Assessment of phytoremediation potencial of Allium cepa L. in raw sewage treatment / Avaliação do potencial de fitorremediação da Allium cepa L. no tratamento do esgoto bruto

Whereas the effects of the substances found in domestic sewage on live organisms is important to evaluate the use of plants to remove pollutants from the environment. The objective of this study was to assess the phytoremediation activity of Allium cepa L. (onion) roots exposed to raw sewage, as well as the acute toxic activity of this effluent for the bioindicators A. cepa, through a cytotoxicity test, and Artemia salina L., through a mortality/immobility test. The physicochemical assessments of the sewage were conducted in two scenarios: immediately after collection and after being in contact with onion roots (phytoremediation) for 24 hours. The physicochemical data indicate there was a reduction in nitrogen and phosphorus levels and in biochemical oxygen demand in sewage treated. The results from the cytotoxicity test with A. cepa indicated a reduction in the mitotic cell divisions of the onions treated with the raw sewage. The mortality/immobility test with A. salina indicated that the concentrations with 50 and 100% of raw sewage induced the mortality of the nauplii. Thus, the data suggest new studies that seek greater efficiency, efficacy and viability of onion phytoremediation.(AU)

Considerando os efeitos das substâncias encontradas no esgoto doméstico em organismos vivos, é importante avaliar o uso de plantas para remover poluentes do meio ambiente. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade de fitorremediação de raízes de Allium cepa L. (cebola) expostas ao esgoto bruto, bem como a atividade tóxica aguda desse efluente para os bioindicadores A. cepa, através de um teste de citotoxicidade, e Artemia salina L., através de um teste de mortalidade/imobilidade. As avaliações físico-químicas do esgoto foram realizadas em dois cenários: imediatamente após a coleta e após contato com raízes de cebola (fitorremediação) por 24 horas. Os dados físico-químicos indicam que houve redução nos níveis de nitrogênio e fósforo e na demanda bioquímica de oxigênio no esgoto tratado. Os resultados do teste de citotoxicidade com A. cepa indicaram uma redução nas divisões celulares mitóticas das cebolas tratadas com o esgoto bruto. O teste de mortalidade/imobilidade com A. salina indicou que as concentrações com 50 e 100% de esgoto bruto induziram a mortalidade dos náuplios. Assim, os dados sugerem novos estudos que busquem maior eficiência, eficácia e viabilidade de fitorremediação das cebolas.(AU)

Biochar and its impact on soil properties, growth and yield of okra plants / Biocarvão e seu impacto nas propriedades do solo, crescimento e produtividade de plantas de quiabo

Applying biochar to the soil can mitigate problems that hinder agricultural production, such as water scarcity and low fertility soils. The objective of this research was to evaluate the impact of dry coconut husk biochar and sewage sludge combinations on soil chemical characteristics, growth, yield and water productivity of okra crop. The experiment was arranged in randomized blocks, with 6 treatments (CHB+BSS - coconut husk biochar + biochar of sewage sludge, CHB+RSS- coconut husk biochar + raw sewage sludge, BSS+RSS - biochar  of sewage sludge + raw sewage sludge, CHB - coconut husk biochar, BSS - biochar of sewage sludge,  WB - without biochar (control)). Plant height, number of fruits per plant, yield and water use productivity were evaluated. To evaluate the effect of biochar on soil, soil samples were taken to determine pH, CEC, P, K, Ca, Mg concentrations after incorporation of biochar into the soil. The BSS + RSS and RSS treatments provided better results on okra production and growth characteristics with a 421.15% and 419% productivity increase, respectively, compared to the control treatment. The BSS + RSS and BSS treatments provided better water productivity values with values of 1.45 and 1.44 tons produced for each cubic meter of water applied, respectively. All soil chemical characteristics analyzed were modified when the biochar was...

A aplicação de biocarvão no solo pode atenuar problemas que dificultam a produção agrícola, como escassez de água e solos com baixa fertilidade. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o impacto das combinações de biocarvão de casca de coco seco e lodo de esgoto nas características químicas do solo, crescimento, rendimento e produtividade de água da cultura do quiabo. O experimento foi organizado em blocos casualizados, com 6 tratamentos (CHB + BSS - biocarvão de casca de coco + biocarvão de lodo de esgoto, CHB + RSS- biocarvão de casca de coco + lodo de esgoto bruto, BSS + RSS - biocarvão de lodo de esgoto + lodo de esgoto bruto, CHB - biocarvão de casca de coco, BSS - biocarvão de lodo de esgoto, WB - sem biocarvão (controle)). Foram avaliados a altura da planta, número de frutos por planta, produtividade e produtividade de uso da água. Para avaliar o efeito do biocarvão no solo, foram coletadas amostras de solo para determinação das concentrações de pH, CEC, P, K, Ca, Mg após incorporação do biocarvão no solo. Os tratamentos BSS + RSS e RSS proporcionaram melhores resultados nas características de produção e crescimento de quiabo, com um aumento de produtividade de 421,15% e 419%, respectivamente, em comparação com o tratamento controle. Os tratamentos BSS + RSS e BSS proporcionaram melhores valores de produtividade da água com valores de 1,45 e 1,44 toneladas produzidas...

Biochar and its impact on soil properties, growth and yield of okra plants / Biocarvão e seu impacto nas propriedades do solo, crescimento e produtividade de plantas de quiabo

Applying biochar to the soil can mitigate problems that hinder agricultural production, such as water scarcity and low fertility soils. The objective of this research was to evaluate the impact of dry coconut husk biochar and sewage sludge combinations on soil chemical characteristics, growth, yield and water productivity of okra crop. The experiment was arranged in randomized blocks, with 6 treatments (CHB+BSS - coconut husk biochar + biochar of sewage sludge, CHB+RSS- coconut husk biochar + raw sewage sludge, BSS+RSS - biochar  of sewage sludge + raw sewage sludge, CHB - coconut husk biochar, BSS - biochar of sewage sludge,  WB - without biochar (control)). Plant height, number of fruits per plant, yield and water use productivity were evaluated. To evaluate the effect of biochar on soil, soil samples were taken to determine pH, CEC, P, K, Ca, Mg concentrations after incorporation of biochar into the soil. The BSS + RSS and RSS treatments provided better results on okra production and growth characteristics with a 421.15% and 419% productivity increase, respectively, compared to the control treatment. The BSS + RSS and BSS treatments provided better water productivity values with values of 1.45 and 1.44 tons produced for each cubic meter of water applied, respectively. All soil chemical characteristics analyzed were modified when the biochar was...(AU)

A aplicação de biocarvão no solo pode atenuar problemas que dificultam a produção agrícola, como escassez de água e solos com baixa fertilidade. O objetivo desta pesquisa foi avaliar o impacto das combinações de biocarvão de casca de coco seco e lodo de esgoto nas características químicas do solo, crescimento, rendimento e produtividade de água da cultura do quiabo. O experimento foi organizado em blocos casualizados, com 6 tratamentos (CHB + BSS - biocarvão de casca de coco + biocarvão de lodo de esgoto, CHB + RSS- biocarvão de casca de coco + lodo de esgoto bruto, BSS + RSS - biocarvão de lodo de esgoto + lodo de esgoto bruto, CHB - biocarvão de casca de coco, BSS - biocarvão de lodo de esgoto, WB - sem biocarvão (controle)). Foram avaliados a altura da planta, número de frutos por planta, produtividade e produtividade de uso da água. Para avaliar o efeito do biocarvão no solo, foram coletadas amostras de solo para determinação das concentrações de pH, CEC, P, K, Ca, Mg após incorporação do biocarvão no solo. Os tratamentos BSS + RSS e RSS proporcionaram melhores resultados nas características de produção e crescimento de quiabo, com um aumento de produtividade de 421,15% e 419%, respectivamente, em comparação com o tratamento controle. Os tratamentos BSS + RSS e BSS proporcionaram melhores valores de produtividade da água com valores de 1,45 e 1,44 toneladas produzidas...(AU)

Assessment of phytoremediation potencial of Allium cepa L. in raw sewage treatment

Abstract Whereas the effects of the substances found in domestic sewage on live organisms is important to evaluate the use of plants to remove pollutants from the environment. The objective of this study was to assess the phytoremediation activity of Allium cepa L. (onion) roots exposed to raw sewage, as well as the acute toxic activity of this effluent for the bioindicators A. cepa, through a cytotoxicity test, and Artemia salina L., through a mortality/immobility test. The physicochemical assessments of the sewage were conducted in two scenarios: immediately after collection and after being in contact with onion roots (phytoremediation) for 24 hours. The physicochemical data indicate there was a reduction in nitrogen and phosphorus levels and in biochemical oxygen demand in sewage treated. The results from the cytotoxicity test with A. cepa indicated a reduction in the mitotic cell divisions of the onions treated with the raw sewage. The mortality/immobility test with A. salina indicated that the concentrations with 50 and 100% of raw sewage induced the mortality of the nauplii. Thus, the data suggest new studies that seek greater efficiency, efficacy and viability of onion phytoremediation.

Resumo Considerando os efeitos das substâncias encontradas no esgoto doméstico em organismos vivos, é importante avaliar o uso de plantas para remover poluentes do meio ambiente. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade de fitorremediação de raízes de Allium cepa L. (cebola) expostas ao esgoto bruto, bem como a atividade tóxica aguda desse efluente para os bioindicadores A. cepa, através de um teste de citotoxicidade, e Artemia salina L., através de um teste de mortalidade/imobilidade. As avaliações físico-químicas do esgoto foram realizadas em dois cenários: imediatamente após a coleta e após contato com raízes de cebola (fitorremediação) por 24 horas. Os dados físico-químicos indicam que houve redução nos níveis de nitrogênio e fósforo e na demanda bioquímica de oxigênio no esgoto tratado. Os resultados do teste de citotoxicidade com A. cepa indicaram uma redução nas divisões celulares mitóticas das cebolas tratadas com o esgoto bruto. O teste de mortalidade/imobilidade com A. salina indicou que as concentrações com 50 e 100% de esgoto bruto induziram a mortalidade dos náuplios. Assim, os dados sugerem novos estudos que busquem maior eficiência, eficácia e viabilidade de fitorremediação das cebolas.

Surveillance of Giardia and Cryptosporidium in sewage from an urban area in Brazil / Monitoramento de Giardia e Cryptosporidium em esgoto de uma área urbana no Brasil

Cryptosporidium and Giardia are protozoan parasites that cause diarrhea in humans and animals. Molecular characterization of these pathogens in sewage may provide insight on their occurrence and prevalence in Brazil. This study aimed to investigate the presence of Giardia and Cryptosporidium in raw and treated sewage from Londrina, Paraná, Brazil. Samples were collected every two weeks during a year. Samples were concentrated, then DNA was extracted and subjected to a nested PCR targeting the Giardia 18S rRNA gene and the Cryptosporidium 18S rRNA gene. Species of Cryptosporidium were characterized by restriction fragment length polymorphism (RFLP). All raw sewage and 76% of the treated sewage were positive for Giardia; 84% of raw sewage samples and 8% of treated sewage were positive for Cryptosporidium. C. muris, C. hominis, C. baileyi, C. parvum and C. suis were detected in 100%, 19%, 9%, 9% and 4% of raw sewage, respectively. C. muris was the only species found in treated sewage. Multiple species of Cryptosporidium were present in 19.04% of the raw sewage. Treated sewage water can pose a threat to human health. The speciation of Cryptosporidium revealed the presence of non-common zoonotic species as C. suis and C. muris.(AU)

Cryptosporidium e Giardia são protozoários causadores de diarreia em animais e humanos. A caracterização molecular destes protozoários em esgoto pode prover dados ainda desconhecidos da ocorrência de espécies. O objetivo do presente estudo foi monitorar a ocorrência de Giardia e espécies de Cryptosporidium em esgoto bruto e tratado em uma estação de tratamento de esgoto (ETE) de Londrina, Paraná. Amostras de esgoto bruto e tratado foram coletadas no período de um ano, com periodicidade quinzenal. A ocorrência destes protozoários foi caracterizada por meio de concentração das amostras e posterior extração de DNA seguida de nested-PCR para amplificação de fragmentos dos genes 18S rRNA de Giardia e 18S rRNA de Cryptosporidium. A caracterização das espécies de Cryptosporidium foi realizada por meio de análise por polimorfismo de comprimento do fragmento de restrição (RFLP) dos produtos obtidos. Foram coletadas no total 25 amostras de cada, esgoto bruto e esgoto tratado. Para Giardia, todas as amostras de esgoto bruto e 76% das de esgoto tratado foram positivas. Cryptosporidium esteve presente em 84% das amostras de esgoto bruto e em 8% do tratado. No esgoto tratado foi encontrado apenas C. muris, já nas amostras de esgoto bruto foram encontradas cinco espécies: C. muris, C. hominis, C. baileyi, C. suis e C. parvum em 100%, 19%, 9%, 9% e 4%, respectivamente. A presença de espécies mistas foi observada em 19,04% das amostras. A presença de Giardia e Cryptosporidium em esgoto tratado pode pôr em risco a saúde humana. A discriminação de espécies de Cryptosporidium revelou a presença de espécies zoonóticas incomuns como C. suis e C. muris.(AU)

Assessment of phytoremediation potencial of Allium cepa L. in raw sewage treatment

Abstract Whereas the effects of the substances found in domestic sewage on live organisms is important to evaluate the use of plants to remove pollutants from the environment. The objective of this study was to assess the phytoremediation activity of Allium cepa L. (onion) roots exposed to raw sewage, as well as the acute toxic activity of this effluent for the bioindicators A. cepa, through a cytotoxicity test, and Artemia salina L., through a mortality/immobility test. The physicochemical assessments of the sewage were conducted in two scenarios: immediately after collection and after being in contact with onion roots (phytoremediation) for 24 hours. The physicochemical data indicate there was a reduction in nitrogen and phosphorus levels and in biochemical oxygen demand in sewage treated. The results from the cytotoxicity test with A. cepa indicated a reduction in the mitotic cell divisions of the onions treated with the raw sewage. The mortality/immobility test with A. salina indicated that the concentrations with 50 and 100% of raw sewage induced the mortality of the nauplii. Thus, the data suggest new studies that seek greater efficiency, efficacy and viability of onion phytoremediation.

Resumo Considerando os efeitos das substâncias encontradas no esgoto doméstico em organismos vivos, é importante avaliar o uso de plantas para remover poluentes do meio ambiente. O objetivo deste trabalho foi avaliar a atividade de fitorremediação de raízes de Allium cepa L. (cebola) expostas ao esgoto bruto, bem como a atividade tóxica aguda desse efluente para os bioindicadores A. cepa, através de um teste de citotoxicidade, e Artemia salina L., através de um teste de mortalidade/imobilidade. As avaliações físico-químicas do esgoto foram realizadas em dois cenários: imediatamente após a coleta e após contato com raízes de cebola (fitorremediação) por 24 horas. Os dados físico-químicos indicam que houve redução nos níveis de nitrogênio e fósforo e na demanda bioquímica de oxigênio no esgoto tratado. Os resultados do teste de citotoxicidade com A. cepa indicaram uma redução nas divisões celulares mitóticas das cebolas tratadas com o esgoto bruto. O teste de mortalidade/imobilidade com A. salina indicou que as concentrações com 50 e 100% de esgoto bruto induziram a mortalidade dos náuplios. Assim, os dados sugerem novos estudos que busquem maior eficiência, eficácia e viabilidade de fitorremediação das cebolas.

Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon

Rivers and streams are important reservoirs of freshwater for human consumption. These ecosystems are threatened by increasing urbanization, because raw sewage discharged into them alters their nutrient content and may affect the composition of their microbial community. In the present study, we investigate the taxonomic and functional profile of the microbial community in an urban lotic environment. Samples of running water were collected at two points in the São Pedro stream: an upstream preserved and non-urbanized area, and a polluted urbanized area with discharged sewage. The metagenomic DNA was sequenced by pyrosequencing. Differences were observed in the community composition at the two sites. The non-urbanized area was overrepresented by genera of ubiquitous microbes that act in the maintenance of environments. In contrast, the urbanized metagenome was rich in genera pathogenic to humans. The functional profile indicated that the microbes act on the metabolism of methane, nitrogen and sulfur, especially in the urbanized area. It was also found that virulence/defense (antibiotic resistance and metal resistance) and stress response-related genes were disseminated in the urbanized environment. The structure of the microbial community was altered by uncontrolled anthropic interference, highlighting the selective pressure imposed by high loads of urban sewage discharged into freshwater environments.(AU)

AVALIAÇÃO DE ENTEROFAGOS EM AMOSTRAS DE ÁGUA E ESGOTO E SEU POTENCIAL USO COMO INDICADORES DE CONTAMINAÇÃO FECAL

O potencial uso de fagos que infectam Enterococcus spp., como marcadores de contaminação fecal em amostras de água, deve-se a capacidade dos mesmos infectarem bactérias predominantes em fezes de origem humana. Além disso, fagos são indicados como modelos para a remoção de vírus entéricos em sistemas de tratamento de efluentes. Efetivamente, os fagos podem ser um indicador mais apropriado da presença de vírus entéricos na água e nas águas residuais do que os indicadores bacterianos devido a sua similaridade com os vírus entéricos em termos de estrutura, morfologia, tamanho e resistência à inativação. Assim, sua aplicação na detecção de contaminação fecal em recursos hídricos é sugerida, pois indicam melhor a presença de patógenos entéricos, quando comparado a bactérias indicadoras. O objetivo deste trabalho foi determinar a utilização de enterofagos líticos como indicadores de contaminação fecal em amostras ambientais. Para isso, foram realizadas seis coletas de amostras de água e esgoto brutos e tratados (n = 24) de estações de tratamento na cidade de Novo Hamburgo (RS). A partir delas foi realizado o isolamento de enterofagos de Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium, através de ensaio de placa em camada dupla de agar. Paralelamente as essas mesmas amostras, realizou-se a pesquisa de Enterococcus spp. através do teste comercial Enterolert®, e a pesquisa de Mastadenovírus espécie C sorotipo 5 (HAdV-C) usando o método quantitativo PCR. Foram identificados, em ambos os tipos de amostras, fagos que infectaram Enterococcus faecalis e Enterococcus faecium. Em amostras de água constatou-se que não houve diferença significativa entre os dois fagos, porém quando analisadas as amostras de esgoto, houve diferença estatística entre eles (p < 0,05) em esgoto pré e pós tratamento, corroborando que o E. faecalis é o hospedeiro mais adequado para a pesquisa de enterofagos neste tipo de amostra. Não foi observado correlação significativa (p> 0,05) entre a presença de HAdV-C e enterofagos em ambas amostras. Também não houve correlação significativa dos fagos de E. faecium e E. faecalis com Enterococccus spp. em ambas as amostras. Necessita-se de mais estudos sobre o uso dos enterofagos como indicadores de contaminação fecal, visto a falta de dados consistentes na literatura sobre estes fagos.

The potential use of phages that infect Enterococcus spp., as markers of fecal contamination in water samples, has been reported because these bacteriophages are capable to infect bacteria that are predominantly present in human feces. In addition, phages have been proposed as models for the removal of enteric viruses in treatment systems. Effectively, phages can be a more appropriate indicator of the presence of enteric viruses in water and wastewater than bacterial indicators due to their similarity with enteric viruses in terms of structure, morphology, size and resistance to inactivation. Thus, its application in the detection of fecal contamination in water resources is suggested, as they better indicate the presence of enteric pathogens when compared to indicator bacteria. The objective of this study was to determine the use of lytic enterophages as indicators of fecal contamination in environmental samples. For this, six samples of raw and treated water and sewage samples (n = 24) were collected from treatment plants in the city of Novo Hamburgo (RS). From them, Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium were isolated by means of a double layer lysis plate test of Agar. In parallel, Enterococcus spp. through enterolert commercial test®, and Mastadenovirus research species C serotype 5 (HAdV-C) using the PCR quantitative method. Phages that infected Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium were identified in both types of samples. In water samples it was found that there was no significant difference between the two phages, however, when the sewage samples were analyzed, there was a statistical difference between them (p < 0.05) in pre and post-treatment sewage, corroborating that E. faecalis is the most appropriate host for the research of enterophageals in this type of sample. There was also no significant correlation between E. faecium and E. faecalis phages with Enterococccus spp. in both samples. Further studies on the use of enterophages as indicators of fecal contamination are needed, given the lack of consistent data in the literature on these phages.

Cultivo do peixe ornamental molinésia (Poecilia sp) em esgotos domésticos tratados: desempenho zootécnico e avaliação do bem-estar animal / Cultivation of ornamental molly (Poecilia sp) fish in treated sewage: zootechnical performance and animal welfare evaluation

Neste trabalho estudou-se a utilização de esgotos domésticos tratados na criação do peixe ornamental molinésia (Poecilia sp.), observando o desempenho zootécnico e avaliando-se o bem-estar dos peixes cultivados. Foram testados três tratamentos: ET - abastecido com esgoto tratado em lagoas de estabilização, ED - abastecido com esgoto tratado e água de poço diluídos em iguais proporções, AB - abastecido com água de poço. Por meio dos resultados dos parâmetros físico-químicos, observou-se que o esgoto doméstico tratado em lagoas de estabilização oferece condição para se realizar o cultivo da espécie, com melhor desempenho quando diluído em água. Em todos os parâmetros de rendimento zootécnicos avaliados, o tratamento que utilizou o esgoto tratado diluído foi o que apresentou os melhores resultados. Dentre os indicadores de bem-estar observados, apenas a avaliação histopatológica foi capaz de fornecer resultado conclusivo, o qual apontou o tratamento que utilizou esgoto tratado diluído como o que proporcionou maior conforto à espécie cultivada. As características ornamentais dos peixes cultivados não sofreram influência do uso do esgoto doméstico tratado, observando-se que os padrões de coloração e formato de nadadeiras não foram alterados.(AU)

This work evaluated the treated sewage reuse in ornamental molly fish creation, evaluating the zootechnical performance and animal welfare. Three treatments were tested: ET - supplied with treated sewage, ED - supplied with sewage and raw water in the same proportion, AB - supplied with raw water. The physical-chemical results indicated that the treated sewage from stabilization ponds was adequate for the species cultivation only when diluted in raw water. Among the welfare indicators, only histopathological evaluation was able to provide conclusive results, which showed that the treated sewage diluted treatment was the best in terms of comfort for the cultivated species. The ornamental characteristics of farmed fish were not influenced by the use of treated sewage, in which the patterns of color and shape of fins were not changed.(AU)

AVALIAÇÃO DO USO DE COLIFAGOS COMO INDICADORES MICROBIOLÓGICOS EM ÁGUA E ESGOTO EM ESTAÇÕES DE TRATAMENTO NO MUNICÍPIO DE NOVO HAMBURGO-RS

Doenças de veiculação hídrica são um problema de saúde pública, pois a presença de bactérias coliformes na água, particularmente os coliformes termotolerantes como Escherichia coli, é um dos indicadores de contaminação fecal. Logo, o uso de bactérias como o único indicador microbiológico de qualidade hídrica vem sendo revisto, principalmente pela existência de diferentes patógenos, como vírus e protozoários. Embora a quantificação de colifagos, vírus que infectam E. coli, como parâmetro de qualidade microbiológica da água seja reconhecida pela American Public Health Association (APHA), esta não é uma prática em nosso país. Por isso, este estudo avaliou a utilidade de colifagos como indicadores de contaminação fecal em amostras de água bruta e tratada e em amostras de esgoto bruto e tratado em estações, comparando-os com os resultados dos indicadores clássicos (coliformes). As seis coletas ocorreram entre maio e agosto de 2019 e as amostragens foram realizadas junto às estações de tratamento de Novo Hamburgo (RS). Todas amostras foram previamente submetidas à etapa de concentração viral para a pesquisa de fagos, exceto as amostras de água pós-tratamento, pois estas foram enriquecidas. Foi realizado o ensaio em sobrecamada de ágar para observação de placas de lise mediante três experimentos independentes para cada amostra de água e esgoto, todos em duplicata, utilizando Escherichia coli ATCC 13706 como célula hospedeira. Todos os tipos de amostras (água e esgoto, bruto e tratado) mostraram-se positivos para a presença de fagos, mas não para coliformes. Enquanto todas as amostras de água pós-tratamento foram negativas para coliformes, observou-se a presença de placas de lise nos ensaios realizados em 33,3% (2/6) dessas amostras, evidenciando que os colifagos são indicadores microbiológicos diferenciados. Na água tratada, a etapa de enriquecimento da fonte de isolamento foi muito importante para observação das placas de lise no teste em sobrecamada de ágar. Assim, os resultados demonstraram que os colifagos são resistentes ao tratamento físico-químico utilizado na respectiva estação, reforçando a sua utilidade como indicadores da contaminação por material fecal, especialmente em amostras de água tratada.

Waterborne diseases are a concern in public health system, since the presence of coliform bacteria in the water, particularly the thermotolerant coliforms/ fecal coliforms Escherichia coli is one of the indicators of fecal contamination. Therefore, the use of bacterias as the only microbiological indicator of water quality is being revised, mainly due to the existence of different pathogens, such as viruses and protozoans. Although the coliphage quantification, the virus which infects E. coli, as a microbiological quality standard of water is recognized by the American Public Health Association (APHA), this is not a practice in our country. Therefore, this study evaluated the coliphage usefulness as indicators of fecal contamination in raw and treated water samples, as well as in samples of raw sewage and treated plants, comparing them with the results of the classical indicators (coliforms). The six collections occurred between May and August of 2019 and the sampling processes were held together with the treatment plants of Novo Hamburgo (RS). All the samples were previously submitted to a viral concentration method to search for phages, besides the post-treatment water samples, for these have been enriched. It was held an agar-layer method to observe the lysis plates through three independent experiments for each water and sewage sample, all in duplicata, using Escherichia coli ATCC 13706 as the host cell. All sample types (water, sewage, raw, and treated) turned out to be positive for the presence of phages, but not to coliforms. While all the post-treatment water samples were negative for coliforms, it was observed the presence of lysis plates in tests performed in 33,3% (2/6) of these samples, emphasizing that the coliphages are differentiated microbiological indicators. In treated water, the enrichment of the insulation source method was very important to the observation of lysis plates in the agar-layer method. Thus, the results showed that the coliphages are resistant to the physicochemical treatment in the respective plant, reinforcing their usefulness as indicators of contamination through fecal material, especially in treated water samples.

Assessment of enteric viruses in a sewage treatment plant located in Porto Alegre, southern Brazil

In order to verify the microbial quality of the influents and effluents of one STP from southern Brazil, an eight-month survey was conducted to examine the presence of total and fecal coliforms and of adenovirus (HAdV), enterovirus (EV), genogroup A rotaviruses (GARV) and Torque teno virus (TTV), in treated effluent samples from São João/Navegantes STP, Porto Alegre (Brazil). A total of 16 samples were collected, eight of influent (raw sewage, prior to treatment), and the other eight of the effluent (post-treatment sewage). Total and fecal coliform levels ranging from 3.6 × 10(4) to 4.4 × 10(7) MPN/100 mL and 2.9 × 10³ to 1.7 × 10(7) MPN/100 mL, were detected in all samples. In raw sewage, HAdV (25%) and GARV (28.6%) viral genomes were detected. The analysis of effluent samples revealed the presence of HAdV (50%), EV (37.5%), and TTV (12.5%) genomic fragments. All samples, regardless of the month analysed, presented detection of a least one virus genus, except for in April. Higher virus detection rates were observed in treated sewage samples (62.5%), and in 80% of them (effluent positive samples) HAdV was detected. Results showed that improvements in sewage monitoring and treatment processes are necessary to reduce the viral and bacterial load on the environment in southern Brazil. To the knowledge of the authors, this is the first study showing the monitoring of viral genomes in influent and effluent samples from a STP located in Porto Alegre (Rio Grande do Sul, Brazil), southern Brazil.

Com o intuito de verificar a qualidade microbiológica de afluentes e efluentes de uma estação de tratamento de esgoto (ETE), um monitoramento de oito meses foi realizado para examinar a presença de coliformes totais e fecais, e de adenovírus (HAdV), enterovírus (EV), rotavírus do genogrupo A (GARV) e torque teno vírus (TTV), em amostras de esgoto tratado da ETE São João/Navegantes, em Porto Alegre-RS, Brasil. Um total de 16 amostras foi coletado, sendo oito de afluente (esgoto bruto, anterior ao tratamento) e oito de efluente (esgoto tratado). Os níveis de coliformes totais e fecais variaram entre 3,6 × 10(4) e 4,4 × 10(7) MPN/100 mL e 2,9 × 10³ e 1,7 × 10(7) MPN/100 mL, respectivamente, tendo sido estes detectados em todas as amostras. No esgoto bruto, foram detectados os genomas virais de HAdV (25%) e GARV (28,6%). A análise das amostras de efluente revelou a presença de fragmentos genômicos de HAdV (50%), EV (37,5%) e TTV (12,5%). Todas as amostras, independentemente do mês analisado, possibilitaram a detecção de pelo menos um gênero viral, exceto no mês de abril. Altas taxas de detecção viral foram observadas em amostras de esgoto tratado (62,5%), sendo que o HAdV foi detectado em 80% dessas amostras de efluente positivas. Os resultados mostram que aprimoramentos no processo de tratamento e monitoramento do esgoto são necessários para reduzir a carga viral e bacteriológica no ambiente do Sul do Brasil. Ao conhecimento dos autores, este é o primeiro estudo de monitoramento de genomas virais em amostras de afluente e efluente de uma ETE localizada em Porto Alegre-Rio Grande do Sul, Brasil.

Nitrogen mass balance in the Brazilian Amazon: an update

The main purpose of this study is to perform a nitrogen budget survey for the entire Brazilian Amazon region. The main inputs of nitrogen to the region are biological nitrogen fixation occurring in tropical forests (7.7 Tg.yr-1), and biological nitrogen fixation in agricultural lands mainly due to the cultivation of a large area with soybean, which is an important nitrogen-fixing crop (1.68 Tg.yr-1). The input due to the use of N fertilizers (0.48 Tg.yr-1) is still incipient compared to the other two inputs mentioned above. The major output flux is the riverine flux, equal to 2.80 Tg.yr-1 and export related to foodstuff, mainly the transport of soybean and beef to other parts of the country. The continuous population growth and high rate of urbanization may pose new threats to the nitrogen cycle of the region through the burning of fossil fuel and dumping of raw domestic sewage in rivers and streams of the region.

O principal objetivo deste estudo é realizar um balanço do nitrogênio em toda a Região Amazônica Brasileira. As principais entradas de nitrogênio na região foram a fixação biológica do nitrogênio que ocorre nas florestas tropicais (7,7 Tg.ano-1) e a fixação biológica do nitrogênio em terras agrícolas, que ocorre principalmente devido à existência de grandes áreas de cultivo de soja, uma importante cultura de fixação de nitrogênio (1,68 Tg.ano-1). A entrada em razão do uso de fertilizantes nitrogenados (0,48 Tg.ano-1) ainda é incipiente em comparação com aquelas duas outras entradas mencionadas. Os maiores fluxos de saída foram o fluxo fluvial, que foi igual a 2,80 Tg.ano-1, e a exportação relacionada aos gêneros alimentícios, principalmente a transferência de soja e carne para outras regiões do País. O contínuo crescimento populacional e as elevadas taxas de urbanização podem representar novas ameaças sobre o ciclo do nitrogênio da região por meio da queima de combustíveis fósseis e do despejo de esgoto doméstico nos rios e córregos da região.

Nitrogen mass balance in the Brazilian Amazon: an update

The main purpose of this study is to perform a nitrogen budget survey for the entire Brazilian Amazon region. The main inputs of nitrogen to the region are biological nitrogen fixation occurring in tropical forests (7.7 Tg.yr-1), and biological nitrogen fixation in agricultural lands mainly due to the cultivation of a large area with soybean, which is an important nitrogen-fixing crop (1.68 Tg.yr-1). The input due to the use of N fertilizers (0.48 Tg.yr-1) is still incipient compared to the other two inputs mentioned above. The major output flux is the riverine flux, equal to 2.80 Tg.yr-1 and export related to foodstuff, mainly the transport of soybean and beef to other parts of the country. The continuous population growth and high rate of urbanization may pose new threats to the nitrogen cycle of the region through the burning of fossil fuel and dumping of raw domestic sewage in rivers and streams of the region.

O principal objetivo deste estudo é realizar um balanço do nitrogênio em toda a Região Amazônica Brasileira. As principais entradas de nitrogênio na região foram a fixação biológica do nitrogênio que ocorre nas florestas tropicais (7,7 Tg.ano-1) e a fixação biológica do nitrogênio em terras agrícolas, que ocorre principalmente devido à existência de grandes áreas de cultivo de soja, uma importante cultura de fixação de nitrogênio (1,68 Tg.ano-1). A entrada em razão do uso de fertilizantes nitrogenados (0,48 Tg.ano-1) ainda é incipiente em comparação com aquelas duas outras entradas mencionadas. Os maiores fluxos de saída foram o fluxo fluvial, que foi igual a 2,80 Tg.ano-1, e a exportação relacionada aos gêneros alimentícios, principalmente a transferência de soja e carne para outras regiões do País. O contínuo crescimento populacional e as elevadas taxas de urbanização podem representar novas ameaças sobre o ciclo do nitrogênio da região por meio da queima de combustíveis fósseis e do despejo de esgoto doméstico nos rios e córregos da região.

MONITORAMENTO DE CRYPTOSPORIDIUM E GIARDIA EM ESGOTO BRUTO E TRATADO EM UMA ESTAÇÃO DE TRATAMENTO DE ESGOTO, LONDRINA/PR, BRASIL

Cryptosporidium spp. e Giardia spp. são etiologias de doença gastrointestinal em animais e humanos, com importância em jovens e adultos. Cryptosporidium é o segundo maior causador de diarreia em crianças menores de 5 anos na África e Ásia e Giardia é o protozoário mais frequentemente encontrado em humanos. O ciclo de vida se completa em apenas um hospedeiro, a infecção ocorre pela ingestão de oocistos (Cryptosporidium) e cistos (Giardia) eliminados nas fezes de seus hospedeiros, a água e alimentos são importantes vias de transmissão. As taxas de incidência e prevalência destas protozooses em humanos no Brasil são pouco estimadas, há uma carência de estudos moleculares para o melhor entendimento da epidemiologia molecular destas protozooses. No Brasil estes protozoários já foram descritos em esgoto bruto e tratado, isto sugere uma importante circulação destes protozoários na população humana, o descarte de esgoto mesmo que tratado representa risco à saúde pública. O objetivo do presente estudo foi monitorar a ocorrência de Giardia e espécies de Cryptosporidium em esgoto bruto e tratado em uma estação de tratamento de esgoto de Londrina, Paraná. As amostras de esgoto bruto e tratado foram coletadas no período de um ano, com periodicidade quinzenal e foram concentradas por centrifugação e filtração, respectivamente. A ocorrência destes protozoários foi caracterizada por meio de extração de DNA seguida de nested-PCR, foram utilizados o gene 18S rRNA de Giardia ssp. e 18S rRNA de Cryptosporidium spp. A caracterização das espécies de Cryptosporidium foi realizada por meio de análise por polimorfismo de comprimento do fragmento de restrição (RFLP) dos produtos obtidos. Durante o período de estudo 50 amostras foram coletadas, 25 de esgoto bruto e 25 de esgoto tratado. Todas as amostras de esgoto bruto e 76% das de esgoto tratado foram positivas para Giardia spp. Cryptosporidium esteve presente em 84% das amostras de esgoto bruto e em 8% do tratado. No esgoto tratado foi encontrado apenas C. muris, já nas amostras de esgoto bruto foram detectadas cinco espécies: C. muris, C. hominis, C. baileyi, C. suis e C. parvum, em 100%, 19,04%, 9,52%, 9,52% e 4,76%, das amostras, respectivamente. A presença de espécies mistas foi observada em 19,04% das amostras. Este estudo conclui que poucos estudos no Brasil abordam a caracterização molecular destes protozoários. Há ocorrência de Giardia e Cryptosporidium em esgoto bruto e tratado em Londrina/PR. Foi possível a identificação de C. muris em esgoto tratado e cinco espécies de Cryptosporidium em esgoto bruto: C. muris, C. suis, C. hominis, C. parvum e C. baileyi, por meio da PCR-RFLP. A identificação de C. muris, C. suis e C. baileyi sugere que ocorra a contaminação do esgoto com fezes de roedores, suínos e aves. Nas amostras de esgoto bruto a ocorrência de C. hominis prevaleceu sobre C. parvum. São necessários estudos epidemiológicos, utilizando-se ferramentas moleculares, a fim de melhor entender a epidemiologia molecular de Cryptosporidium na população brasileira, além de investigar o papel de espécies como C. muris e C. suis na criptosporidiose humana.

Cryptosporidium spp. and Giardia spp. are causes of gastrointestinal diseases in animals and humans, with importance in young and adults. Cryptosporidium is second largest diarrhea-causing in children under 5 years in Africa and Asia and Giardia the parasite most found in humans. The life cycle is completed in only one host, the infection occurs by ingestion of oocysts (Cryptosporidium), and cysts (Giardia) eliminated in feces of their hosts, water and food are important routes of transmission. The incidence and prevalence of these protozoan infections in humans from Brazil are poorly estimated, there is a lack of molecular studies to better understand the molecular epidemiology of these protozoans. The presense of these protozoans in raw and treated sewage has been described in Brazil, and suggests a significant occurrence in human population, the sewage disposal even if treated causes a risk to public health. The aim of this study was to perform a surveillance in the occurrence of Giardia and species of Cryptosporidium in raw and treated sewage in a wastewater treatment plant in Londrina, Paraná. Samples of raw and treated sewage were collected within a year, bimonthly, and concentrated by means of centrifugation and filtration respectively. The occurrence of these protozoans was achieved based in DNA extraction followed by nested PCR, targeting the Giardia 16S rRNA and Cryptosporidium 18S rRNA gene. The species characterization in positive Cryptosporidium samples were performed by restriction fragment length polymorphism (RFLP). Twenty-five samples were collected of both, raw and treated sewage. For Giardia, all raw sewage samples and 76% of treated sewage were positive. Cryptosporidium was positive in 84% of raw and 8% of treated sewage. C. muris was the only species found in treated sewage, in raw sewage we found five species: C. muris, C. hominis, C. baileyi, C. parvum and C. suis in 100%, 19.04%, 9,52%, 9.52% and 4.76%, respectively. Multiple species were observed in 19.04%. This study concludes that few studies in Brazil address the molecular characterization of these protozoa. Giardia and Cryptosporidium were found in both raw and treated sewage in Londrina/PR. The identification of C. muris in treated wastewater and five species of Cryptosporidium in raw sewage: C. muris, C. suis, C. hominis, C. parvum and C. baileyi, were achieved by means of PCR -RFLP. The identification of C. muris, C. suis and C. baileyi suggests that sewage is contaminated with feces from rodents, pigs and poultry. In raw sewage the occurrence of C. hominis prevailed against C. parvum. Therefore, epidemiological studies using molecular tools are necessary in the Brazilian population in order to better understand the molecular epidemiology, and to investigate the role of species such as C. muris and C. suis in human cryptosporidiosis

Enterococcus spp., COLIFORMES E VÍBRIOS EM OSTRAS (Crassostrea rhizophorae) ADQUIDIRDAS NO MANGUE DE BARRA DE GUARATIVA RJ

As ostras do gênero Crassostrea dão origem a um alimento rico em nutrientes que são importantes para o desempenho de diversas funções no organismo humano. Os moluscos bivalves se desenvolvem no ambiente natural de forma sustentável, pois se alimentam de partículas em suspensão devido a um eficiente sistema de filtração e fixação de nutrientes. Os bivalves são considerados bioindicadores da qualidade do ambiente aquático onde vivem, uma vez que acumulam diversas bactérias, incluindo importantes patógenos que podem ser provenientes de contaminação ou da microbiota indígena estuarina ou marinha. Enquanto alimento e, sendo consumidos preferencialmente crus, permitem a veiculação de bactérias patogênicas. A ocupação desordenada das regiões estuarinas provoca intensa contaminação dos manguezais por efluentes domiciliares que pode ser estimada através da análise de bivalves extraídos destas regiões. Na presente pesquisa, foram determinados os Números Mais Prováveis (NMP) de coliformes totais, Escherichia coli e Enterococcus spp.; identificadas algumas espécies dos gêneros Enterococcus e Vibrio e foi verificado o perfil de susceptibilidade a agentes antimicrobianos de espécimes do gênero Enterococcus isoladas a partir de ostras oriundas do manguezal de Barra de Guaratiba, Rio de Janeiro. A determinação do NMP de coliformes totais, de E. coli e de Enterococcus spp. foi realizada empregando-se métodos cromogênicos rápidos. O isolamento de Enterococcus spp. foi realizado em Ágar m-enterococos a partir do crescimento nos tubos do meio cromogênico. A identificação presuntiva do gênero Enterococcus foi realizada por provas bioquímicas tradicionais. Para o isolamento e identificação presuntiva do gênero Vibrio, foi utilizada a metodologia descrita pela APHA (2001). A fim de se identificar as espécies, as cepas triadas foram analisadas pela técnica da ionização por dessorção a laser assistida por matriz e detecção de tempo de vôo com análise por espectrometria de massas (do inglês MALDI-TOF-MS). Para determinação da susceptibilidade das bactérias do gênero Enterococcus aos antimicrobianos, empregou-se a metodologia indicada pelo CLSI (2014). Pela técnica de MALDI-TOF-MS, identificou-se 75,7% das bactérias presuntivamente pertencentes ao gênero Enterococcus em nível de espécie e 21,2% em nível de gênero, mas só foram identificadas 13,5% das cepas de vibrios em nível de espécie e 70,3% em nível de gênero. Foram isoladas duas cepas de E. faecalis resistentes a três diferentes classes de antimicrobianos, incluindo resistência a altas doses de estreptomicina. Também foi isolada uma cepa de E. faecalis com resistência intermediária à vancomicina. Conforme a legislação brasileira do extinto Ministério da Pesca e Aquicultura (BRASIL, 2013), os valores encontrados para os NMP de E. coli foram indicativos da necessidade de processamento do molusco antes de sua comercialização ou seu consumo. Além da concentração de E. coli, a presença de cepas resistentes a múltiplos agentes antimicrobianos e à vancomicina é considerada um risco para o consumo in natura das ostras extraídas no manguezal de Barra de Guaratiba. Também reflete a contaminação da água e, possivelmente, de outras espécies de pescado, o que representa uma ameaça para aquele ambiente e para a saúde pública dos residentes e consumidores de pescado provenientes daquela região.

The Crassostrea spp. oysters are rich in essential nutrients for human body. In the natural environment, bivalve mollusks grow in a sustainable way since they are filter feeders and remove plankton and suspended particles from the water column using their efficient filtering system and nutrients fixation capacity. This process leads to very few residues that are expelled and used by other organisms present in the same environment. Bivalve mollusks are considered bioindicators of the environment quality because they accumulate different bacteria, including important pathogens coming from either fecal pollution or indigenous microbiota of estuarine or marine environment. As a human food, oysters are preferably consumed raw, allowing foodborne disease to occur. The unruled urban occupation of estuarine areas causes considerable contamination of mangrove by raw sewage. This contamination level can be estimated through the analysys of bivalve mollusks extracted from these areas. In the present study, Most Probable Number (MPN) of Total Coliforms, Escherichia coli and Enterococcus spp. was estimated; Enterococcus and Vibrio species were identified and the Enterococcus spp. antimicrobial susceptibility profile was evaluated for isolates obtained from Barra de Guaratiba Mangrove (Rio de Janeiro, Brazil) oysters. MPN was estimated through rapid chromogenic methods. Enterococcus spp. was isolated in m-Enterococcus agar after growth in chromogenic media. The presumptive identification of Enterococcus spp. used classical microbiological phenotypic characterization methods. The isolation and presumptive identification of Vibrio spp. were based on APHA (2001) methodology. For species identification, selected strains were analysed through matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). For the Enterococcus spp. antimicrobial susceptibility profile determination it was used the CLSI (2014) methodology. Through MALDI TOF MS, it was possible to identify the species of 75.7% of the isolates presumed to be Enterococcus spp. Another group of 21.2% of the isolates was confirmmed to be Enterococcus spp. (without positive identification of species). For presumed Vibrio spp. strains, MALDI TOF MS was able to confirm the species of 13.5% of the isolates and to confirm the genus of 70.3% of the isolates. Two E. faecalis strains were resistant to three different antimicrobial categories, including high-level resistance to streptomycin. One E. faecium strain showed intermediate resistance to vancomycin. According to the Brazilian legislation from the now extint Ministry of Fishery and Aquiculture (BRASIL, 2013), the MPN calculated for E. coli in the present study indicates the need for some oysters processing before either trade or consumption. Besides the E. coli concentration, the presence of strains that are resistant to multiple antimicrobial drugs and to vancomycin is another risk fator for the in natura (raw) consumption of the oysters from the Barra de Guaratiba Mangrove. It is also an indication for water and other fish species contamination, what represents a threat for that environment and for public health of both local residents and fish consumers.

Diversidade de bactérias, genes de resistência a quinolonas e abundância do gene intI1 em uma estação de tratamento de esgoto revelada por abordagens de cultivo e metagenômica

As quinolonas são antimicrobianos de grande relevância clínica humana e veterinária. Dentre os mecanismos de resistência as quinolonas, a aquisição de genes de resistência (qnr, aac(6)Ib-cr, qepA e OqxAB) transferidos via elementos genéticos móveis destaca-se devido ao seu potencial de disseminação interespécies. Uma grande diversidade de bactérias de origem humana, animal e ambiental são encontradas em estações de tratamento de esgotos (ETEs), onde as transferências horizontais de genes são favorecidas. Neste estudo foi investigada a presença de integron classe 1 e a diversidade bacteriana e dos genes qnrA, qnrB, qnrS e aac(6)Ib em amostras de esgoto bruto (EB) e lodos ativados (LA) coletadas na ETE Arrudas, Belo Horizonte-MG, utilizando abordagens baseadas em cultivo e metagenômica. Proteobacteria foi o filo dominante das comunidades de EB e LA. Além disso, houve uma redução de Firmicutes e um enriquecimento de Bacteroidetes em LA. Unidades operacionais taxonômicas (OTUs) relacionadas aos gêneros Neisseria, Acinetobacter e Streptococcus, foram detectadas, no entanto, foi observada uma redução de reads em LA. Células bacterianas abrigando integrons classe 1 foram encontradas, porém em menor proporção em LA. A abordagem baseada em cultivo também revelou o domínio do filo Proteobacteria em ambos os ambientes, predominando membros da família Enterobacteriaceae. As espécies mais abundantes foram Escherichia coli, Morganella morganii e Proteus mirabilis. Deve ser destacada a detecção de E. coli afiliadas aos grupos B2 e D. As Enterobactérias recuperadas de EB foram mais resistentes as quinolonas e aminoglicosídeos do que as de LA. Bactérias abrigando aac(6)Ib e seu variante cr predominaram em EB, enquanto qnrS foi encontrado apenas em LA. Destaca-se a primeira detecção dos genes qnrS em M. morganii, Providencia rettgeri e Pseudomonas guangdongensis e aac(6)Ib-cr em Alcaligenes faecalis e P. rettgeri de origem ambiental. Observou-se que esses genes exibiram baixa diversidade em ambos os ambientes, mas qnrS parece ser mais diverso que aac(6)Ib. Análises das sequências de QnrS e Aac(6)Ib revelaram diversas alterações na sequência de aminoácidos não relatadas previamente, a maioria sem uma implicação óbvia na estrutura da proteína. Os dados deste estudo alertam para a presença de bactérias resistentes as quinolonas e aminoglicosídeos em EB e LA e dos genes qnrS, aac(6)Ib e seu variante cr circulando nestes ambientes, os quais têm potencial de disseminação interespécies e poderá comprometer o uso terapêutico destes antimicrobianos.

Quinolones are antimicrobial drugs of great clinical relevance, both in human and veterinary. Among the mechanisms of quinolones resistance, the acquisition of resistance genes (qnr, aac(6)Ib-cr, qepA and OqxAB) mediated by mobile genetic elements is highlighted because of its potential of interspecies dissemination. A wide diversity of bacteria of human, animal and environmental are found in wastewater treatment plants (WWTPs), where horizontal genes transfer is favored. In this study, we investigated the abundance of class 1 integron and bacterial and qnA, qnrB, qnrS and aac(6)Ib-cr genes diversities from raw sewage (RS) and activated sludge (AS) from the WWTP Arrudas, Belo Horizonte MG, using culture-based and metagenomic approaches. Proteobacteria was the dominant phylum of RS and AS communities. Moreover, there were a reduction of Firmicutes and Bacteroidetes enrichment in AS.Operational Taxonomic units (OTUs) related to Neisseria, Acinetobacter and Streptococcus genera were detected, however, there was a reduction of reads in AS. Bacterial cells harboring class 1 integrons were found, but with a lesser proportion in AS. The culture-based approach also revealed that the Proteobacteria phyllum were dominant in both environments, with predominance of Enterobacteriaceae. The most abundant species were Escherichia coli, Morganella morganii and Proteus mirabilis. It should be noted that the E. coli detected were from phylogenetic groups B2 and D. Overall, Enterobacteriaceae isolates from RS were more resistant to quinolones and aminoglycosides than those from AS. Bacteria harboring the aac(6)Ib and its variant cr genes predominated in RS, whereas qnrS were specific from AS. It must be highlighted the first detection of qnrS genes in M. morganii, Providencia rettgeri and Pseudomonas guangdongensis and of aac(6)Ib-cr in Alcaligenes faecalis and P. rettgeri from environment source. It was observed that these genes exhibit low diversity, but the diversity of qnrS genes appear to be wider than aac(6)Ib genes. The molecular analysis of sequences obtained revealed several unprecedented amino acid changes in QnrS and Aac(6)Ib proteins, whose structural implication is not straightforward. The findings of this study warn for the presence of resistant bacteria to quinolones and aminoglycosides from RS and AS and the qnrS, aac(6)Ib and its variant cr genes circulating in these environments, which have the potential interspecies dissemination and may compromise the therapeutic use of these antimicrobials.

Avaliação da contaminação bacteriana e da ocorrência de cepas de Escherichia coli multirresistentes em ostras (Crassostrea spp.) no estado da Bahia

As ostras da espécie Crassostrea spp. são organismos de ambientes estuarinos que são empregados na culinária tradicional do estado da Bahia. O consumo destes moluscos, especialmente in natura ou subcoccionados, representa grave risco à saúde da população local e turística. Infecções bacterianas de diversas etiologias estão associadas ao consumo de bivalves. Fatores como a contaminação do ambiente aquático pelo lançamento de esgotos e falhas no controle higiênico ao longo do processo de produção são responsáveis pela presença de bactérias patogênicas, inclusive cepas multirresistentes no produto final. Objetivou-se avaliar a contaminação bacteriana em ostras e o grau de resistência à antimicrobianos das cepas isoladas. As amostras foram coletadas no litoral da Baía de Todos os Santos, região Baixo Sul e na cidade de Salvador, no estado da Bahia. Foram pesquisados patógenos indicadores de contaminação ambiental (Índice colimétrico e Escherichia coli), indicadores de falhas de manipulação (Staphylococcus spp.) e bactérias potencialmente patogênicas (Vibrio spp. e Salmonella spp.). No período de agosto de 2013 a agosto de 2014 foram coletadas um total de 60 pools de amostras de ostras in natura e beneficiadas. As espécies isoladas com maior frequência foram Escherichia coli (34/60) (57,52%), Staphylococcus spp. (31/60) (52,54%) e Vibrio spp. (30/60) (50%), seguida das espécies Plesiomonas shigeloides (3/60) (5,08%), Salmonella spp. (2/60) (3,4%), Aeromonas hydrophila (2/60) (3,4%). Cepas isoladas de E. coli foram testadas em antibiograma com dez antimicrobianos. Dez cepas de E. coli (62,5%) apresentaram multirresistência, com Índice de Múltipla Resistência (MAR) de 0,3 a 0,5. A resistência bacteriana foi observada com mais frequência ao Imipenem (81,25%), seguido de ceftazidima (50%), ampicilina (37,5%) e cepamina (31,25%). Não foi observada resistência ao cloranfenicol e ciprofloxacina. Desta forma, evidencia-se a baixa qualidade higiênico-sanitária das ostras analisadas, expondo a população a infecções bacterianas, inclusive por patógenos multirresistentes, demonstrando a necessária requalificação da cadeia produtiva da ostra, incluindo redução da poluição da água, qualificação profissional dos trabalhadores e modernização da infraestrutura e equipamentos.

Oysters from the species Crassostrea spp. are organisms that come from estuary environments and are used in the traditional cuisine in the state of Bahia. The consumption of these mollusks, especially in natura or under-cooked, represents a grave risk to the health of the local and tourist population. Bacterial infections of several etiologies are associated with the consumption of bivalves. Factors such as contamination of the aquatic environment resulting from the channeling of sewage and also failures in the hygienic control throughout the process of production are responsible for the presence of pathogenic bacteria, including multi-resistant strains in the final product. The current study evaluated the bacterial contamination in oysters and the degree of resistance to anti- microbial agents of the isolated strains. The samples were collected along the coast of Baía de Todos os Santos and the region known as the Baixo Sul and in the city of Salvador, in the state of Bahia. Pathogens which are indicators of environmental contamination (Coli-metric Index and Escherichia coli), indicators for failures in manipulation (Staphylococcus spp.) and potentially pathogenic bacteria (Vibrio spp. and Salmonella spp.) were tested. In the period between August 2013 and August 2014, a total of 60 pools of raw and treated oyster samples were collected. The most frequent isolated species were Escherichia coli (34/60) (57,52%), Staphylococcus spp. (31/60) (52,54%) e Vibrio spp. (30/60) (50%), seguida das espécies Plesiomonas shigeloides (3/60) (5,08%), Salmonella spp. (2/60) (3,4%), Aeromonas hydrophila (2/60) (3,4%). Isolated strains of E. coli were tested in antidiogram with ten anti-microbial agents. Ten strains of E. coli (62,5%) showed multi-resistance with the Multiple Resistance Index (MAR) of 0.3 to 0.5. The bacterial resistance observed with most frequency was to Imipenem (81.25%), followed by ceftazidima (50%), ampiciline (37.5%) and cepamine (31.25%). No resistance was observed to cloramphenicol and ciprofloxacina. These results show the low hygienic-sanitary quality in the oysters which were examined, thus exposing the population to bacterial infections, including multi-resistant pathogens, and is evidence of the necessity to re-qualify the productive chain of oysters, including the reduction of the water pollution, the Professional training of the workers and the modernization of infrastructure and equipment.

Morphology of Parastrongylidium estevesi comb. nov. and Deviata brasiliensis sp. nov. (Ciliophora: Stichotrichia) from a sewage treatment plant in Rio de Janeiro, Brazil

In samples of raw sewage collected from a sewage treatment plant in Rio de Janeiro (ETE-Penha), we found populations of two species, Deviata estevesi Paiva & Silva-Neto, 2005 and Deviata brasiliensis sp. nov. The organisms were studied in vivo under phase contrast microscopy, differential interference contrast (DIC), and after protargol-impregnation. The population of D. estevesi exhibited more extensive variation in cirral pattern than previously described. The interphasic organisms of new species D. brasiliensis sp. nov. are distinguishable from their congeners based on a series of morphometric features: cirral row R3 usually presents 1-3 cirri behind the right frontal cirrus, on average there are four macronuclear nodules, and, during morphogenesis of cell division, primordium V of the proter originates from the anterior region of cirral row R5 instead of row R6, as in the type species D. abbrevescens Eigner, 1995. In D. estevesi, the ventral cirral rows replicate by within-row primordia, which develop independently for the proter and for the opisthe, suggesting that it belongs to or is closely related to Parastrongylidium, hence the combination P. estevesi comb. nov. is established.

Morphology of Parastrongylidium estevesi comb. nov. and Deviata brasiliensis sp. nov. (Ciliophora: Stichotrichia) from a sewage treatment plant in Rio de Janeiro, Brazil

In samples of raw sewage collected from a sewage treatment plant in Rio de Janeiro (ETE-Penha), we found populations of two species, Deviata estevesi Paiva & Silva-Neto, 2005 and Deviata brasiliensis sp. nov. The organisms were studied in vivo under phase contrast microscopy, differential interference contrast (DIC), and after protargol-impregnation. The population of D. estevesi exhibited more extensive variation in cirral pattern than previously described. The interphasic organisms of new species D. brasiliensis sp. nov. are distinguishable from their congeners based on a series of morphometric features: cirral row R3 usually presents 1-3 cirri behind the right frontal cirrus, on average there are four macronuclear nodules, and, during morphogenesis of cell division, primordium V of the proter originates from the anterior region of cirral row R5 instead of row R6, as in the type species D. abbrevescens Eigner, 1995. In D. estevesi, the ventral cirral rows replicate by within-row primordia, which develop independently for the proter and for the opisthe, suggesting that it belongs to or is closely related to Parastrongylidium, hence the combination P. estevesi comb. nov. is established.

Morphology of Parastrongylidium estevesi comb. nov. and Deviata brasiliensis sp. nov. (Ciliophora: Stichotrichia) from a sewage treatment plant in Rio de Janeiro, Brazil

In samples of raw sewage collected from a sewage treatment plant in Rio de Janeiro (ETE-Penha), we found populations of two species, Deviata estevesi Paiva & Silva-Neto, 2005 and Deviata brasiliensis sp. nov. The organisms were studied in vivo under phase contrast microscopy, differential interference contrast (DIC), and after protargol-impregnation. The population of D. estevesi exhibited more extensive variation in cirral pattern than previously described. The interphasic organisms of new species D. brasiliensis sp. nov. are distinguishable from their congeners based on a series of morphometric features: cirral row R3 usually presents 1-3 cirri behind the right frontal cirrus, on average there are four macronuclear nodules, and, during morphogenesis of cell division, primordium V of the proter originates from the anterior region of cirral row R5 instead of row R6, as in the type species D. abbrevescens Eigner, 1995. In D. estevesi, the ventral cirral rows replicate by within-row primordia, which develop independently for the proter and for the opisthe, suggesting that it belongs to or is closely related to Parastrongylidium, hence the combination P. estevesi comb. nov. is established.