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Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-204555

Resumo

A identificação em nível de espécie de materiais biológicos é fundamental para diversas áreas das ciências naturais. Assim, o uso da técnica DNA barcoding na distinção de táxons constitui uma ferramenta bastante empregada atualmente como apoio a taxonomia tradicional, especialmente na detecção de espécies crípticas. Considerando a utilização do DNA barcoding como um sistema global de identificação e descoberta de espécies, o presente estudo objetivou gerar uma biblioteca referência de sequências barcoding para os peixes da bacia do Rio Itapecuru, Maranhão. A amostragem foi constituída de espécimes coletados no alto, médio e baixo curso da bacia do rio Itapecuru. Nas análises genéticas, o DNA total foi isolado utilizando-se o protocolo de fenol-clorofórmio e os fragmentos do gene mitocondrial COI amplificados através da técnica de PCR com posterior sequenciamento. As 440 sequências geradas neste estudo corresponderam a 64 espécies, 59 gêneros, 31 famílias e 10 ordens. Das espécies analisadas, 92,19% puderam ser identificadas pela abordagem do DNA barcoding, com baixo índice de média divergência genética intraespecífica de 0,80% e agrupamentos coesos para os valores de bootstrap. No entanto as espécies Anableps anableps, Gymnotus carapo, Sciades couma, Pseudaucheipterus nodosus e Leporinus piau apresentaram uma divergência genética media maior que 3% e formaram subclados, com evidência de diferenciação sugerindo uma análise mais apurada para determinar se ocorreu erro de identificação de amostras relativamente semelhantes ou até mesmo existência de diversidade críptica. A utilização do fragmento do gene COI como DNA barcoding permitiu o estudo de um grande número de exemplares, bem como possibilitou identificar e discriminar espécies proximamente relacionadas.

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Species-level identification of biological materials is critical to areas of the natural sciences. Thus, the use of the DNA barcoding technique in Taxonomy is a widely used tool Traditional taxonomy, especially in the detection of cryptic species. Considering the use of DNA barcoding as a Identification and discovery of species, the present study aimed to generate a Reference library of barcoding sequences for fish in the Rio basin Itapecuru, Maranhão. Sampling was composed of specimens collected at the top, Middle and lower reaches of the Itapecuru river basin. In genetic analyzes, total DNA Was isolated using the phenol-chloroform protocol and the gene fragments Mitochondrial IOC amplified by the PCR technique with subsequent Sequencing. The 440 sequences generated in this study correspond to 64 Species, 59 genera, 31 families and 10 orders. Of the species analyzed, 92.19%. Could be identified by the DNA barcoding approach, with a low Intraspecific genetic divergence of 0.80% and cohesive clusters for Bootstrap values. However the species Anableps anableps, Gymnotus Carapo, Sciades couma, Pseudaucheipterus nodosus and Leporinus piau presented An average genetic divergence greater than 3% and formed subclasses, with Evidence of differentiation suggesting a more detailed analysis to determine if Identification of relatively similar samples or even Existence of cryptic diversity. The use of the COI gene fragment as DNA Barcoding allowed the study of a large number of copies, as well as Made it possible to identify and discriminate closely related species.

Biblioteca responsável: BR68.1