Uso de ferramentas da bioinformática para determinação dos possíveis efeitos do beta-caroteno no cultivo in vitro de Phalaenopsis / Use of bioinformatics tools for determination of possible effects of beta-carotene in in vitro Phalaenopsis cultivation

RESUMO

Ornamentais demonstram interesse econômico, dentre elas o maior número de comercializações resulta de orquídeas do gênero Phalaenopsis. O cultivo in vitro tem como objetivo propagar um número elevado de plantas com qualidade fitossanitárias. A bioinformática, auxilia na busca por genomas semelhantes de organismos, cujas informações genéticas estejam armazenadas em bancos de dados. O objetivo do trabalho foi determinar os efeitos do β-caroteno no desenvolvimento da Phalaenopsis cultivada in vitro, e determinar o meio de cultura adequado para germinação e desenvolvimento da Phalaenopsis, analisando o gene e a proteína do β-caroteno da Daucus carota. Foram testados três tratamentos para germinação de sementes de Phalaenopsis híbrida, um meio de cultura Knudson, meio de cultura Murashige Skoog (MS) e o meio de cultura Knudson com incremento de 10% (v/v) de suco de cenoura. Seguido de um teste para o cultivo das plântulas de Phalaenopsis híbrida em quatro tratamentos, o meio de cultura Knudson, o meio Murashige e Skoog, meio Knudson com incremento de reguladores de crescimento (BAP/ANA) e o meio Knudson suplementado com suco de cenoura em 10% (v/v). Os resultados demonstram que o suco de cenoura é benéfico para a germinação e desenvolvimento de orquídeas do gênero Phalaenopsis. Através da análise de bioinformática com uso do CLUSTAL e do BLAST, obteve-se informações sobre o gene e a proteína do β-caroteno da Daucus carota e verificou-se que, um substituto para a cenoura na elaboração dos meios de cultura é a Citrus sinensis. A Citrus sinensis é uma fonte abundante de ácido cítrico, que auxilia na redução de oxidação em plantas cultivadas in vitro...

ABSTRACT

Ornamental plants show economic interest, among the greatest number of commercializations results from orchids of the genus Phalaenopsis. In vitro cultivation aims to propagate a high number of plants with phytosanitary quality. Bioinformatics, helps in the search for similar genomes of organisms, whose genetic information is stored in database. The objective of the work was to determine the effects of β-carotene on the development of Phalaenopsis grown in vitro, and to determine the appropriate culture médium for germination and development of Phalaenopsis, analyzing the gene and protein of Daucus carota β-carotene. Three treatments for germination of hybrid Phalaenopsis seeds were tested, a Knudson culture médium, Murashige and Skoog (MS) and Knudson with a 10% (v/v) incremente of carrot juice. Followed by test for the cultivation of hybrid Phalaenopsis seedlings in four treatments, the Knudson culture médium, MS, Knudson whit increased growth regulators (BAP/ANA) and Knudson médium supplemented with carrot juice 10% (v/v). The results demonstrate that carrot juice is beneficial for the germination and development of orchids of the genus Phalaenopsis. Through bioinformatics analysis using CLUSTAL and BLAST, information was obtained on the Daucus carota β-carotene gene and protein and it was found that a substitute for carrots in the preparation of culture médium is Citrus sinensis. Citrus sinensis is na abundant source of citric acid, which helps to reduce oxidation in plants grown in vitro. It is concluded that the médium suitable for the cultivation of Phalaenopsisis the médium supplemented whith carrot juice and that it is possibly the β-carotene presente in the carrot, which is responsible for the benefits in the seedling development.