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The complete mitochondrial genome of Corydoras nattereri (Callichthyidae: Corydoradinae)
Moreira, Daniel A; Buckup, Paulo A; Britto, MarceloR; Magalhães, Maithê G. P; Andrade, Paula C. C. de; Furtado, Carolina; E. Parente, Thiago.
Afiliação
  • Moreira, Daniel A; Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxicologia Ambiental. Rio de Janeiro. Brasil
  • Buckup, Paulo A; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Museu Nacional. Departamento de Vertebrados. Rio de Janeiro. Brasil
  • Britto, MarceloR; Universidade Federal do Rio de Janeiro. Museu Nacional. Departamento de Vertebrados. Rio de Janeiro. Brasil
  • Magalhães, Maithê G. P; Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxicologia Ambiental. Rio de Janeiro. Brasil
  • Andrade, Paula C. C. de; Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxicologia Ambiental. Rio de Janeiro. Brasil
  • Furtado, Carolina; Instituto Nacional do Câncer. Divisão de Genética. Rio de Janeiro. Brasil
  • E. Parente, Thiago; Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Toxicologia Ambiental. Rio de Janeiro. Brasil
Neotrop. ichthyol ; 14(1)apr. 2016.
Article em En | VETINDEX | ID: vti-339463
Biblioteca responsável: BR68.1
Localização: BR68.1
ABSTRACT
The complete mitogenome of Corydoras nattereri , a species of mailed catfishes from southeastern Brazil, was reconstructed using next-generation sequencing techniques. The mitogenome was assembled using mitochondrial transcripts from the liver transcriptomes of three individuals, and produced a circular DNA sequence of 16,557 nucleotides encoding 22 tRNA genes, two rRNA genes, 13 protein-coding genes and two noncoding control regions (D-loop, OrigL). Phylogeographic analysis of closely related sequences of Cytochrome Oxydase C subunit I (COI) demonstrates high diversity among morphologically similar populations of C. nattereri . Corydoras nattereri is nested within a complex of populations currently assigned to C. paleatus and C. ehrhardti . Analysis of mitogenome structure demonstrated that an insertion of 21 nucleotides between the ATPase subunit-6 and COIII genes may represent a phylogenetically informative character associated with the evolution of the Corydoradinae.(AU)
RESUMO
O mitogenoma completo de Corydoras nattereri , uma espécie de bagres encouraçados do sudeste do Brasil, foi reconstruído através de técnicas de sequencimento de DNA de próxima geração. O mitogenoma foi produzido a partir de produtos de transcrição mitocondrial dos transcriptomas hepáticos de três indivíduos, resultando numa sequência de DNA circular de 16.557 nucleotídeos abrangendo 22 genes de tRNA, dois genes de rRNA, 13 genes codificadores de proteínas e duas regiões de controle não codificadoras (D-loop, OrigL). A análise filogenética de sequências proximamente relacionadas da subunidade I do gene Citocrome Oxidase C (COI) demonstrou a existência de elevada diversidade entre populações morfologicamente similares de C. nattereri . Corydoras nattereri está inserida num complexo de populações atualmente identificadas como C. paleatus e C. ehrhardti . A análise da estrutura do mitogenoma demonstra que a inserção de uma sequência de 21 nucleotídeos entre os genes da subunidade 6 da ATPase e do COIII representa um caráter filogeneticamente informativo associado à evolução de Corydoradinae.(AU)
Assuntos
Palavras-chave

Texto completo: 1 Base de dados: VETINDEX Idioma: En Revista: Neotrop. ichthyol Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article

Texto completo: 1 Base de dados: VETINDEX Idioma: En Revista: Neotrop. ichthyol Ano de publicação: 2016 Tipo de documento: Article