Molecular characterization of Flavobacterium columnare isolates from nile tilapia and piracanjuba by RAPD-PCR / Caracterização molecular de isolados de Flavobacterium columnare de tilapia do nilo e piracanjuba por meio de RAPD-PCR
SEBASTIÃO, Fernanda de Alexandre; PILARSKI, Fabiana; LEMOS, Manoel Victor Franco.
B. Inst. Pesca;
36(4)2010.
Artigo
em Português
| VETINDEX
| ID: vti-761368
Resumo
Flavobacterium columnare is a cosmopolite bacteria and it is one of the main problem in Brazilian aquaculture, causing high mortalities index and economic damage. The main factors that contribute to columnaris disease are inadequate water quality, excess handling, high density of fish and temperature variations. For a successful epidemiological study and disease control, it is essential to differentiate F. columnare from other yellow pigmentation bacteria. The present study used molecular techniques to characterize, by RAPD-PCR, two strains of F. columnare isolated from Oreochromis niloticus and Brycon orbignyanus. Data were analyzed as binary (0 and 1) and a genetic similarity matrix was generated by Jaccard's coefficient. Cluster analysis was performed by the neighbor joining method. The RAPD-PCR technique confirmed to be a usefull tool to obtain genetic profiles from F. columnare isolates based on the oligonucleotides used and to verify genetic similarity.Flavobacterium columnare é uma bactéria cosmopolita, agente etiológico da columnariose, considerada um dos maiores problemas na aquicultura brasileira, provocando elevadas taxas de mortalidade e grande prejuízo econômico. Qualidade de água inadequada, manejo zootécnico excessivo, alta densidade de estocagem e variações da temperatura da água são os principais fatores que contribuem para a ocorrência da columnariose. Para a realização de um estudo epidemiológico de sucesso e controle desta enfermidade, é essencial a distinção da F. columnare das demais bactérias de pigmentação amarelada. Para tanto, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar molecularmente, por meio da técnica de RAPD-PCR, duas cepas de F. columnare isoladas de Oreochromis niloticus e Brycon orbignyanus. Os dados foram analisados como binários (0 e 1) e uma matriz de similaridade genética foi gerada pelo coeficiente de Jaccard. A análise de agrupamento foi realizada pelo método neighbor joining. A técnica de RAPD-PCR confirmou ser uma ferramenta importante para obtenção do perfil genético dos isolados de F. columnare a partir dos oligonucleotídeos utilizados e para verificação da similaridade genética.
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BR68.1
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