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Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-202393

Resumo

Objetivou-se com este estudo realizar a análise filogenética de amostras virais isoladas em surtos de Peste Suína Clássica no Brasil. Foram utilizadas 11 amostras virais isoladas nos surtos de PSC no período de 2001 á 2009, procedentes dos estados do Rio Grande do Norte (RN), Ceará (CE), Maranhão (MA) e Amapá (AP). Para a análise filogenética as amostras foram submetidas à extração do RNA seguida da reação de transcrição reversa-PCR (RT-PCR) direcionadas para amplificar a sequência completa (1.119 nucleotídeos) do gene E2 viral. Para o estudo filogenético todas as amostras foram sequenciadas e as árvores filogenéticas foram realizadas pelo método de Neighbor Joiningcom 1.000 réplicas debootstrap. Os isolados A06 e A19 (ambos do estado do Maranhão) agruparam com alto índice de confiança com as cepas pertencentes ao subgenótipo 1.1. Já os demais isolados (A02, A09, A15, A16, A20, A27, Ceará; A05, Rio Grande do Norte; e A11 e A12, Amapá), mostraram-se menos relacionados ao subgenótipo 1.1., formando um novo subgenótipo, designado 1.5. Ressalta-se que estudos epidemiológicos e moleculares devem ser realizados de forma contínua para que se entenda a dinâmica dos surtos de PSC e consequentemente as perdas ocasionadas por esta enfermidade sejam reduzidas.

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The objective of thisstudy was to conduct a phylogenetic analysis of viral samples isolated on Classical Swine Fever outbreaks in Brazil. Eleven viral isolates in CSF outbreaks in the period 2001 to 2009 were used in this study. The samples were submitted to RNA extraction and the full-length E2 gene of CSF virus (1.119 nucleotides) was amplified by PCR and sequenced. The sequences were analyzed by the programs contained in STADEN package and the phylogenetic analyses were performed by Neighbor Joining method with 1000 bootstrap replicates using the MEGA 6.6 program. The A06 and A19 isolates (both from the state of Maranhão) grouped with high level of confidence with strains belonging to subgenotype 1.1. The other Brazilian isolates (A02, A09, A15, A16, A20, A27, from Ceará; A05, from Rio Grande do Norte; e A11 e A12, from Amapá) presented a different segregation pattern into the subgenotype 1.1, forming a separate group within genotype 1, subgenotype 1.5. It is emphasized that epidemiological and molecular studies should be conducted continuously in order to understand the dynamics of outbreaks and thus reduce the losses caused by this disease.

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