Caracterização molecular da região hipervariável do gene vp2 do vírus da doença da Bursa de Fabrícius (IBVD) em frangos de corte do Estado do Rio de Janeiro

RESUMO

A Doença Infecciosa da Bursa de Fabrícius (DIB), também chamada de doença de Gumboro, é uma doença aguda que leva à imunossupressão em aves jovens. A cepa viral pode ser altamente patogênica e tem grande importância econômica para granjas comerciais do Brasil e do mundo. A proteína externa da capsídeo viral (vp2) do vírus da doença Infecciosa da Bursa de Fabrícius (IBDV) tem uma região hipervariável que é usada para a caracterização viral. Atualmente, estirpes virais do IBD são classificados como clássico (cvIBDV), variante atenuada (atIBDV), altamente virulenta (vvIBDV) e distinta (diIBDV). O objetivo deste estudo foi estudar a caracterização molecular da região hipervariável do gene vp2 a partir de amostras de aves brasileiras do estado do Rio de Janeiro. A detecção e genotipagem de estirpes de IBDV foram realizadas por real time RT-PCR. A partir de 65 de amostras avaliadas, 49 foram positivas para IBDV e 45 foram classificados como não muito virulenta (clássico, atenuado ou variantes distintas) e quatro como muito virulenta. As mesmas amostras foram submetidas a RT-PCR com iniciadores específicos para amplificar um fragmento de 642 pb que codifica a região hipervariável do gene VP2. Subsequentemente, as amostras positivas foram seqüenciadas e comparadas com outras seqüências disponíveis no GenBank para o estudo da diversidade genética de estirpes virais. A análise filogenética mostrou que a amostra RJ esta agrupada em um clado de estirpes muito virulentas e as amostras 1, 2, 3, 4 e 5 estão agrupadas em outro clado com cepas classificadas como distintas. Além disso, diferenças na região hipervariável do gene de vp2 foram encontrados neste estudo, quando comparado com outras estirpes virais disponíveis no GenBank. Este fato mostra que eles podem ser genótipos virais ainda não identificados que estão em circulação em granjas comerciais no Estado do Rio de Janeiro.

ABSTRACT

The InfectiousBursal Disease (IBD), also called Gumboro disease, is an acute disease that leads to immunosuppression in young birds. The viral strain can be highly pathogenic and has great economic importance to the Brazilian and global commercial poultry. The external protein of the viral capsid (vp2) of Infectious Bursal Disease Virus (IBDV) has a hypervariable region which is used for viral characterization. Currently, viral strains of the IBD are classified as classic (cvIBDV), attenuated (atIBDV) variant (avIBDV), highly virulent (vvIBDV) and different (diIBDV). The aim of this study was to study the molecular characterization of the hypervariable region of the vp2 gene of Brazilian samples from fowl runs in the state of Rio de Janeiro. The detection and genotyping of IBDV strains were performed by real-time RT-PCR. From 65 of evaluated samples, 49 were positives for IBDV and, 45 were classified as not very virulent (classical, attenuated, or different variants) and four as very virulent. The same samples were subjected to RT-PCR with specific primers to amplify a fragment of 642 bp encoding the hypervariable region of the vp2 gene. Subsequently, the positive samples were sequenced and compared with other sequences available in GenBank for the study of genetic diversity of viral strains. Phylogenetic analysis showed that the sample RJ are grouped in a very virulent strains cluster and samples 1, 2, 3, 4 and 5 are clustered in another clade with strains classified as distinct. In addition, differences in the hypervariable region of the vp2 gene were found in this study, when compared to other viral strains available in GenBank. This fact shows that they can be a viral genotypes not identified yet that are in circulation in commercial farms in the state of Rio de Janeiro.