Antral follicle count classification selects fertile heifers without influencing the carcass traits / A classificação da contagem folicular antral seleciona novilhas mais férteis sem influenciar as características da carcaça

This study aimed to evaluate the ovarian structure, estrus intensity, ultrasound carcass measurements, and pregnancy rate of Nelore breed heifers and cows in accordance with antral follicle counts (AFCs). We evaluated 503 heifers and 565 Nelore cows, with a mean age of 15.5±2.2 and 69.8±36.1 months, respectively, submitted to a fixed-time artificial insemination (FTAI) protocol. On day zero, all bovine females were examined using ultrasound to determine the AFC. The mean AFC of the heifers and cows were 20±8.6 and 22.5±8.4, respectively. The rib-eye area (REA) and fat thickness (FT) of the heifers (n = 119 for REA and n = 219 for FT) were measured using ultrasound imaging. The average conception rates at the first FTAI and at the end of the breeding season were 35.8% and 57.5%, respectively, for heifers and 45.1% and 78.9%, respectively, for cows. We demonstrated that the probability of pregnancy at the first FTAI and at the end of the breeding season for both young heifers and cows increased as the AFC decreased (P>0.001 and P=0.0123, respectively). FT and REA showed no correlation with AFC in heifers. The intensity of estrus expression was negatively correlated with AFC (−0.46; P<0.0001). In conclusion, Nelore heifers and cows with low AFC had a high probability of pregnancy during the entire breeding season. Thus, AFC can be used as a tool to select heifers with increased fertility without affecting carcass traits (REA and FT).

Este estudo teve como objetivo avaliar as estruturas ovarianas, intensidade do cio, medidas de carcaça por ultrassonografia e taxa de gestação de novilhas e vacas da raça Nelore com diferentes contagens de folículos antrais (CFA). Avaliamos 503 novilhas e 565 vacas Nelore, com idade média de 15,5 ± 2,2 e 69,8 ± 36,1 meses, respectivamente, submetidas a um protocolo de inseminação artificial em tempo fixo (IATF). No dia zero, todas as fêmeas foram examinadas por ultrassom para determinar a CFA. A CFA média das novilhas foi de 20 ± 8,6 e a das vacas foi de 22,5 ± 8,4 folículos. A área de olho de lombo (AOL) e a espessura de gordura (EG) das novilhas (n = 119 para AOL e n = 219 para EG) foram medidas utilizando imagens ultrassonográficas. As taxas médias de concepção na primeira IATF e no final da estação de monta foram de 35,8% e 57,5% e 45,1% e 78,9% para as novilhas e vacas, respectivamente. Demonstramos que a probabilidade de gestação na primeira IATF e no final da estação de monta, tanto para novilhas jovens quanto para vacas, foi maior quando a CFA era menor (P>0,001 e P=0,0123, respectivamente). A espessura da gordura e a AOL não mostraram nenhuma correlação com a CFA. A intensidade da expressão do cio foi negativamente correlacionada com o CFA (-0,46; P < 0,0001). Em conclusão, novilhas jovens e vacas da raça Nelore com menor CFA apresentam maior probabilidade de prenhez durante toda a estação de monta. Nenhuma relação entre a CFA e as características de carcaça foram observadas em novilhas Nelore. A CFA pode ser usada como uma ferramenta de seleção de novilhas com maior fertilidade sem influenciar as características de carcaça (AOL e EG).

Genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Tabapuã cattle

We aimed to estimate genetic parameters for growth, reproductive, and carcass traits in Tabapuã cattle. Phenotypic data were collected between 1990 and 2019 in 1,218 farms, and the pedigree file had 340,868 animals. The traits evaluated were body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365), and 550 (W550) days of age; age at first calving (AFC), scrotal circumference at 365 days of age (SC365), ribeye area (REA), backfat thickness (BF), and rump fat thickness (RF). The (co)variance components were estimated using the restricted maximum likelihood method, considering single and two-traits animal models. For all traits, the models considered fixed, direct additive genetic, and residual random effects. In addition, for W120 and W210, the maternal additive genetic and maternal permanent environmental effects were also included. Heritabilities for W120, W210, W365, W550, SC365, REA, BF, and RF were of moderate magnitude (0.15, 0.16, 0.23, 0.19, 0.22, 0.36, 0.31, and 0.27, respectively). Low heritability was observed for AFC (0.07). The genetic correlations between growth traits were higher than 0.90, while AFC and SC365 presented negative moderate correlation (−0.66). The REA showed low genetic correlations with BF (0.07) and RF (0.07), whereas BF and RF were highly correlated (0.77). Considering the heritability estimates, selection for AFC would result in limited genetic gain, while for the other traits, it would be satisfactory. Based on the high genetic correlations between growth traits, selection of Tabapuã animals can be performed at younger ages. Additionally, animals can be indirectly selected for AFC through SC365, and only one fat thickness trait may be used in the selection process considering the high genetic correlation and similar heritability values for BF and RF.(AU)

Effect of dietary addition of phenolic compounds from propolis on growth performance, carcass traits, and meat fatty acid profile of feedlot beef cattle / Efeito da adição de compostos fenólicos da própolis na ração sobre o desempenho produtivo, características de carcaça e perfil de ácidos graxos da carne de bovinos confinados

Twenty-four male Nellore steers (445 ± 31 kg initial body weight) were used to evaluate the effects of different doses of phenolic compounds from a propolis-based product (PBP) on growth performance, carcass traits, and meat fatty acid (FA) profile. The total mixed ration consisted of 470 g kg-1 corn silage and 530 g kg-1 concentrate (dry matter [DM] basis), which were randomly assigned to one of three treatments: control (CON, without phenolic compounds from the propolis extract), PBP1 (225 mg of phenolic compounds g-1 of propolis dry extract), and PBP2 (300 mg of phenolic compounds g-1 of propolis dry extract). The animals were fed in a feedlot for 84 days and presented an average final body weight (FBW) of 542 kg. Dietary addition of phenolic compounds had no overall effect on growth performance. Mean values for dry matter intake, average daily gain and feed conversion ratio were 9.99 kg d-1, 1.14 kg d-1 and 8.82 kg DM kg gain-1, respectively. Hot carcass weight and hot carcass yield had average values of 308 kg and 56.8%, respectively. In addition, carcass traits did not change after PBPs were added to the diet, except for the ribeye area, which was higher for PBP2 (21.5 cm2 100 kg-1) than for PBP1 (18.6 cm2 100 kg-1). Dietary addition of PBPs maintained redness better than the controls after 9 days in the refrigerator; no major changes were observed in the meat FA profile after the addition of PBPs to the diet. These results suggest that phenolic compounds present in propolis (300 mg g-1) have positive effects on meat color and improve the sensory quality of meat.(AU)

Foram utilizados vinte e quatro novilhos da raça Nelore (445 ± 31 kg de peso corporal inicial) para avaliar o efeito de diferentes doses de compostos fenólicos obtidos a partir de produto a base de própolis (PBP) sobre o desempenho produtivo, características de carcaça e perfil de ácidos graxos (AG). A ração total foi constituída em 470 g kg-1 de silagem de milho e 530 g kg-1 de concentrado (com base na matéria seca) e os animais foram distribuídos nos seguintes tratamentos: controle (CON, sem compostos fenólicos do extrato seco de própolis), PBP1 (225 de compostos fenólicos g-1 de extrato seco de própolis) e PBP2 (300 mg de compostos fenólicos g-1 de extrato seco de própolis). Os animais foram alimentados em confinamento por 84 dias e apresentaram peso corporal final médio de 542 kg. A adição dos compostos fenólicos da própolis na ração não influenciou o desempenho produtivo. Os valores médios para consumo de matéria seca, ganho médio diário e conversão alimentar foram 9,99 kg d-1, 1,14 kg d-1 e 8,82 kg MS kg ganho-1, respectivamente. O peso de carcaça quente e o rendimento de carcaça quente apresentaram valores médios de 308 kg e 56,8%; respectivamente. Além disso, as características da carcaça não foram alteradas após a adição dos PBPs à dieta, exceto para a área de olho de lombo, que foi maior para o tratamento PBP2 (21,5 cm2 100 kg-1) quando comparada ao PBP1 (18,6 cm2 100 kg-1). A adição dos PBPs manteve a carne mais vermelha do que o CON após 9 dias na geladeira; não foram observadas grandes alterações no perfil de AG da carne após a adição dos PBPs à dieta. Os resultados sugerem que os compostos fenólicos presentes na própolis (300 mg g-1) têm efeitos positivos na coloração da carne, melhorando sua qualidade sensorial.(AU)

Characteristics of carcass and non-carcass components of lambs fed wet brewery waste as a roughage feed / Características da carcaça e dos componentes não-carcaça de cordeiros alimentados com resíduo úmido de cervejaria como alimento volumoso

The objective of the present study was to evaluate the effect of including wet brewery waste (WBW) as the exclusive dietary roughage source on the characteristics of carcass and non-carcass components of feedlot-finished lambs. Thirty-two non-castrated male lambs weaned at 50 days of age, resulting from the cross between the Texel and Ile de France breeds, were used. The diet was constituted by roughage (WBW) and a concentrate composed of crushed maize, soybean meal, limestone and common salt. Treatments consisted of four levels of WBW as the roughage source in the diet (% dry matter), namely, 31, 44, 57 and 70%. Lambs were slaughtered upon reaching 34 kg live weight. The treatments resulted in a linear decrease in hot and cold carcass weights and yields, carcass compactness index, conformation, degree of fatness and rib-eye area. Among the primal cuts, the absolute weights of pallet, ribs and legs decreased as the WBW level was increased. As to the non-carcass components, only the total gastrointestinal content increased linearly with WBW. The increasing levels of WBW led to greater fasting losses and reduced carcass weights and yields. There was also a reduction in the degree of fatness, carcass compactness, carcass conformation index and rib-eye area Wet brewery waste at the concentration of 31% as the roughage source in the diet of finishing lambs in the feedlot provides better carcass traits.

O objetivo do presente trabalho foi avaliar o efeito da inclusão de resíduo úmido de cervejaria (RUC) como fonte exclusiva de volumoso sobre as características da carcaça e dos componentes não-carcaça de cordeiros terminados em confinamento. Foram utilizados 32 cordeiros, machos, não castrados, desmamados com 50 dias de idade e provenientes de cruzamento entre as raças Texel e Ile de France. A dieta foi composta por volumoso, sendo este o RUC, e por concentrado composto de milho desintegrado, farelo de soja, calcário calcítico e sal comum. Os tratamentos foram constituídos por quatro teores de RUC como volumoso da dieta (% da MS), sendo: 31, 44, 57 e 70%. Os cordeiros foram abatidos quando atingiram 34 kg de peso vivo. Os tratamentos exerceram influência negativa de maneira linear decrescente sobre os pesos e rendimentos de carcaça quente e fria, índice de compacidade de carcaça, conformação, estado de engorduramento e área de olho de lombo. Entre os cortes comerciais, a medida que aumentou o nível de RUC diminuíram os pesos absolutos de paleta, costilhar e perna. Quando avaliados os componentes não-carcaça, verificou-se que apenas o conteúdo gastrointestinal total aumentou linearmente com a elevação do teor de RUC. O aumento da inclusão de RUC levou a maiores perdas por jejum e reduziu os pesos e rendimentos de carcaça. Também ocorreu redução no estado de engorduramento, no índice de compacidade e conformação da carcaça, bem como da área de olho de lombo. O teor de 31% de RUC como alimento volumoso na terminação de cordeiros em confinamento proporcionou melhores características na carcaça dos animais.

Characteristics of carcass and non-carcass components of lambs fed wet brewery waste as a roughage feed / Características da carcaça e dos componentes não-carcaça de cordeiros alimentados com resíduo úmido de cervejaria como alimento volumoso

The objective of the present study was to evaluate the effect of including wet brewery waste (WBW) as the exclusive dietary roughage source on the characteristics of carcass and non-carcass components of feedlot-finished lambs. Thirty-two non-castrated male lambs weaned at 50 days of age, resulting from the cross between the Texel and Ile de France breeds, were used. The diet was constituted by roughage (WBW) and a concentrate composed of crushed maize, soybean meal, limestone and common salt. Treatments consisted of four levels of WBW as the roughage source in the diet (% dry matter), namely, 31, 44, 57 and 70%. Lambs were slaughtered upon reaching 34 kg live weight. The treatments resulted in a linear decrease in hot and cold carcass weights and yields, carcass compactness index, conformation, degree of fatness and rib-eye area. Among the primal cuts, the absolute weights of pallet, ribs and legs decreased as the WBW level was increased. As to the non-carcass components, only the total gastrointestinal content increased linearly with WBW. The increasing levels of WBW led to greater fasting losses and reduced carcass weights and yields. There was also a reduction in the degree of fatness, carcass compactness, carcass conformation index and rib-eye area Wet brewery waste at the concentration of 31% as the roughage source in the diet of finishing lambs in the feedlot provides better carcass traits.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi avaliar o efeito da inclusão de resíduo úmido de cervejaria (RUC) como fonte exclusiva de volumoso sobre as características da carcaça e dos componentes não-carcaça de cordeiros terminados em confinamento. Foram utilizados 32 cordeiros, machos, não castrados, desmamados com 50 dias de idade e provenientes de cruzamento entre as raças Texel e Ile de France. A dieta foi composta por volumoso, sendo este o RUC, e por concentrado composto de milho desintegrado, farelo de soja, calcário calcítico e sal comum. Os tratamentos foram constituídos por quatro teores de RUC como volumoso da dieta (% da MS), sendo: 31, 44, 57 e 70%. Os cordeiros foram abatidos quando atingiram 34 kg de peso vivo. Os tratamentos exerceram influência negativa de maneira linear decrescente sobre os pesos e rendimentos de carcaça quente e fria, índice de compacidade de carcaça, conformação, estado de engorduramento e área de olho de lombo. Entre os cortes comerciais, a medida que aumentou o nível de RUC diminuíram os pesos absolutos de paleta, costilhar e perna. Quando avaliados os componentes não-carcaça, verificou-se que apenas o conteúdo gastrointestinal total aumentou linearmente com a elevação do teor de RUC. O aumento da inclusão de RUC levou a maiores perdas por jejum e reduziu os pesos e rendimentos de carcaça. Também ocorreu redução no estado de engorduramento, no índice de compacidade e conformação da carcaça, bem como da área de olho de lombo. O teor de 31% de RUC como alimento volumoso na terminação de cordeiros em confinamento proporcionou melhores características na carcaça dos animais.(AU)

Fiber composition and digestibility of fodder in different ryegrass fields submitted to different harvesting management systems / [Composição da fibra e digestibilidade da forragem de diferentes cultivares de azevém submetidos a diferentes sistemas de manejo de colheita]

This essay aims to evaluate the composition of fiber in neutral detergent, digestibility of plant components, as well as ruminal disappearance rate of fodder dry matter from five ryegrass fields submitted to different cut systems for the production of haylage. The experimental design was the randomized blocks one, at a 5 x 3 factorial scheme, with five cultivars (cv.) of ryegrass Lolium multiflorum (cv. Barjumbo, cv. BarHQ, cv. Ribeye, cv. Potro and cv. Willians) associated with three harvesting management systems: 1- single harvesting system at a pre-floral stage; 2 - double harvesting system, with a cut at vegetative stage and another at pre-floral stage; and 3 - triple harvesting system, with a cut at vegetative stage, a cut at full vegetative stage and a cut at pre-floral stage, with three repetitions each. Similarities were noticed on the results of fodder digestibility of different fields, however, cv. Potro presented a higher ruminal disappearance rate after 48 hours, with 69.27%. Generally, the harvesting management system with the increase of ryegrass cut frequency determined increments on the percentage of lignin and the reduction in the concentration of total nutrients and dry matter digestibility of the resulting hylage.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi avaliar a composição da fibra em detergente neutro, digestibilidade dos componentes da planta, bem como a taxa de desaparecimento ruminal da matéria seca da forragem de cinco cultivares de azevém submetidos a diferentes sistemas de cortes para produção de silagem pré-secada. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso,, em um fatorial 5 x 3, sendo cinco cultivares de azevém Lolium multiflorum (cv. Barjumbo, cv. BarHQ, cv. Ribeye, cv. Potro e cv. Willians) associados a três sistemas de manejo de colheita: 1 - sistema com única colheita no estádio de pré-florescimento; 2 - sistema com uma colheita no estádio vegetativo e outra no estádio de pré-florescimento; e 3 - sistema com uma colheita no estádio vegetativo, uma no estádio pleno vegetativo e outra no estádio de pré-florescimento, com três repetições cada. Notou-se similaridade entre os resultados de digestibilidade da forragem entre os cultivares, porém o cv. Potro apresentou a maior taxa de desaparecimento ruminal após 48 horas, com 69,27%. De maneira geral, o sistema de manejo de colheita mostrou que o aumento do número de cortes do azevém determinou incrementos nos teores de lignina e redução na concentração de nutrientes digestíveis totais e da digestibilidade da matéria seca nas silagens pré-secadas resultantes.(AU)

Fiber composition and digestibility of fodder in different ryegrass fields submitted to different harvesting management systems / [Composição da fibra e digestibilidade da forragem de diferentes cultivares de azevém submetidos a diferentes sistemas de manejo de colheita]

This essay aims to evaluate the composition of fiber in neutral detergent, digestibility of plant components, as well as ruminal disappearance rate of fodder dry matter from five ryegrass fields submitted to different cut systems for the production of haylage. The experimental design was the randomized blocks one, at a 5 x 3 factorial scheme, with five cultivars (cv.) of ryegrass Lolium multiflorum (cv. Barjumbo, cv. BarHQ, cv. Ribeye, cv. Potro and cv. Willians) associated with three harvesting management systems: 1- single harvesting system at a pre-floral stage; 2 - double harvesting system, with a cut at vegetative stage and another at pre-floral stage; and 3 - triple harvesting system, with a cut at vegetative stage, a cut at full vegetative stage and a cut at pre-floral stage, with three repetitions each. Similarities were noticed on the results of fodder digestibility of different fields, however, cv. Potro presented a higher ruminal disappearance rate after 48 hours, with 69.27%. Generally, the harvesting management system with the increase of ryegrass cut frequency determined increments on the percentage of lignin and the reduction in the concentration of total nutrients and dry matter digestibility of the resulting hylage.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi avaliar a composição da fibra em detergente neutro, digestibilidade dos componentes da planta, bem como a taxa de desaparecimento ruminal da matéria seca da forragem de cinco cultivares de azevém submetidos a diferentes sistemas de cortes para produção de silagem pré-secada. O delineamento experimental foi em blocos ao acaso,, em um fatorial 5 x 3, sendo cinco cultivares de azevém Lolium multiflorum (cv. Barjumbo, cv. BarHQ, cv. Ribeye, cv. Potro e cv. Willians) associados a três sistemas de manejo de colheita: 1 - sistema com única colheita no estádio de pré-florescimento; 2 - sistema com uma colheita no estádio vegetativo e outra no estádio de pré-florescimento; e 3 - sistema com uma colheita no estádio vegetativo, uma no estádio pleno vegetativo e outra no estádio de pré-florescimento, com três repetições cada. Notou-se similaridade entre os resultados de digestibilidade da forragem entre os cultivares, porém o cv. Potro apresentou a maior taxa de desaparecimento ruminal após 48 horas, com 69,27%. De maneira geral, o sistema de manejo de colheita mostrou que o aumento do número de cortes do azevém determinou incrementos nos teores de lignina e redução na concentração de nutrientes digestíveis totais e da digestibilidade da matéria seca nas silagens pré-secadas resultantes.(AU)

Carcass traits and meat quality of steers on pasture submitted to different dietary supplementation / Características de carcaça e qualidade de carne de novilhos submetidos a diferentes estratégias de suplementação

This study aimed at evaluating carcass traits and meat quality of Nellore steers on pasture submitted to different dietary supplementation strategies. The 32 Nellore animals tested (8 ± 0.6 months) were raised under rotational grazing on Brachiaria brizantha cv. Piatã (syn. Urochloa brizantha cv. Piatã) pasture and distributed in four treatments: supply of mineral salt ad libitum in the growth and finishing phases (MSGF); concentrate supplementation only during the growth phase (CG); concentrate supplementation only during the finishing phase (CF) and concentrate supplementation the growth and finishing phases (CGF). The concentrated supplement was supplied at 0.5% of body weight and mineral ad libitum. The steers were slaughtered when more than 50% of the lot of each treatment reached 450 kg body weight. The mean the hot and cold carcass weight and subcutaneous fat thickness did not differ between treatments (P > 0.05). The calves the treatment CF and CGF showed a larger rib-eye area and higher ether extract levels in the Longissimus dorsi muscle than in MSGF and CG (P 0.05). The use of feeding strategies on pasture with concentrate supplementation in the growth and finishing phases of Nellore cattle anticipates slaughter in 92 days and produces carcasses and meat with satisfactory traits.

Objetivou-se avaliar as características de carcaça e qualidade de carne de novilhos Nelore submetidos à diferentes estratégias de suplementação à pasto. Foram utilizados 32 bezerros Nelore (idade inicial de 8 ± 0,6 meses) mantidos em pastagem Brachiaria brizantha cv. Piatã (syn. Urochloa brizantha cv. Piatã) manejados em sistema rotacionado e distribuídos em quatro tratamentos: suplementação com sal mineral durante a recria e terminação (MSGF), suplementação com concentrado somente na fase de recria (CG), suplementação com concentrado somente na fase de terminação (CF) e suplementação concentrada durante a recria e terminação (CGF). O suplemento concentrado foi fornecido a 0,5% do peso corporal e o mineral ad libitum. Os animais foram abatidos quando mais de 50% do lote de cada tratamento atingiu 450 kg de peso corporal. Não foram observadas diferenças significativas entre as médias de peso da carcaça quente e fria e a espessura de gordura subcutânea de novilhos entre os tratamentos (P > 0,05). Os animais do tratamento CF e CGF apresentaram maior área de olho de lombo e maior teor de extrato etéreo no músculo Longissimus dorsi do que os tratamentos MSGF e CG (P 0,05). O uso de estratégias de suplementação concentrada na fase de recria e terminação para novilhos Nelore criados à pasto pode antecipar o abate em até 92 dias, melhorar a composição física da carcaça e carne e garantir a produção de carcaças com características satisfatórias.

Carcass traits and meat quality of steers on pasture submitted to different dietary supplementation / Características de carcaça e qualidade de carne de novilhos submetidos a diferentes estratégias de suplementação

This study aimed at evaluating carcass traits and meat quality of Nellore steers on pasture submitted to different dietary supplementation strategies. The 32 Nellore animals tested (8 ± 0.6 months) were raised under rotational grazing on Brachiaria brizantha cv. Piatã (syn. Urochloa brizantha cv. Piatã) pasture and distributed in four treatments: supply of mineral salt ad libitum in the growth and finishing phases (MSGF); concentrate supplementation only during the growth phase (CG); concentrate supplementation only during the finishing phase (CF) and concentrate supplementation the growth and finishing phases (CGF). The concentrated supplement was supplied at 0.5% of body weight and mineral ad libitum. The steers were slaughtered when more than 50% of the lot of each treatment reached 450 kg body weight. The mean the hot and cold carcass weight and subcutaneous fat thickness did not differ between treatments (P > 0.05). The calves the treatment CF and CGF showed a larger rib-eye area and higher ether extract levels in the Longissimus dorsi muscle than in MSGF and CG (P < 0.05). Mean shearing force was similar between treatments (P > 0.05). The use of feeding strategies on pasture with concentrate supplementation in the growth and finishing phases of Nellore cattle anticipates slaughter in 92 days and produces carcasses and meat with satisfactory traits.(AU)

Objetivou-se avaliar as características de carcaça e qualidade de carne de novilhos Nelore submetidos à diferentes estratégias de suplementação à pasto. Foram utilizados 32 bezerros Nelore (idade inicial de 8 ± 0,6 meses) mantidos em pastagem Brachiaria brizantha cv. Piatã (syn. Urochloa brizantha cv. Piatã) manejados em sistema rotacionado e distribuídos em quatro tratamentos: suplementação com sal mineral durante a recria e terminação (MSGF), suplementação com concentrado somente na fase de recria (CG), suplementação com concentrado somente na fase de terminação (CF) e suplementação concentrada durante a recria e terminação (CGF). O suplemento concentrado foi fornecido a 0,5% do peso corporal e o mineral ad libitum. Os animais foram abatidos quando mais de 50% do lote de cada tratamento atingiu 450 kg de peso corporal. Não foram observadas diferenças significativas entre as médias de peso da carcaça quente e fria e a espessura de gordura subcutânea de novilhos entre os tratamentos (P > 0,05). Os animais do tratamento CF e CGF apresentaram maior área de olho de lombo e maior teor de extrato etéreo no músculo Longissimus dorsi do que os tratamentos MSGF e CG (P < 0,05). As médias de força de cisalhamento foram similares entre os tratamentos (P > 0,05). O uso de estratégias de suplementação concentrada na fase de recria e terminação para novilhos Nelore criados à pasto pode antecipar o abate em até 92 dias, melhorar a composição física da carcaça e carne e garantir a produção de carcaças com características satisfatórias.(AU)

Performance, carcass and meat characteristics of two cattle categories finished on pasture during the dry season with supplementation in different forage allowance / Desempenho, características da carcaça e carne de duas categorias de bovinos de corte terminados em pastagem durante a estação seca com suplementação em diferentes ofertas de forragem

The objective this paper was to evaluate the effect of two categories of beef finished in pasture with supplementation with two herbage allowance on performance, carcass and meat characteristics. Thirty-six Guzera cattle were used, 18 steers and 18 heifers with an initial age of 20 months. There was significant difference in daily weight gain for animal category and the herbage allowance, which were higher in males and animals submitted to high herbage allowance. Steers showed higher final weight, carcass weight and forequarter yield compared with the heifers, although the hindquarter yield was higher in the heifers, however the herbage allowance did not influence these characteristics. There were not statistical differences for carcass yield, ribeye area, backfat thickness and marbling score for the animal categories and herbage allowance. The meat chemical composition of the steers did not differ of the heifers, however, the animals submitted to high herbage allowance was increase in ether extract and pH, decrease in protein percentage. It was concluded that the animal category and the herbage allowance changed the animal performance, improving performance in males and cattle submitted to high herbage allowance.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi avaliar o efeito de duas categorias de bovinos terminados em pastagem com suplementação em duas ofertas de forragem no desempenho, na qualidade da carcaça e da carne. Foram utilizados 36 bovinos Guzerá, 18 novilhos e 18 novilhas, com idade inicial de 20 meses de idade. Observou-se diferença significativa no ganho de peso diário para categoria animal e ofertas de forragem, que foram superiores nos machos e nos animais submetidos à oferta alta de forragem. Os novilhos apresentaram maior peso final, peso de carcaça e rendimento de dianteiro em comparação com as novilhas, embora o rendimento do traseiro tenha sido maior para as novilhas, entretanto as ofertas de forragem não influenciaram essas características. Não houve diferenças estatísticas para rendimento de carcaça, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea e marmorização para categorias de animais e ofertas de forragem. Quanto à composição química, a carne de novilhos não diferiu das novilhas. Os animais submetidos à alta oferta de forragem tiveram aumento no extrato etéreo e pH, redução na porcentagem de proteína. Conclui-se que a categoria animal e os níveis de forragem alteram o desempenho animal, melhorando, assim, o desempenho nos machos e nos bovinos submetidos à alta oferta de forragem.(AU)

Performance, carcass and meat characteristics of two cattle categories finished on pasture during the dry season with supplementation in different forage allowance / Desempenho, características da carcaça e carne de duas categorias de bovinos de corte terminados em pastagem durante a estação seca com suplementação em diferentes ofertas de forragem

The objective this paper was to evaluate the effect of two categories of beef finished in pasture with supplementation with two herbage allowance on performance, carcass and meat characteristics. Thirty-six Guzera cattle were used, 18 steers and 18 heifers with an initial age of 20 months. There was significant difference in daily weight gain for animal category and the herbage allowance, which were higher in males and animals submitted to high herbage allowance. Steers showed higher final weight, carcass weight and forequarter yield compared with the heifers, although the hindquarter yield was higher in the heifers, however the herbage allowance did not influence these characteristics. There were not statistical differences for carcass yield, ribeye area, backfat thickness and marbling score for the animal categories and herbage allowance. The meat chemical composition of the steers did not differ of the heifers, however, the animals submitted to high herbage allowance was increase in ether extract and pH, decrease in protein percentage. It was concluded that the animal category and the herbage allowance changed the animal performance, improving performance in males and cattle submitted to high herbage allowance.(AU)

O objetivo do presente trabalho foi avaliar o efeito de duas categorias de bovinos terminados em pastagem com suplementação em duas ofertas de forragem no desempenho, na qualidade da carcaça e da carne. Foram utilizados 36 bovinos Guzerá, 18 novilhos e 18 novilhas, com idade inicial de 20 meses de idade. Observou-se diferença significativa no ganho de peso diário para categoria animal e ofertas de forragem, que foram superiores nos machos e nos animais submetidos à oferta alta de forragem. Os novilhos apresentaram maior peso final, peso de carcaça e rendimento de dianteiro em comparação com as novilhas, embora o rendimento do traseiro tenha sido maior para as novilhas, entretanto as ofertas de forragem não influenciaram essas características. Não houve diferenças estatísticas para rendimento de carcaça, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea e marmorização para categorias de animais e ofertas de forragem. Quanto à composição química, a carne de novilhos não diferiu das novilhas. Os animais submetidos à alta oferta de forragem tiveram aumento no extrato etéreo e pH, redução na porcentagem de proteína. Conclui-se que a categoria animal e os níveis de forragem alteram o desempenho animal, melhorando, assim, o desempenho nos machos e nos bovinos submetidos à alta oferta de forragem.(AU)

Estimate of genetic parameters for carcass traits and visual scores inmeat sheep using Bayesian inference via threshold and linear models

ABSTRACT: The aim of this study was to estimate the variance components and genetic parameters for marbling in the ribeye area (MRA) and body condition score (BCS) using Bayesian inference via mixed linear and threshold animal models. Data were obtained from Santa Ines breed sheep reared in the Brazilian Mid-North region. Analyses considering the Monte Carlo methods were performed with Markov chains from 500000 cycles onward. A 200000-cycle initial burn-in was considered with values taken at every 250 cycles, in a total of 1200 samples. The Monte Carlo Error deviations were low for the means heritability in all chains by both linear and threshold models. Additive variances estimated by threshold model were higher than those estimated by the linear model. Marble meat from the ribeye area and body condition score can be used as selection criteria to obtain genetic progress in Santa Inês sheep.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi estimar componentes de variância e parâmetros genéticos para marmoreio na área de olho de lombo (MOL) e escore de condição corporal (ECC) usando Inferência Bayesiana por meio dos modelos animais linear misto e de limiar. Os dados foram obtidos em rebanhos de ovinos da raça Santa Inês criados no Meio-Norte do Brasil. As análises, considerando os métodos de Monte Carlo, foram realizadas com cadeias de Markov a partir de 500000 ciclos. Considerou-se burn-in inicial de 200000 ciclos com valores tomados a cada 250 ciclos, obtendo-se 1200 amostras. Os desvios do erro de Monte Carlo foram baixos para as herdabilidades médias em todas as cadeias, tanto pelo modelo linear quanto de limiar. As variâncias aditivas, estimadas pelo modelo de limiar, foram maiores que aquelas obtidas pelo modelo linear. O marmoreio na área de olho de lombo e o escore da condição corporal podem ser usados como critérios de seleção para obter progresso genético em ovinos da raça Santa Inês.

Estimate of genetic parameters for carcass traits and visual scores inmeat sheep using Bayesian inference via threshold and linear models / Estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça e escore corporal em ovinos de corte usando Inferência Bayesiana e modelos de limiar e linear

The aim of this study was to estimate the variance components and genetic parameters for marbling in the ribeye area (MRA) and body condition score (BCS) using Bayesian inference via mixed linear and threshold animal models. Data were obtained from Santa Ines breed sheep reared in the Brazilian Mid-North region. Analyses considering the Monte Carlo methods were performed with Markov chains from 500000 cycles onward. A 200000-cycle initial burn-in was considered with values taken at every 250 cycles, in a total of 1200 samples. The Monte Carlo Error deviations were low for the means heritability in all chains by both linear and threshold models. Additive variances estimated by threshold model were higher than those estimated by the linear model. Marble meat from the ribeye area and body condition score can be used as selection criteria to obtain genetic progress in Santa Inês sheep.

O objetivo deste estudo foi estimar componentes de variância e parâmetros genéticos para marmoreio na área de olho de lombo (MOL) e escore de condição corporal (ECC) usando Inferência Bayesiana por meio dos modelos animais linear misto e de limiar. Os dados foram obtidos em rebanhos de ovinos da raça Santa Inês criados no Meio-Norte do Brasil. As análises, considerando os métodos de Monte Carlo, foram realizadas com cadeias de Markov a partir de 500000 ciclos. Considerou-se burn-in inicial de 200000 ciclos com valores tomados a cada 250 ciclos, obtendo-se 1200 amostras. Os desvios do erro de Monte Carlo foram baixos para as herdabilidades médias em todas as cadeias, tanto pelo modelo linear quanto de limiar. As variâncias aditivas, estimadas pelo modelo de limiar, foram maiores que aquelas obtidas pelo modelo linear. O marmoreio na área de olho de lombo e o escore da condição corporal podem ser usados como critérios de seleção para obter progresso genético em ovinos da raça Santa Inês.

Estimate of genetic parameters for carcass traits and visual scores inmeat sheep using Bayesian inference via threshold and linear models / Estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça e escore corporal em ovinos de corte usando Inferência Bayesiana e modelos de limiar e linear

The aim of this study was to estimate the variance components and genetic parameters for marbling in the ribeye area (MRA) and body condition score (BCS) using Bayesian inference via mixed linear and threshold animal models. Data were obtained from Santa Ines breed sheep reared in the Brazilian Mid-North region. Analyses considering the Monte Carlo methods were performed with Markov chains from 500000 cycles onward. A 200000-cycle initial burn-in was considered with values taken at every 250 cycles, in a total of 1200 samples. The Monte Carlo Error deviations were low for the means heritability in all chains by both linear and threshold models. Additive variances estimated by threshold model were higher than those estimated by the linear model. Marble meat from the ribeye area and body condition score can be used as selection criteria to obtain genetic progress in Santa Inês sheep. (AU)

O objetivo deste estudo foi estimar componentes de variância e parâmetros genéticos para marmoreio na área de olho de lombo (MOL) e escore de condição corporal (ECC) usando Inferência Bayesiana por meio dos modelos animais linear misto e de limiar. Os dados foram obtidos em rebanhos de ovinos da raça Santa Inês criados no Meio-Norte do Brasil. As análises, considerando os métodos de Monte Carlo, foram realizadas com cadeias de Markov a partir de 500000 ciclos. Considerou-se burn-in inicial de 200000 ciclos com valores tomados a cada 250 ciclos, obtendo-se 1200 amostras. Os desvios do erro de Monte Carlo foram baixos para as herdabilidades médias em todas as cadeias, tanto pelo modelo linear quanto de limiar. As variâncias aditivas, estimadas pelo modelo de limiar, foram maiores que aquelas obtidas pelo modelo linear. O marmoreio na área de olho de lombo e o escore da condição corporal podem ser usados como critérios de seleção para obter progresso genético em ovinos da raça Santa Inês. (AU)

Performance, carcass parameters, meat quality and lipid profile from feedlot young bulls fed cottonseed / Desempenho, parâmetros de carcaça, qualidade de carne e perfil lipídico de bovinos em confinamento suplementados com caroço de algodão

The objective of this study was to evaluate the performance, carcass, meat quality, fatty acid profile and liver alterations of cattle supplemented with cottonseed feedlot. It used 100 Nelore cattle, being divided into two groups of 50 animals, which received a cottonseed (CS) in grain form by the diet in the proportion of 15% and the other group was provided with control diet without CS in the feedlot for 88 days. The diets were isoprotein and isoenergetic and concentrate:roughage ratio of 60:40. The animals were slaughter in the end of experimental time and the collection of liver samples for histological analysis. After cooling 24 hours at ± 1°C were conducted evaluation of carcass and major cuts, final pH and collected muscle samples longissimus to carry out the physicochemical analyzes (Color, Cooking Loss, Pigments and Shear Force), chemical composition, fatty acid profile and oxidation. The inclusion of CS in the diet provided animals with higher slaughter weight, daily weight gain, Hindquarter, however, the animals showed reduced carcass yield, forequarter weight and Thin flank, without changing the parameters as rib-eye area and backfat thickness. There was an increase of the yellow values (b*) and moisture with the final pH reduction. There was no influence of the use of cottonseed in relation to histological parameters evaluated in the liver. The cottonseed in the feeding feedlot cattle promoted improvement in animal performance, despite the reduction of the forequarter weight, with appropriate aspects of meat quality, fatty acid profile and conservation.(AU)

O objetivo com este estudo foi avaliar as características de desempenho, carcaça, qualidade de carne, perfil de ácidos graxos e alterações hepáticas de bovinos suplementados com caroço de algodão (CA) em terminação. Utilizou-se 100 animais da raça Nelore, sendo divido em dois grupos de 50 animais, sendo para o grupo 1 foi incluído CA na forma de grão inteiro na dieta (15% de inclusão) e para o grupo 2, foi fornecido uma dieta controle. Os animais permaneceram em confinamento durante 88 dias e as dietas fornecidas foram isoproteícas e isoenergéticas, na proporção de Concentrado: Volumoso de 60:40. Ao final do período experimental, os animais foram encaminhados para abate sendo coletadas amostras de fígado para análise histológica. Após resfriamento de 24 horas a ± 1°C, foram realizadas avaliações de carcaça e de cortes principais, pH e coleta de amostras do músculo Longissimus para realização das análises físico- química, de composição centesimal, perfil de ácidos graxos e índice de oxidação. A inclusão do CA na dieta proporcionou animais com maior peso ao abate, ganho de peso diário, rendimento de dianteiro. Porém, os animais apresentaram reduzidos rendimentos de carcaça, peso de traseiro e costelas, sem alterar os parâmetros como área de olho de lombo e cobertura de gordura subcutânea. Houve aumento dos valores de amarelo (b*) e umidade, com redução de pH final com uso do CA. Não houve influência do uso de CA em relação aos parâmetros histológicos avaliados no fígado. A inclusão de 15% de CA promoveu melhoria no desempenho dos bovinos em confinamento, com redução do peso do traseiro e adequados aspectos de qualidade de carne, perfil de ácidos graxos e conservação.(AU)

Performance, carcass parameters, meat quality and lipid profile from feedlot young bulls fed cottonseed / Desempenho, parâmetros de carcaça, qualidade de carne e perfil lipídico de bovinos em confinamento suplementados com caroço de algodão

The objective of this study was to evaluate the performance, carcass, meat quality, fatty acid profile and liver alterations of cattle supplemented with cottonseed feedlot. It used 100 Nelore cattle, being divided into two groups of 50 animals, which received a cottonseed (CS) in grain form by the diet in the proportion of 15% and the other group was provided with control diet without CS in the feedlot for 88 days. The diets were isoprotein and isoenergetic and concentrate:roughage ratio of 60:40. The animals were slaughter in the end of experimental time and the collection of liver samples for histological analysis. After cooling 24 hours at ± 1°C were conducted evaluation of carcass and major cuts, final pH and collected muscle samples longissimus to carry out the physicochemical analyzes (Color, Cooking Loss, Pigments and Shear Force), chemical composition, fatty acid profile and oxidation. The inclusion of CS in the diet provided animals with higher slaughter weight, daily weight gain, Hindquarter, however, the animals showed reduced carcass yield, forequarter weight and Thin flank, without changing the parameters as rib-eye area and backfat thickness. There was an increase of the yellow values (b*) and moisture with the final pH reduction. There was no influence of the use of cottonseed in relation to histological parameters evaluated in the liver. The cottonseed in the feeding feedlot cattle promoted improvement in animal performance, despite the reduction of the forequarter weight, with appropriate aspects of meat quality, fatty acid profile and conservation.

O objetivo com este estudo foi avaliar as características de desempenho, carcaça, qualidade de carne, perfil de ácidos graxos e alterações hepáticas de bovinos suplementados com caroço de algodão (CA) em terminação. Utilizou-se 100 animais da raça Nelore, sendo divido em dois grupos de 50 animais, sendo para o grupo 1 foi incluído CA na forma de grão inteiro na dieta (15% de inclusão) e para o grupo 2, foi fornecido uma dieta controle. Os animais permaneceram em confinamento durante 88 dias e as dietas fornecidas foram isoproteícas e isoenergéticas, na proporção de Concentrado: Volumoso de 60:40. Ao final do período experimental, os animais foram encaminhados para abate sendo coletadas amostras de fígado para análise histológica. Após resfriamento de 24 horas a ± 1°C, foram realizadas avaliações de carcaça e de cortes principais, pH e coleta de amostras do músculo Longissimus para realização das análises físico- química, de composição centesimal, perfil de ácidos graxos e índice de oxidação. A inclusão do CA na dieta proporcionou animais com maior peso ao abate, ganho de peso diário, rendimento de dianteiro. Porém, os animais apresentaram reduzidos rendimentos de carcaça, peso de traseiro e costelas, sem alterar os parâmetros como área de olho de lombo e cobertura de gordura subcutânea. Houve aumento dos valores de amarelo (b*) e umidade, com redução de pH final com uso do CA. Não houve influência do uso de CA em relação aos parâmetros histológicos avaliados no fígado. A inclusão de 15% de CA promoveu melhoria no desempenho dos bovinos em confinamento, com redução do peso do traseiro e adequados aspectos de qualidade de carne, perfil de ácidos graxos e conservação.

Uso de algoritmos computacionais para análise de imagens e aplicações na produção animal: técnicas de Machine Learning para classificação dos escores de marmoreio da área de olho de lombo

PINTO, D. L. Uso de algoritmos computacionais para análise de imagens e aplicações na produção animal: técnicas de Machine Learning para classificação dos escores de marmoreio da área de olho de lombo. 69 f. Dissertação (Mestrado em Ciências) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade São Paulo, Pirassununga, 2021. O presente estudo objetiva utilizar técnicas de Análises de Imagem e Visão Computacional (VC), com o intuito de solucionar problemas ligados à área de Produção Animal. Mais especificamente, investigou-se a possibilidade de automatização do escore de marmoreio via métodos de visão computacional aplicados em imagens .JPG. Tais imagens capturaram a região da área de olho de lombo (AOL), oriundas de animais taurinos canadenses. Estas análises foram conduzidas com o objetivo de auxiliar pequenas plantas frigoríficas durante o processo de classificação do escore de marmoreio. Dessa forma, buscou-se neste estudo a comparação de diferentes algoritmos de aprendizado de máquina tendo como entrada de dados diferentes tipos de atributos extraídos de imagens da AOL. Para tal finalidade, obtivemos acesso a um banco de imagens e mensurações (N = 7.704) relacionadas à superfície do músculo Longissimus dorsi, extraídas a partir da 12ª e 13ª vértebras. Primeiramente, conduzimos um estudo relacionado à determinação da porcentagem de gordura na AOL, via criação de algoritmo implementado em Python (bibliotecas Numpy e OpenCV). Os resultados mostraram que o excesso de brilho em algumas imagens levou o algoritmo a inflacionar em até 54% a GIM quando carcaças do padrão A foram consideradas, e em até 800% para as classificações Prime. Posteriormente, apresentamos uma análise piloto como tentativa de segmentação semântica, técnica que nos permite detectar objetos contidos numa mesma imagem por meio de máscaras de cores distintas. Resultados preliminares sugerem que a segmentação semântica possa ser utilizada como potencial ferramenta durante o processo de classificação automatizada das AOL, desde que o tratamento prévio das imagens seja efetivamente aplicado, principalmente em relação ao background, rotação e luminosidade. Dois métodos de Machine Learning foram investigados com o objetivo de classificar os escores de marmoreio automaticamente (Decision Tree - DT e Random Forest - RF). Com a intenção de extrair atributos baseados nos padrões e texturas das imagens, uma proposta de modificação do método LBP (Local Binary Pattern) foi apresentada. Como resultado principal deste estudo, o subset formado pelas imagens das classes A e AAA (N = 400, extremos para o escore de marmoreio), apresentou os melhores resultados de acurácia (> 90%), para ambos os algoritmos. Aumentando-se o número de imagens para 582 amostras de cada classe, o algoritmo RF apresentou os melhores resultados (> 85%), quando comparado ao método DT (77%). Tal declínio pode estar associado com a utilização de imagens previamente classificadas erroneamente, via processo de avaliação subjetiva. Novo processo de avaliação, conduzido por seis avaliadores externos, encontra-se em fase de conclusão para repetição dos experimentos. Em conclusão, nosso trabalho obteve resultados classificatórios satisfatórios, além de apresentar uma nova metodologia para extração de atributos (LBP), anteriormente aplicado somente em áreas externas à produção animal. Métodos supervisionados requerem que a definição de labels seja conduzida com eficácia para a obtenção correta de padrões em processos classificatórios.

PINTO, D. L. Computer algorithms applied to image analysis and application on animal production: Machine Learning approaches for the marbling score classification in beef cattle. 69 f. Dissertação (Mestrado em Ciências) Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade São Paulo, Pirassununga, 2021. The current study aims to use Image Analysis and Computer Vision approaches in order to solve problems related to Animal Production. We investigated the possibility of creating an automated pipeline to classify the marbling score via computer vision methods applied to .JPG files. Such images captured the ribeye area region collected from canadian beef cattle. These analyses were carried out with the purpose of helping small slaughterhouses on the process of marbling score classification. Two Machine Learning algorithms were compared having as input different attributes extracted from the Ribeye area images. Our database comprised images and measurements (N = 7.704) regarding the transversal cut between the 12# and 13# ribs of the Longissimus dorsi muscle. The first step of our study focused in the estimation of the fat percentage from the image samples via an algorithm implemented in Python using Numpy and OpenCV packages. The results showed that the brightness in some images inflated the marbling score by up to 54% in standard A carcasses, and, an inflation up to 800% was observed in the Prime cuts. In the second step we evaluated the semantic segmentation as a pilot process. It allows the detection of different objects in an image based on previously labeled color masks. Preliminary results suggested that the semantic segmentation can be used as a potencial tool during the automated classification process of the ribeye area, as long as the pre-treatment of the images is effectively apllied, mainly in relation to background, rotation, luminosity. Two methods of Machine Learning were investigated in order to classify image scores automatically (Decision Trees - DT and Random Forests - RF). In order to extract features based on patterns and textures, we proposed an extension of the LBP (Local Binary Pattern) method. The subset formed by the images of classes A and AAA scores (N = 400, extreme of marbling score) showed the best accuracy results (>90%) in both algorithms. After increasing the number of images to 582 samples each, the RF algorithm showed the best results (> 85%), when compared to the DT method (77%). The classification accuracy decrease may be associated with the use of erroneously classified images due to the subjective evaluation process. A new classification was started by six external appraisers and the whole set of analysis will be repeated once it is completed. In conclusion, the results of the current study showed satisfactory classification results, as well as presented a new method for feature extraction (LBP), since it was applied so far on other unrelated areas. In addition, an accurate labeling process is needed to achieve better accuracy when applying supervised classification methods.

"Integração de dados multi-ômicos para estudo de características de produção, carcaça e qualidade da carne em gado Nelore"

Características complexas, como a qualidade da carne, são reguladas por diversas moléculas, tornando difícil sua compreensão. A integração de dados ômicos vêm sendo utilizada para entender essas características. Porém, ao usar uma abordagem de análise hierárquica, baseada no dogma central, ou concatenar apenas o enriquecimento de vias comuns perde-se informação por não considerar relações não convencionais que existem entre os dados ômicos e fenótipos. Nesse trabalho, fenótipos de produção, qualidade de carcaça e carne, dados transcriptômicos, de miRNA e proteômicos de 102 animais Nelore foram utilizados em abordagem utilizando análise de fatores e redes bayesianas, integrando diferentes dados ômicos e características complexas de relevância econômica. Um total de 14 variáveis latentes foram identificadas: 5 para dados de fenótipo, 3 para miRNA, 4 para proteína e 2 para dados de genes. Uma rede com 14 variáveis latentes e 17 conexões direcionadas entre elas foi gerada. As relações têm direção: das variáveis latentes de Carcass, Meat Quality, prot2 e prot4 para REA (força 100%, 100%, 99,8% e 86,10%, respectivamente); das variáveis latentes de Meat Quality, REA, mirna2 e blue para Fat Content (força 99,8%, 89,3%, 89% e 86,4%, respectivamente); de prot1 e mirna2 para prot5 (força 100% e 91,9%, respectivamente); de prot5 e Carcass para prot2 (força 99,2% e 93,1%, respectivamente). As variáveis latentes de proteínas sugerem novas hipóteses do impacto dessas na área de olho de lombo e musculosidade. A rede demonstra uma relação entre miRNAs e isoformas da proteína nebulina que não seriam encontrados em estudos utilizando um dado ômico único ou estratégias multi-níveis. A área de olho de lombo aparece como um nó central na rede, sendo influenciado pela Carcass, prot2, prot4 e Meat Quality, sugerindo essa como uma característica a ser utilizada como parâmetro de mesuração para qualidade da carne em frigoríficos, devido sua facilidade de mensuração. Assim, a análise de fatores aplicada foi capaz de identificar variáveis latentes, diminuindo a dimensionalidade e a complexidade dos dados. A rede bayesiana gerou relações entre variáveis latentes de diferentes tipos de dados, permitindo integrar dados ômicos e fenótipos complexos, idenficar a independência condicional e determinar como esses fatores se relacionam, o que permitiria seu uso para gerar novas hipóteses em estudos moleculares na área da qualidade de carne. Utilizando o uso conjunto da abordagem EFA, BCFA e BN com diferentes tipos de dados, foi possível integrar e fornecer novas hipóteses para estudos de características complexas permitindo explorar relações não convencionais.

Complex traits are regulated by different molecular levels, that dificults its comprehension. Multi-omics data integration has been applied to understand these traits. Therefore, omics data integration using a hierarchical analysis approach, based on central dogma, or considering just the common pathways enrichment may not recognize non-obvious relationships that exist among omics data. Here we applied an approach using Factor Analysis and Bayesian Network to integrate different omics data and complex traits (production phenotypes and meat quality parametres). A total of 14 latent variables were identified: 5 for phenotype data, 3 for miRNA, 4 for protein, and 2 for gene data. A network conteining 14 latent variables and 17 directed connexion was generated. The children nodes with more parents had direction: from Carcass, meat Quality, prot2 and prot4 latent variables to REA (strength 100%,100%, 99,8% and 86.10%, respectively); from Meat Quality, REA, mirna2 and blue latent variables to Fat Content (strength 99.8%, 89.3%, 89% and 86,4%, respectively); from prot1 and mirna2 to prot5 (strength 100% and 91.9%, respectively); from prot5 and Carcass to prot2 (strength 99.2% and 93.1%, respectively). Here, protein latent variables suggest hypotheses for the impact of these proteins on ribeye area. The network also shows a relationship among miRNAs and nebulin protein isoforms. Moreover, the ribeye area seems to be a contral node on network, with influences of Carcass, prot2, prot4 e Meat Quality, suggesting this trait as a feasible phenotype for meat quality, due the facility to measure it. The factor analysis identified latent variables, decreasing the dimensionality and complexity of data. The Bayesian network was capable to generate a net of relationships among latent variables from different types of data, allowing to integrate omics data and complex traits, identifying the conditional independences and how these factors relate. The approach EFA, BCFA and BN could be used to generate new hypotheses on molecular research in the meat quality area, by integration from different types of data, exploring non-conventional relations.

Evaluation of sexual, tissue and morphological development genes of Nellore cattle submitted to fetal programming

A produção de bovinos de corte brasileiro ocorre em grande parte no Cerrado e com animais da raça Nelore, sendo muito comum as pastagens do gênero Brachiaria e, neste cenário, a subnutrição de matrizes bovinas gestantes se mostra presente no país devido à maior exigência por nutrientes neste estágio fisiológico. Consequentemente, a progênie pode ser afetada em sua produtividade e desempenho ao longo da vida. Esse insulto ou estímulo nutricional pré-natal é denominado programação fetal. Dessa forma, esta dissertação teve por objetivo avaliar genes e fenótipos relacionados à precocidade sexual, o desenvolvimento corporal e a diferenciação tecidual de novilhos submetidos à programação fetal durante a fase de recria. Para isto, durante a gestação, 126 vacas da raça Nelore foram divididas em três planos nutricionais sendo que (FP, PP e NP, respectivamente): 13 das matrizes receberam suplementação proteico-energética por toda gestação, outro 13 das matrizes somente no terço final e 13 não receberam esse estímulo nutricional. Durante toda a fase de recria foram coletados dados fenotípicos (peso, medidas ultrassonográficas de carcaça e perímetro escrotal) e material biológico (músculo Longissimus e sêmen) para avaliar o efeito das diferentes estratégias de suplementação pré-natal sobre os 64 novilhos analisados. No primeiro capítulo, foi realizado a avaliação da precocidade sexual, características morfológicas e físicas do sêmen e um estudo nutrigenético para avaliar a resposta dos animais ao estímulo nutricional pré-natal. Neste capítulo foi possível observar os efeitos do fenótipo frugal sobre as características reprodutivas e que a programação fetal não exerce efeito sobre a precocidade sexual em novilhos da raça Nelore. Ainda, foi encontrado interação genótipo-ambiente e alguns genes associados com SNPs (polimorfismo de nucleotídeo único) que explicaram mais de 1% da variância genética dos animais entre os diferentes tratamentos. No capítulo 2, foi avaliado a influência da programação fetal sobre os fenótipos (espessura de gordura subcutânea e da picanha, peso, ganho médio diário, área de olho de lombo, área celular muscular e número de células musculares na área de olho de lombo) durante a fase de recria. Neste capítulo foi possível observar que a programação fetal influenciou no peso dos novilhos ao longo da fase de recria, entretanto nas idades avaliadas não mostrou efeito sobre as espessuras de gordura e avaliações histológicas. Além disso, a suplementação proteico-energética pré-natal durante toda gestação mostrou tendência à um melhor ganho médio diário e área de olho de lombo nos novilhos ao longo da fase de recria. No terceiro capítulo, o transcriptoma de 15 novilhos foi analisado para expressão gênica diferencial com o objetivo de avaliar se a programação fetal apresentou influência sobre a expressão gênica muscular dos animais; e eQTL (loci de características quantitativas de expressão) para avaliar quais genes e processos metabólicos estavam relacionados ao background genético dos animais avaliados. Neste capítulo, não foi encontrado diferenças na expressão gênica diferencial entre os tratamentos, entretanto os eQTLs encontrados controlam características relacionadas à programação fetal, o que pode estar encobrindo os possíveis efeitos da nutrição pré-natal. Em suma, esta dissertação traz grandes contribuições para o campo da programação fetal, com estudos pioneiros, contribuindo para a descoberta de mecanismos associados à nutrição materna e os impactos sobre suas progênies.

The Brazilian beef cattle production occurs largely in the Cerrado and with Nellore animals, with Brachiaria pastures being very common and, in this scenario, the malnutrition of pregnant bovine dams is present in the country due to the greater demand nutrients at this physiological stage. As a result, progeny can be affected in their productivity and lifelong performance. This insult or prenatal nutritional stimulus is called fetal programming. Thus, this thesis aimed to evaluate genes and phenotypes related to sexual precocity, body development and tissue differentiation of young bulls submitted to fetal programming during the rearing phase. For this, during pregnancy, 126 Nellore cows were divided into three nutritional plans (FP, PP and NP, respectively): 13 of the dams received protein-energy supplementation for the entire pregnancy, another 13 of the cows only in the final third and 13 did not receive this nutritional stimulus. During the entire rearing phase, phenotypic data (weight, ultrasound measurements of the carcass and scrotal perimeter) and biological material (Longissimus muscle and semen) were collected to assess the effect of different prenatal supplementation strategies on the 64 analyzed bulls. In the first chapter, an assessment of sexual precocity, morphological and physical characteristics of the semen was carried out and a nutrigenetic study was carried out to assess the animals' response to prenatal nutritional stimulus. In this chapter it was possible to observe the effects of the frugal phenotype on reproductive characteristics and that the fetal programming has no effect on sexual precocity in Nellore bulls. Furthermore, genotype-environment interaction and some genes associated with SNPs (single nucleotide polymorphism) that explained more than 1% of the genetic variance of the animals between the different treatments were found. In chapter 2, the influence of fetal programming on the phenotypes (rump and backfat thickness, weight, average daily gain, ribeye area, muscle cell area and number of muscle cells in ribeye area) was evaluated during the rearing phase. In this chapter it was possible to observe that the fetal programming influenced the weight of the bulls during the rearing phase, however at the evaluated ages it did not show any effect on the fat thickness nor histological assessments. In addition, prenatal protein-energy supplementation throughout pregnancy showed a tendency towards better average daily gain and ribeye area in bulls throughout the rearing phase. In the third chapter, the transcriptome of 15 bulls was analyzed for differential gene expression in order to assess whether fetal programming had an influence on the animals' muscle gene expression; and eQTL (expression quantitative trait loci) to assess which genes and metabolic processes were related to the genetic background of the animals evaluated. In this chapter, no differences were found in the differential gene expression between treatments, however the eQTLs found control characteristics related to fetal programming, which may be masking the possible effects of prenatal nutrition. In short, this thesis brings great contributions to the field of fetal programming, with pioneering studies, contributing to the discovery of mechanisms associated with maternal nutrition and the impacts on their offspring.

Models predict the proportion of bone, muscle, and fat in ewe lamb carcasses from in vivo measurements of the 9th to 11th rib section and of the 12th rib / Modelos para predição das proporções de ossos, músculos e gordura da carcaça de borregas por medidas obtidas in vivo, na seção entre a 9ª e 11ª costelas e 12ª costela

The present work aimed at evaluating models that predict the proportion of bone, muscle, and fat in ewe lamb carcasses using in vivo data obtained from the 9th to 11th rib section and from the 12th rib. A study population of 30 wooled ewe lambs, derived from Texel breed crosses, were fed with different concentrate levels (0%, 20%, 40%, 60%, and 80%) and slaughtered at a weight of 37.70 ± 10.23 kg. Carcass fat content (FC%) and muscle content (MC%) were estimated from models using the proportion of muscle and fat in the 9th to 11th rib section or in the 12th rib, with or without additional data regarding subcutaneous fat thickness (SFT mm) or carcass ribeye area (RA cm2). Carcass bone content (BC%) was predicted based on the proportion of bones in the 9th to 11th rib section or in the 12th rib. Modeling with in vivo data included fasting body weight (FBW), withers height (WH), and ultrasound measurements of SFT and RA. The FC% could be estimated from the carcass SFT and fat content in the 12th rib. The MC% was more accurately predicted from the proportion of muscles in the 9th to 11th rib section and from carcass RA. The 9th to 11th rib section provided the most accurate data for the prediction of BC%. To determine FC% and MC% from in vivo inputs, the model must include FBW and WH. In vivo FBW measurements alone allow for the estimation of BC%. We recommend the use of 12th rib composition for the accurate estimation of carcass fat content, and the use of the 9th and 11th rib section for the prediction of carcass muscle and bone content. Models using in vivo data for the prediction of fat, muscle, and bone in ewe lambs should incorporate FBW and WH.(AU)

Objetivou-se ajustar e avaliar modelos para predição das proporções de ossos, músculos e gordura da carcaça de borregas a partir de medidas obtidas in vivo, na seção HH e 12ª costela. As 30 borregas lanadas, oriundas de cruzamentos com ovinos da raça Texel, foram confinadas, alimentadas com níveis crescentes de concentrado (20; 40; 60 e 80%) e abatidas com 37,70 ± 10,23 kg. Para estimativa da proporção de gordura (GC%) e músculo (MC%) na carcaça foram ajustados modelos com os percentuais de gordura e músculo da 9ª a 11ª costela (seção HH) ou da 12ª costela, acompanhados ou não da espessura de gordura (EGS mm) ou da área de olho de lombo da carcaça (AOL cm2), respectivamente. A proporção de ossos da carcaça (OC%) foi predito pelo percentual de ossos na seção HH ou da 12ª costela. Para predição in vivo, foram ajustadas equações com peso corporal em jejum (PCJ), altura de cernelha (AC), EGS e AOL medidas por ultrassom. A GC% pode ser estimada pela EGS obtida na carcaça e o teor de gordura na 12ª costela. O MC% pode ser predito de forma mais acurada considerando o teor de músculo na seção HH e a AOL da carcaça. A seção HH foi o modelo mais acurado para predição da OC%. Para obtenção da GC% e MC% in vivo os modelos devem incluir PCJ e AC. O OC% in vivo pode ser estimado a partir do PCJ. Recomenda-se a utilização da composição física da 12ª costela para estimativa acurada da proporção de gordura na carcaça e o uso da seção HH para predição das proporções de músculo e ossos na carcaça. Para predição acurada das proporções de gordura, músculo e ossos de borregas in vivo, o modelo deve apresentar peso corporal em jejum e medidas de altura de cernelha.(AU)