Bayesian and frequentist approaches in three trait genetic analysis for growth and reproduction in nelore cattle / Abordagem bayesiana e freqüentista em análise genética tricaráter para crescimento e reprodução de bovinos nelore

ABSTRACT

The Bayesian inference has been proposed as an alternative for estimating variance components instead of the frequentist approach. The objective of this study was to estimate the (co)variance components and genetic parameters of growth and reproduction traits in Nelore cattle using three-trait animal model by Restricted Maximum Likelihood and Gibbs Sampling. The data set had 15,173 and 6,911 records of weight (W365) and scrotal circumference (SC365) at 365 days of age, respectively, and 10, 388 records of age at first calving (AFC), from the Nelore Breed Genetic Improvement Program farms. The linear model included the contemporary groups and age-of-dam (with exception for AFC) as fixed effects, and residual and additive direct genetic effects as random. Estimates obtained by Restricted Maximum Likelihood were different from those found by Gibbs Sampling. There were no differences in genetic parameter estimates using the three levels of prior information by Gibbs Sampling. The Bayesian inference has advantages in relation to Frequentist approach due to marginal distributions which offer more information about the parameters.KEY WORDS Beef cattle, genetic parameters, three-trait models.

RESUMO

Os objetivos deste estudo foram estimar os componentes de variância e parâmetros genéticos de características de crescimento e reprodução de bovinos da raça Nelore, em modelo animal tricaráter, utilizando a Máxima Verossimilhança Restrita e a Inferência Bayesiana. Na implementação do Amostragem de Gibbs, que aplica a teoria bayesiana, consideraram-se os três diferentes níveis de conhecimento das informações iniciais dos componentes de variância e covariância. O conjunto de dados continha 15.173 registros de peso aos 365 dias de idade (P365), 6.911 registros de perímetro escrotal aos 365 dias de idade (PE365) e 10.388 dados de idade ao primeiro parto (IPP). O modelo linear incluiu o grupo de contemporâneos e a idade da vaca ao parto como efeitos fixos (exceto para IPP), e os efeitos genético aditivo direto e residual como aleatórios. As estimativas obtidas pela Máxima Verossimilhança Restrita foram diferentes das obtidas pela Amostragem de Gibbs. No entanto, considerando os três diferentes níveis de informação inicial, não houve diferenças nas estimativas dos parâmetros genéticos obtidas pela Amostragem de Gibbs. O método bayesiano apresentou vantagens em relação ao método freqüentista, graças às distribuições marginais posteriores, que ofereceram mais informações sobre os parâmetros estimados.PALAVRAS-CHAVES Bovinos de corte, modelo tricaráter, parâmetros genéticos.