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IDENTIFICAÇÃO MOLECULAR DE ESTRONGILÍDEOS GASTROINTESTINAIS DE RUMINANTES DOMÉSTICOS E SEQUENCIAMENTO DO GENOMA MITOCONDRIAL DE HAEMONCHUS PLACEI.

LIVIA LOIOLA DOS SANTOS.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-200073

Resumo

O presente estudo descreve um novo método para identificação molecular de nematódeos estrongilídeos em nível de gênero e/ou de espécies. As etapas do método são baseadas na amplificação seguida de análise de fragmentos (para identificação em nível de gênero) e amplificação seguida de minissequenciamento (para identificação em nível de espécie) de parte da região ITS-2 (Internal Transcribed Spacer 2) do DNA ribossômico dos parasitos. Por meio desse método, é possível identificar sete gêneros e doze espécies de nematódeos infectantes de ruminantes e provavelmente infectantes em rebanhos de regiões tropicais, de maneira específica, menos laboriosa e custo-eficiente. Além disso, o genoma mitocondrial de uma dessas espécies mais prevalentes, Haemonchus placei, foi sequenciado e anotado. Sequências genômicas completas permitem a comparação da genética de populações e evolução para inúmeros nematóides parasitos. O comprimento do genoma mitocondrial (mt) de H. placei é de aproximadamente 13.664 nucleotídeos, contém 2 RNAs ribossomais (rRNAs), 22 RNAs de transferência (tRNAs), 12 genes codificadores de proteínas, e é caracterizada por um teor de 78,8% de A + T. A ordem dos genes mitocondriais de H. placei é idêntica à relatada para outros nematóides parasitas da superfamília Trichostrongyloidea. A sequência do genoma mitocondrial completo relatado no presente estudo pode fornecer novos marcadores genéticos para a investigação de relações filogenéticas entre espécies dessa superfamília e permite avaliar a diversidade da população em regiões endêmicas. O polimorfismo de sequência possibilita novas estratégias para monitorar o progresso de programas de controle sanitário. A sequência foi usada para inferir a divergência evolutiva entre as espécies da superfamília Trichostrongyloidea com genomas mitocondriais publicados até hoje, sugerindo sua filogenia e suas relações genéticas.
This study describes a new method for molecular identification of strongyles nematodes at genus and/or species. The steps of the method are based on the amplification and fragment analysis (for the identification at the genus level) and amplification followed by minisequencing (to identify the species level) of part of the ITS-2 region (Internal Transcribed Spacer 2) of the ribosomal DNA the parasites. Through this method, it is possible to identify seven genera and twelve species of infective nematodes of domestic ruminants and predominantly infecting herds in tropical regions, in a specific way, wich is less laborious and cost-efficient. Moreover, the mitochondrial genome of these more prevalent species, Haemonchus placei, was sequenced and annotated. Complete genome sequences enable comparison of population genetics and evolution for numerous parasitic nematodes. The H. placei mt genome length is approximately 13,664 nucleotides, contains 2 ribosomal RNAs (rRNAs), 22 transfer RNAs (tRNAs), 12 protein-coding genes, and is characterized by a 78.8% A+T content. The H. placei mt gene order is identical to that reported for other parasitic nematodes of the superfamily Trichostrongyloidea. The complete mt genome sequence reported here provides new genetic markers for investigating phylogenetic and geographic relationships between isolates, and assessing population diversity within endemic regions. The sequence polymorphism enables new strategies to monitor the progress of health control programs. The sequence was used to infer the divergence times between the species of Trichostrongyloidea superfamily which have published mt genomes to date, suggestingtheir genetic relationships and phylogeny.
Biblioteca responsável: BR68.1