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Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-212526

Resumo

A identificação de marcadores genéticos associados à resistência à verminose pode aumentar a resposta genética para esta característica por meio da seleção assistida por marcadores. Além disso, a identificação de regiões genômicas que influenciam a resistência a parasitas gastrintestinais podem ser importantes para melhorar a resistência de ovinos de corte à verminose. Portanto, objetivou-se com esta pesquisa estimar parâmetros genéticos para a resistência à verminose em ovinos Santa Inês selecionados para a produção de carne, realizar a predição do valor genético genômico para as características em estudo e identificar polimorfismos de base única (SNPs) relacionados a essas características, por meio de estudos de associação genômica ampla (GWAS). Foram utilizadas informações de 1.637 indivíduos incluídos na matriz de parentesco, dos quais 388 também dispuseram de informações oriundas de genotipagem com uso do painel OvineSNP50 BeadChip da Illumina. Após o controle de qualidade dos dados genômicos, foram utilizadas informações de 42.748 SNPs para estimação de componentes de variância e predição genômica e 45.465 marcadores para as análises de associação genômica ampla. As características avaliadas foram resistência à verminose (RV) e tamanho corporal. No Capítulo 1, foi realizada a estimação de componentes de variância e parâmetros genéticos com uso de modelo animal por meio de análises uni e multicaracterísticas, com uso de informação genômica e com uso apenas de informações de pedigree, adotando inferência Bayesiana e avaliação genética para as características em estudo. As estimativas de herdabilidade obtidas com uso de ambos os modelos variaram de 0,11 a 0,37, nas análises unicaracterísticas, e de 0,17 a 0,46, nas análises multicaracterísticas. Foi realizada a avaliação genética dos animais para as características em estudo, com uso dos métodos de Melhor Estimador Linear Não Viesado (BLUP) e BLUP genômico em passo único (ssGBLUP), em análises unicaracterísticas, e comparada a eficiência do uso de informações genômicas na acurácia preditiva dos valores genéticos genômicos (GEBVs). Os ganhos em acurácia variaram entre 6,34 e 40,34% com a inclusão da informação genômica. No Capítulo 2, foi utilizada a metodologia de associação genômica ampla em passo único ponderada (WssGWAS) para identificar regiões cromossômicas associadas às características em estudo, considerando a proporção de variância genética aditiva explicada por janelas de 10 SNPs adjacentes. Um total de 14, 18 e 18 janelas que explicaram pelo menos 1% da variância aditiva foram identificadas, respectivamente, para RV, PT e AG. O método genômico (ssGBLUP) foi mais acurado na predição dos valores genéticos em relação ao método tradicional (BLUP) para as características em estudo. Vários genes candidatos relacionados ao desenvolvimento e ativação do sistema imune foram encontrados. Esses genes podem ajudar no melhor entendimento dos mecanismos de resistência de ovinos aos parasitas gastrointestinais e, consequentemente, na seleção de ovinos com maior resistência.

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A identificação de marcadores genéticos associados à resistência à verminose pode aumentar a resposta genética para esta característica por meio da seleção assistida por marcadores. Além disso, a identificação de regiões genômicas que influenciam a resistência a parasitas gastrintestinais podem ser importantes para melhorar a resistência de ovinos de corte à verminose. Portanto, objetivou-se com esta pesquisa estimar parâmetros genéticos para a resistência à verminose em ovinos Santa Inês selecionados para a produção de carne, realizar a predição do valor genético genômico para as características em estudo e identificar polimorfismos de base única (SNPs) relacionados a essas características, por meio de estudos de associação genômica ampla (GWAS). Foram utilizadas informações de 1.637 indivíduos incluídos na matriz de parentesco, dos quais 388 também dispuseram de informações oriundas de genotipagem com uso do painel OvineSNP50 BeadChip da Illumina. Após o controle de qualidade dos dados genômicos, foram utilizadas informações de 42.748 SNPs para estimação de componentes de variância e predição genômica e 45.465 marcadores para as análises de associação genômica ampla. As características avaliadas foram resistência à verminose (RV) e tamanho corporal. No Capítulo 1, foi realizada a estimação de componentes de variância e parâmetros genéticos com uso de modelo animal por meio de análises uni e multicaracterísticas, com uso de informação genômica e com uso apenas de informações de pedigree, adotando inferência Bayesiana e avaliação genética para as características em estudo. As estimativas de herdabilidade obtidas com uso de ambos os modelos variaram de 0,11 a 0,37, nas análises unicaracterísticas, e de 0,17 a 0,46, nas análises multicaracterísticas. Foi realizada a avaliação genética dos animais para as características em estudo, com uso dos métodos de Melhor Estimador Linear Não Viesado (BLUP) e BLUP genômico em passo único (ssGBLUP), em análises unicaracterísticas, e comparada a eficiência do uso de informações genômicas na acurácia preditiva dos valores genéticos genômicos (GEBVs). Os ganhos em acurácia variaram entre 6,34 e 40,34% com a inclusão da informação genômica. No Capítulo 2, foi utilizada a metodologia de associação genômica ampla em passo único ponderada (WssGWAS) para identificar regiões cromossômicas associadas às características em estudo, considerando a proporção de variância genética aditiva explicada por janelas de 10 SNPs adjacentes. Um total de 14, 18 e 18 janelas que explicaram pelo menos 1% da variância aditiva foram identificadas, respectivamente, para RV, PT e AG. O método genômico (ssGBLUP) foi mais acurado na predição dos valores genéticos em relação ao método tradicional (BLUP) para as características em estudo. Vários genes candidatos relacionados ao desenvolvimento e ativação do sistema imune foram encontrados. Esses genes podem ajudar no melhor entendimento dos mecanismos de resistência de ovinos aos parasitas gastrointestinais e, consequentemente, na seleção de ovinos com maior resistência.

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