Cross-amplification of heterologous microsatellite markers in Rhamdia quelen and Leporinus elongatus / Amplificação cruzada de marcadores microssatélites heterólogos em Rhamdia quelen e Leporinus elongatus

ABSTRACT

Native fish species in Brazil are an asset in fish farming, but their natural stocks have been significantly reduced in recent years. To mitigate this negative impact, studies on fish conservation are being conducted and genetic tools for the discrimination of population parameters are increasingly achieving great importance. Current analysis evaluates a set of microsatellite heterologous primers in the jundiá (Rhamdia quelen) and in the piapara (Leporinus elongatus). Samples from the caudal fin of 15 broodstock from each species were analyzed. DNA extraction was performed with NaCl protocol and the integrity of the extracted DNA was checked with agarose gel 1%. Twenty primers developed for Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum, Prochilodus lineatus, Brycon opalinus and Oreochromis niloticus were evaluated. Cross amplification of four primers of the B. opalinus and P. lineatus species (BoM12, Pli43 and Pli60 in R. quelen and BoM2, Pli43 and Pli60 in L. elongatus) was assessed. Primers of P. mesopotamicus, C. macropomum and O. niloticus showed no cross amplification in the two species analyzed. Results revealed the possibility of using the four amplified heterologous primers in genetic studies for R. quelen and L. elongatus.

RESUMO

As espécies nativas de peixes no Brasil tem alto potencial para utilização dentro da piscicultura, porém, seus estoques naturais vêm sofrendo redução nos últimos anos. Para diminuir esse impacto negativo, estudos voltados à conservação estão sendo realizados e cada vez mais, a obtenção de ferramentas genéticas que permitam a discriminação de parâmetros populacionais toma maior importância. Objetivou-se através do presente estudo avaliar um conjunto de primers microssatélites heterólogos em jundiá (Rhamdia quelen) e piapara (Leporinus elongatus). Foram analisadas amostras de nadadeira caudal de 15 reprodutores de cada espécie. A extração de DNA foi realizada utilizando o protocolo com NaCl. A integridade do DNA extraído foi checada em gel de agarose 1%. Foram avaliados 20 primers desenvolvidos para as espécies Piaractus mesopotamicus, Colossoma macropomum, Prochilodus lineatus, Brycon opalinus e Oreochromis niloticus. Foi observada amplificação cruzada de quatro primers das espécies B. opalinus e P. lineatus (BoM12, Pli43 e Pli60 em R. quelen e BoM2, Pli43 e Pli60 em L. elongatus). Os primers de P. mesopotamicus, C. macropomum e O. niloticus não mostraram amplificação cruzada nas duas espécies analisadas. Os resultados indicaram a possibilidade de uso dos três primers heterólogos amplificados em estudos genéticos em R. quelen e L. elongatus.