relação aos táxons detectados, como nas estimativas de unidades taxonômicas operacionais (OTU).

Plant age, crop stage and surrounding habitats: their impact on sucking pests and predators complex in cotton (Gossypium hirsutum L. ) field plots in arid climate at district Layyah, Punjab, Pakistan / Idade da planta, estágio da cultura e habitats circundantes: seu impacto no complexo de pragas sugadoras e predadores em parcelas de algodão (Gossypium hirsutum L. ) em clima árido no distrito de Layyah, Punjab, Paquistão

Sucking pests are major threat to cotton field crop which cause unbearable losses to the crop yield. Aim of the current study was to record seasonal dynamics of major sucking insect pests including whitefly, jassid, thrips and their natural arthropod predators i.e. green lacewings and spiders in cotton field plots. The effects of surrounding field crops on pests' density and predatory efficiency of predators were also recorded. For sampling and survey of insects, the visual counting was found to be the most efficient method for recording the abundance of insects, trailed by net sweeping and tapping. Whitefly was the most dominant sucking pest found on the vegetative stage of cotton, followed by jassid and thrips. Fluctuated populations of predatory arthropods, spiders and green lacewings were also recorded during whole cropping season however, the densities of pests and predators varied with crop phenology. Spiders' population was encouraging at both vegetative and flowering stage and also the same trend of jassid and whitefly were observed at both stages of the crop. Surrounding habitats showed non-significant effect on population densities of insect pests and predators. For abiotic factors, the spiders showed strong positive correlation with humidity and temperature. However, green lacewing was only positively correlated with humidity. On the other hand, the populations of whitefly, jassid and thrips showed non-significant correlation with both temperature and humidity. Overall densities of sucking insect pests were found above economic threshold level. The plant age, crop stage and surrounding habitats effect on the population fluctuation of pests as well as the predators' abundance. The future studies are also warranted to investigate the altered habitats and multiple trap cropping to find out their impact on unattended insect predators and parasitoids in cotton crop.

As pragas sugadoras são uma grande ameaça para a cultura do algodão, causando perdas insuportáveis no rendimento da cultura. O objetivo do estudo atual foi registrar a dinâmica sazonal das principais pragas de insetos sugadores, incluindo mosca-branca, jassid, tripes e seus artrópodes predadores naturais, ou seja, crisopídeos e aranhas verdes em parcelas de algodão. Os efeitos das plantações circundantes na densidade de pragas e na eficiência predatória de predadores também foram registrados. Para amostragem e pesquisa de insetos, a contagem visual foi considerada o método mais eficiente para registrar a abundância de insetos, seguido por varredura e batida de rede. A mosca-branca foi a praga sugadora mais dominante encontrada na fase vegetativa do algodoeiro, seguida pelo jassid e tripes. Populações flutuantes de artrópodes predadores, aranhas e crisálidas também foram registradas durante toda a safra, no entanto as densidades de pragas e predadores variaram com a fenologia da cultura. A população de aranhas foi encorajadora tanto na fase vegetativa como na floração e também a mesma tendência de jassid e mosca-branca foi observada em ambas as fases da cultura. Os habitats circundantes mostraram efeito não significativo nas densidades populacionais de insetos-praga e predadores. Para os fatores abióticos, as aranhas apresentaram forte correlação positiva com umidade e temperatura. No entanto, lacewing verde foi apenas positivamente correlacionado com a umidade. Por outro lado, as populações de mosca-branca, jassid e tripes apresentaram correlação não significativa com temperatura e umidade. As densidades gerais de pragas sugadoras de insetos foram encontradas acima do nível do limiar econômico. A idade da planta, o estágio da cultura e os habitats circundantes afetam a flutuação populacional de pragas, bem como a abundância de predadores. Os estudos futuros também são necessários para investigar os habitats alterados e cultivo com armadilhas múltiplas para descobrir seu impacto sobre predadores de insetos e parasitoides desacompanhados na cultura do algodão.

Plant age, crop stage and surrounding habitats: their impact on sucking pests and predators complex in cotton (Gossypium hirsutum L.) field plots in arid climate at district Layyah, Punjab, Pakistan

Abstract Sucking pests are major threat to cotton field crop which cause unbearable losses to the crop yield. Aim of the current study was to record seasonal dynamics of major sucking insect pests including whitefly, jassid, thrips and their natural arthropod predators i.e. green lacewings and spiders in cotton field plots. The effects of surrounding field crops on pests density and predatory efficiency of predators were also recorded. For sampling and survey of insects, the visual counting was found to be the most efficient method for recording the abundance of insects, trailed by net sweeping and tapping. Whitefly was the most dominant sucking pest found on the vegetative stage of cotton, followed by jassid and thrips. Fluctuated populations of predatory arthropods, spiders and green lacewings were also recorded during whole cropping season however, the densities of pests and predators varied with crop phenology. Spiders population was encouraging at both vegetative and flowering stage and also the same trend of jassid and whitefly were observed at both stages of the crop. Surrounding habitats showed non-significant effect on population densities of insect pests and predators. For abiotic factors, the spiders showed strong positive correlation with humidity and temperature. However, green lacewing was only positively correlated with humidity. On the other hand, the populations of whitefly, jassid and thrips showed non-significant correlation with both temperature and humidity. Overall densities of sucking insect pests were found above economic threshold level. The plant age, crop stage and surrounding habitats effect on the population fluctuation of pests as well as the predators abundance. The future studies are also warranted to investigate the altered habitats and multiple trap cropping to find out their impact on unattended insect predators and parasitoids in cotton crop.

Resumo As pragas sugadoras são uma grande ameaça para a cultura do algodão, causando perdas insuportáveis no rendimento da cultura. O objetivo do estudo atual foi registrar a dinâmica sazonal das principais pragas de insetos sugadores, incluindo mosca-branca, jassid, tripes e seus artrópodes predadores naturais, ou seja, crisopídeos e aranhas verdes em parcelas de algodão. Os efeitos das plantações circundantes na densidade de pragas e na eficiência predatória de predadores também foram registrados. Para amostragem e pesquisa de insetos, a contagem visual foi considerada o método mais eficiente para registrar a abundância de insetos, seguido por varredura e batida de rede. A mosca-branca foi a praga sugadora mais dominante encontrada na fase vegetativa do algodoeiro, seguida pelo jassid e tripes. Populações flutuantes de artrópodes predadores, aranhas e crisálidas também foram registradas durante toda a safra, no entanto as densidades de pragas e predadores variaram com a fenologia da cultura. A população de aranhas foi encorajadora tanto na fase vegetativa como na floração e também a mesma tendência de jassid e mosca-branca foi observada em ambas as fases da cultura. Os habitats circundantes mostraram efeito não significativo nas densidades populacionais de insetos-praga e predadores. Para os fatores abióticos, as aranhas apresentaram forte correlação positiva com umidade e temperatura. No entanto, lacewing verde foi apenas positivamente correlacionado com a umidade. Por outro lado, as populações de mosca-branca, jassid e tripes apresentaram correlação não significativa com temperatura e umidade. As densidades gerais de pragas sugadoras de insetos foram encontradas acima do nível do limiar econômico. A idade da planta, o estágio da cultura e os habitats circundantes afetam a flutuação populacional de pragas, bem como a abundância de predadores. Os estudos futuros também são necessários para investigar os habitats alterados e cultivo com armadilhas múltiplas para descobrir seu impacto sobre predadores de insetos e parasitoides desacompanhados na cultura do algodão.

Monitoring post-release behavioural activity of captive-bred urial (Ovis vignei punjabiensis) at Togh Managara Safari Park Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan / Monitoramento da atividade comportamental pós-liberação de urial criado em cativeiro (Ovis vignei punjabiensis) em Togh Managara Safari Park Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão

The Punjab urial (Ovis vignei punjabiensis) is a globally threatened wild sheep species. In Pakistan the species is legally protected and bred in captivity to release into natural habitats to reinforce wild populations. Vigilance and feeding are critical to survival, though the degree to which captive-bred animals exhibit these behaviours post-release has rarely been investigated. We monitored the daily behaviours of five adult urial after release and classifying behaviours from 0600 hrs to 1800 hrs, replicating each one-hour period twice and recording four observations of each animal per hour. At the herd level, vigilance and feeding behaviours were exhibited equally. Males and females invested equal time in feeding, males were more vigilant (p = 0.001) and more aggressive (p = 0.010), and females were more restful (p = 0.019) or engaged in grooming (p = 0.044) or locomotion (p = 0.002). Females spent more time feeding than being vigilant (p = 0.002). Males maintained high levels of vigilance throughout the day. Patterns of resting 1300 hrs to 1500 hrs and feeding in early morning and late afternoon were common for both sexes. Behaviours classified as 'other' were exhibited equally between sexes. Our results reveal positive indications of captive-bred urial balancing threat detection and energy acquisition post-release and exhibiting natural behaviours and activity patterns. We encourage assessment of survivorship to evaluate long-term effectiveness of captive breeding and release as a candidate restoration programme.

O Punjab urial (Ovis vignei punjabiensis) é uma espécie de ovelha selvagem ameaçada globalmente. No Paquistão, a espécie é legalmente protegida e criada em cativeiro para ser liberada em habitats para reforçar as populações selvagens. Vigilância e alimentação são essenciais para a sobrevivência, embora o grau de comportamento que os animais criados em cativeiro apresenta raramente tenha sido estudado. Cinco uriais adultos foram monitorados diariamente, após a liberação os comportamentos foram classificados das 6 h às 18 h, replicando cada período de uma hora por duas vezes e registrando quatro observações de cada animal por hora. Em nível do rebanho, os comportamentos de vigilância e alimentação foram exibidos igualmente. Machos e fêmeas investiam tempo igual na alimentação, enquanto os machos eram mais vigilantes (p = 0,001) e mais agressivos (p = 0,010), as fêmeas eram mais repousantes (p = 0,019) ou mais engajadas no asseio (p = 0,044) ou na locomoção (p = 0,002). As fêmeas passam mais tempo se alimentando do que vigiando (p = 0,002). Os machos mantiveram altos níveis de vigilância ao longo do dia. Padrões de descanso de 1300 a 1500 horas e alimentação no início da manhã e no final da tarde eram comuns para ambos os sexos. Comportamentos classificados como "outros" foram exibidos igualmente entre os sexos. Os resultados revelam indicações positivas na detecção de ameaça em relação ao equilíbrio de criação urial em cativeiro e em aquisição de energia pósliberação, exibindo comportamentos naturais e padrões de atividade. Neste estudo, encorajou-se a utilização da avaliação de sobrevivência para avaliar a eficácia em longo prazo da reprodução em cativeiro e soltura como um programa de restauração dos candidatos.

Perspectives and challenges on isotopic ecology of terrestrial birds in Brazil

Although stable isotopes have been increasingly used in ornithology since 1980 in many places, Brazil has been slow in adopting this methodology, especially when it comes to terrestrial birds. The most common elements in bird ecology studies are carbon, nitrogen, hydrogen, and oxygen stable isotopes, which provide information on diet, trophic interactions, habitat use, migration, geographic patterns, and physiology. It is important that Brazilian ornithologists become aware of the potential of stable isotope analysis in ecological studies, and the shortcomings of this tool. The use of stable isotopes to study bird ecology has great potential in Brazil, since many ecological questions about Neotropical birds can be addressed by it (e.g., resource and habitat use, migratory routes, isotopic niches, anthropogenic impacts, individual specialization). Brazilian museums and other Natural History collections can provide samples to study long-term temporal dynamics in bird ecology. Additionally, the integration of avian tissue sample information into a database may increase the collaboration among researchers and promote sample reuse in a variety of studies. All biomes in Brazil have been under pressure from anthropogenic impacts (e.g., land-use change, habitat loss, fragmentation, intensive agriculture), affecting several taxa, including terrestrial birds. Considering the negative effects of human expansion over natural areas and that stable isotopes provide useful ecological information, ornithologists in Brazil should increase their use of this tool in the future.(AU)

Sexual dimorphism and morphometrics in two populations of the Neotropical freshwater turtle Mesoclemmys vanderhaegei (Testudines, Chelidae)

ABSTRACT As commonly observed in turtles, sexual size dimorphism (SSD) is pronounced in the Neotropical freshwater turtle Mesoclemmys vanderhaegei (Bour, 1973), a species in which females are usually larger than males. We studied SSD in two populations of M. vanderhaegei from the Brazilian Cerrado savannah, based on 245 specimens captured between November 2010 and August 2013. The carapace length of the largest male was 201 mm (9.15% shorter than that of the largest female, 220 mm). The mean sizes of males and females did not differ in the two populations. However, a comparison of eight selected morphological variables revealed that the size distribution pattern differed between the populations. Using model selection, seven out of 34 morphometric variables - from the head, plastron, bridge, and tail - were selected as the most suitable ones to distinguish between males and females. The pattern of SSD found in M. vanderhaegei is similar to that found in other chelonian species and may be the result of natural selection rather than ecological factors, since individuals of both sexes use the same habitats.

RESUMO Como comumente observado em quelônios, dimorfismo sexual em tamanho (SSD) é pronunciado em Mesoclemmys vanderhaegei (Bour, 1973), uma espécie de quelônio Neotropical de água doce onde as fêmeas são geralmente maiores que os machos. Nós estudamos SSD em duas populações de M. vanderhaegei no Cerrado brasileiro, com base em 245 espécimes capturados entre novembro de 2010 e agosto de 2013. O comprimento da carapaça do maior macho foi de 201 mm (9,15% menor que o comprimento da maior fêmea, 220 mm). Os tamanhos médios de fêmeas e machos não diferiram nas duas populações. No entanto, uma comparação de oito variáveis morfológicas revelou que o padrão de distribuição de tamanhos diferiu entre as populações. Usando a seleção de modelos, sete das 34 variáveis morfométricas - incluindo medidas da cabeça, plastrão, ponte e cauda - foram selecionadas como as mais adequadas para distinguir fêmeas e machos. O padrão de SSD encontrado em M. vanderhaegei é similar ao encontrado em outras espécies de quelônios e pode ser o resultado de seleção natural ao invés de fatores ecológicos, uma vez que indivíduos de ambos os sexos usam os mesmos habitats.

Plant age, crop stage and surrounding habitats: their impact on sucking pests and predators complex in cotton (Gossypium hirsutum L) field plots in arid climate at district Layyah, Punjab, Pakistan / Idade da planta, estágio da cultura e habitats circundantes: seu impacto no complexo de pragas sugadoras e predadores em parcelas de algodão (Gossypium hirsutum L) em clima árido no distrito de Layyah, Punjab, Paquistão

Sucking pests are major threat to cotton field crop which cause unbearable losses to the crop yield. Aim of the current study was to record seasonal dynamics of major sucking insect pests including whitefly, jassid, thrips and their natural arthropod predators i.e. green lacewings and spiders in cotton field plots. The effects of surrounding field crops on pests' density and predatory efficiency of predators were also recorded. For sampling and survey of insects, the visual counting was found to be the most efficient method for recording the abundance of insects, trailed by net sweeping and tapping. Whitefly was the most dominant sucking pest found on the vegetative stage of cotton, followed by jassid and thrips. Fluctuated populations of predatory arthropods, spiders and green lacewings were also recorded during whole cropping season however, the densities of pests and predators varied with crop phenology. Spiders' population was encouraging at both vegetative and flowering stage and also the same trend of jassid and whitefly were observed at both stages of the crop. Surrounding habitats showed non-significant effect on population densities of insect pests and predators. For abiotic factors, the spiders showed strong positive correlation with humidity and temperature. However, green lacewing was only positively correlated with humidity. On the other hand, the populations of whitefly, jassid and thrips showed non-significant correlation with both temperature and humidity. Overall densities of sucking insect pests were found above economic threshold level. The plant age, crop stage and surrounding habitats effect on the population fluctuation of pests as well as the predators' abundance. The future studies are also warranted to investigate the altered habitats and multiple trap cropping to find out their impact on unattended insect predators and parasitoids in cotton crop.(AU)

As pragas sugadoras são uma grande ameaça para a cultura do algodão, causando perdas insuportáveis no rendimento da cultura. O objetivo do estudo atual foi registrar a dinâmica sazonal das principais pragas de insetos sugadores, incluindo mosca-branca, jassid, tripes e seus artrópodes predadores naturais, ou seja, crisopídeos e aranhas verdes em parcelas de algodão. Os efeitos das plantações circundantes na densidade de pragas e na eficiência predatória de predadores também foram registrados. Para amostragem e pesquisa de insetos, a contagem visual foi considerada o método mais eficiente para registrar a abundância de insetos, seguido por varredura e batida de rede. A mosca-branca foi a praga sugadora mais dominante encontrada na fase vegetativa do algodoeiro, seguida pelo jassid e tripes. Populações flutuantes de artrópodes predadores, aranhas e crisálidas também foram registradas durante toda a safra, no entanto as densidades de pragas e predadores variaram com a fenologia da cultura. A população de aranhas foi encorajadora tanto na fase vegetativa como na floração e também a mesma tendência de jassid e mosca-branca foi observada em ambas as fases da cultura. Os habitats circundantes mostraram efeito não significativo nas densidades populacionais de insetos-praga e predadores. Para os fatores abióticos, as aranhas apresentaram forte correlação positiva com umidade e temperatura. No entanto, lacewing verde foi apenas positivamente correlacionado com a umidade. Por outro lado, as populações de mosca-branca, jassid e tripes apresentaram correlação não significativa com temperatura e umidade. As densidades gerais de pragas sugadoras de insetos foram encontradas acima do nível do limiar econômico. A idade da planta, o estágio da cultura e os habitats circundantes afetam a flutuação populacional de pragas, bem como a abundância de predadores. Os estudos futuros também são necessários para investigar os habitats alterados e cultivo com armadilhas múltiplas [...].(AU)