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Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-216968

Resumo

As doenças virais que comprometem a avicultura destacam-se como um dos principais fatores de declínio da produtividade. As infecções por rotavírus (RV) ocasionam prejuízos econômicos devidos às altas taxas de morbidade e pela ampla distribuição mundial. O objetivo deste estudo foi investigar a presença das espécies A, D, F e G de RV em amostras de conteúdo intestinal de Gallus gallus domesticus provenientes do estado do Paraná. O primeiro estudo avaliou uma amostra pertencente à coleção de amostras de fezes da rotina de diagnóstico de vírus entéricos do Laboratório de Virologia Animal. A amostra de conteúdo intestinal foi coletada em 2016 de uma galinha poedeira comercial com 114 dias de idade com sinais clínicos de diarreia. Esta amostra foi submetida a RT-PCR para amplificação parcial dos genes VP4 e VP7 de RVA e do gene VP6 de RVD, RVF e RVG, seguido do sequenciamento dos produtos amplificados e análise das sequências obtidas. Um amplicon com tamanho esperado foi obtido apenas na RT-PCR para RVF. A cepa de RVF detectada apresentou 87,7 a 97,9% e 95,2 a 100% de identidade de nucleotídeos (nt) e aminoácidos (aa), respectivamente, com cepas de RVF previamente descritas e na árvore filogenética agrupou com cepas de RVF já descritas incluindo cepas de RVF detectadas em frangos de corte no Brasil. Este estudo descreve a primeira detecção e caracterização parcial do gene VP6 de RVF em galinha poedeira comercial com diarreia. No segundo estudo, 40 amostras de conteúdo intestinal individual de frangos de corte, com uma a cinco semanas de idade, foram coletadas durante 2014 e 2015 de 21 granjas comerciais localizadas no estado do Paraná. As amostras foram submetidas a RT-PCR para amplificação parcial dos genes VP4 e VP7 de RVA e do gene VP6 de RVD, RVF e RVG, seguido do sequenciamento dos produtos amplificados e análise das sequências obtidas. Três das 40 amostras analisadas (7,5%) apresentaram amplicons com tamanho esperado para RVG. Duas cepas de RVG descritas exibiram 84,5 a 90,9% e 91,2 a 100% de identidade de nt e aa com cepas de RVG detectadas anteriormente. Na árvore filogenética, as duas cepas de RVG descritas agruparam em um cluster com cepas de RVG detectadas em frangos de corte (África do Sul e Alemanha) e perdiz (Itália) distante das cepas de RVG detectadas em frangos de corte no Brasil. A detecção e caracterização de cepas de RVG neste estudo fornece informação sobre a presença desta espécie de RV em frangos de corte de granjas do Paraná, região sul do Brasil. Os estudos demonstraram que RV está presente tanto em aves adultas quanto jovens e em diferentes categorias (frangos de corte e poedeira), que medidas de controle e profilaxia devem ser implantadas e monitoradas nas granjas do Paraná, além da disponibilidade de sequências de nt e aa de RVF e RVG, uma vez que esses dados ainda são escassos.

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Viral diseases that compromise poultry farming stands out as one of the main factors of productivity decline. Rotavirus (RV) infections cause economic losses due to high morbidity rates and widespread worldwide distribution. This study aimed to investigate the presence of RV species A, D, F, and G in individual intestinal contents of Gallus gallus domesticus from the Paraná State. The first study evaluated a sample that belongs to the fecal sample collection of the enteric virus diagnosis routine of the Laboratory of Animal Virology. The intestinal contents sample was collected in 2016 from a commercial laying hen with 114-day-old with clinical signs of diarrhea. The sample was submitted to RT-PCR assay for partial amplification of the VP4 and VP7 genes of RVA and the VP6 gene of RVD, RVF, and RVG, followed by the sequencing of the amplified products and analysis of the obtained sequences. An amplicon of the expected size was obtained only in RT-PCR for RVF. The RVF strain detected showed 87.7 to 97.9% and 95.2 to 100% of nucleotide (nt) and amino acid (aa) identity, respectively, with RVF strains previously described and in the phylogenetic tree clustered with RVF strains already described including RVF strains detected in broiler chickens in Brazil. This study describes the first detection and partial characterization of the VP6 gene of RVF in commercial laying with diarrhea. In the second study, 40 individual intestinal contents of broilers chickens with one to five weeks of age were collected during 2014 and 2015 from 21 avian commercial farms located in the state of Paraná. The samples were submitted to RT-PCR assay for partial amplification of the VP4 and VP7 genes of RVA and the VP6 gene of RVD, RVF, and RVG, followed by the sequencing of the amplified products and analysis of the obtained sequences. Of the 40 analyzed samples, three (7.5%) exhibited amplicons with expected size for RVG. Two RVG strains described showed 84.5 to 90.9% and 91.2 to 100% of nt and aa identity with previously detected RVG strains. In the phylogenetic tree, the two RVG strains described herein grouped with RVG strains detected in broiler chickens and partridge from South Africa, Germany, and Italy, a little distant from RVG strains detected in broiler chickens in Brazil. The detection and characterization of RVG strains in this study provide information on the presence of this RV species in broiler chickens from Paraná, the southern region of Brazil. The studies demonstrated that RV is present in both adult and young birds and in different categories of poultry production (broiler chickens and laying hens), that measures of control and prophylaxis should be implemented and monitored in the avian farms of Paraná State, besides the availability of nt and aa RVF and RVG sequences, since such data are still scarce.

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