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Overview of the use of genomic data in animal breeding / Panorama do uso de dados genômicos no melhoramento genético animal
Barbosa, Bruna Lima; Silva, Ana Paula Soares e; Castro, Dayane Pereira de; Castro, Geandro Carvalho; Silva, Tamires de Sousa; Vieira, Rafaela de Brito; Sena, Luciano Silva; Torres, Tatiana Saraiva; Pereira, Expedito Henrique Ulisses; Silva, Lilian Rosalina Gomes; Borges, Laylson da Silva; Oliveira, Max Brandão de; Sarmento, José Lindenberg Rocha.
Afiliação
  • Barbosa, Bruna Lima; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Silva, Ana Paula Soares e; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Castro, Dayane Pereira de; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Castro, Geandro Carvalho; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Silva, Tamires de Sousa; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Vieira, Rafaela de Brito; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Sena, Luciano Silva; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Torres, Tatiana Saraiva; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Pereira, Expedito Henrique Ulisses; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Silva, Lilian Rosalina Gomes; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Borges, Laylson da Silva; Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Roraima. Amaraji. BR
  • Oliveira, Max Brandão de; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
  • Sarmento, José Lindenberg Rocha; Universidade Federal do Piauí. Teresina. BR
Ciênc. rural (Online) ; 53(10): e20220350, 2023.
Article em En | VETINDEX | ID: biblio-1418799
Biblioteca responsável: BR68.1
Localização: BR68.1
ABSTRACT
The use of molecular information in breeding programs contributed to important advances in the improvement of traits of economic interest in livestock production. The advent of single nucleotide polymorphism (SNP) panels applied to genome-wide selection (GWS) and genome-wide association studies (GWAS), along with computational advances (e.g., use of powerful software and robust analyses) allowed a better understanding of the genetic architecture of farm animals and increased the selection efficiency. In this context, the statistic method single-step GBLUP has been frequently used to perform GWS, and more recently GWAS analyses, providing accurate predictions and QTL detection, respectively. Nevertheless, in developing countries, species such as sheep and goats, whose genomic data are more difficult to be obtained, the use of data simulation has been efficient in the study of the major factors involved in the selection process, such as size of training population, density of SNP chips, and genotyping strategies. The effects of these factors are directly associated with the prediction accuracy of genomic breeding values. In this review we showed important aspects of the use of genomics in the genetic improvement of production traits of animals, the main methods currently used for prediction and estimation of molecular marker effects, the importance of data simulation for validation of those methods, as well as the advantages, challenges and limitations of the use of GWS and GWAS in the current scenario of livestock production.
RESUMO
Em programas de melhoramento genético, o uso de informações moleculares garantiu importantes avanços para a melhoria de características de interesse econômico, no âmbito da produção animal. O advento da tecnologia de painéis de SNPs aplicados à seleção genômica ampla (GWS) e associação genômica ampla (GWAS), aliado ao avanço computacional, com o uso de softwares e análises robustas, permitiram melhor compreensão sobre a arquitetura genética dos animais de produção e, consequentemente, maior eficiência na seleção. Nesse contexto, o método estatístico single-step GBLUP tem sido utilizado, frequentemente, na execução da GWS e, mais recentemente, em GWAS, possibilitando predições acuradas e detecção de QTLs, respectivamente. No entanto, em países em desenvolvimento e, em espécies como os ovinos e caprinos, que existe maior dificuldade para a aquisição de dados genômicos, o uso da simulação de dados tem se mostrado eficiente para estudar os principais fatores envolvidos no processo de seleção, como o tamanho da população de treinamento, densidade de chipde SNPs e estratégias de genotipagem, cujos efeitos estão diretamente associados à acurácia da predição de valores genéticos genômicos. Nesta revisão, serão abordados pontos importantes sobre o uso da genômica no melhoramento genético de características produtivas em animais, principais métodos de predição e estimação de efeitos de marcadores moleculares na atualidade, a importância da simulação de dados para a validação desses métodos, bem como as vantagens, os desafios e as limitações no cenário atual da produção animal com o uso da seleção e associação genômica ampla.
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Base de dados: VETINDEX Idioma: En Revista: Ciênc. rural (Online) Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Base de dados: VETINDEX Idioma: En Revista: Ciênc. rural (Online) Ano de publicação: 2023 Tipo de documento: Article