INTRAGENOTYPIC DIVERSITY OF PORCINE ROTAVIRUS STRAINS CIRCULATING IN SÃO PAULO STATE, BRAZIL / Diversidade intra-genotípica de amostras de rotavírus suínas circulantes no Estado de São Paulo, Brasil.

RESUMO

Com o objetivo de se determinar a diversidade intra-genotípica de rotavírus circulantes em criações de suínos de diferentes municípios localizados no Estado de São Paulo, Brasil, um total de 3 amostras de rotavírus pertencentes ao genotipo G[5] foram submetidas ao sequenciamento parcial do gene codificador da proteína VP7. Analogamente, outras 4 amostras P[6], tiveram o gene codificador da proteína VP4 parcialmente definidas. A identidade nucleotídica entre as amostras G[5] variou de 93,1% a 99,4%, e em termos de aminoácidos de 97,5% a 100%. Quanto ao genotipo P[6] as amostras variaram de 93% a 98,7% e 95 a 100% para as identidades de nucleotídeos e aminoácidos, respectivamente. Adicionalmente, inferências filogenéticas feitas a partir de aminoácidos, usando o critério de distância com algoritmo Neighbor-Joining e correção de Poisson como modelo de substituição, demonstraram que as amostras G[5] aqui definidas agruparam-se exclusivamente com amostras homólogas descritas previamente em suínos, enquanto que as P[6] demonstraram relacionamento tanto com amostras humanas e suínas. Em face destes achados