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Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-219058

Resumo

Objetivou-se, por meio do presente estudo, caracterizar o genoma de Staphylococcus caprae (S. caprae), uma bactéria do grupo dos Staphylococcus coagulase negativos (CoNS), associada à mastite subclínica em cabras na Paraíba e suas implicações na qualidade do leite produzido. No primeiro capítulo, foi apresentado um referencial teórico abrangendo os desafios relacionados às infecções intramamárias subclínicas na caprinocultura e seu impacto na qualidade e na segurança do leite e seus derivados. Adicionalmente, foram abordados avanços tecnológicos relacionados às pesquisas em microbiológa aplicada ao setor agropecuário. No segundo capítulo, objetivou-se caracterizar genomas de S. caprae isolados associados à mastite subclínica caprina no Estado da Paraíba, identificando fatores de virulência através de análises de bioinformática. Para isso, foram selecionadas, da bacterioteca do Laboratório de Avaliação dos Produtos de Origem Animal (LAPOA), três cepas originalmente isoladas de leite caprino com mastite subclínica e previamente identificadas por MALDI-TOF. Foi realizado sequenciamento do genoma completo dessas cepas em plataforma Illumina Miseq, montagem do genoma pelo método de novo e anotação. Foram realizados estudos genômicos comparativos com outras espécies de Staphylococcus spp., buscando-se identificar genes de interesse relacionados a produção de enterotoxinas e à formação de biofilme. Foi realizado ainda um estudo filogenético utilizando 29 cepas de Staphylococcus spp., incluindo os genomas sequenciados neste estudo. Os resultados mostraram que as cepas de S. caprae isoladas de mastite caprina no Estado da Paraíba possuem elevado potencial de produção de biofilme, uma vez que todas apresentaram o operon icaADBCR. Adicionalmente, as estirpes investigadas apresentaram genes codificadores de enterotoxinas (sec, sed, seg), podendo representar um problema em saúde pública associada à intoxicação alimentar estafilocócica em seres humanos. Portanto, os resultados reforçam a necessidade de manter um programa de controle sanitário visando a redução de Staphylococcus coagulase-negativos em rebanhos caprinos, que por sua vez, apresentam-se como espécies predominantes em casos de infecções intramamária em pequenos ruminantes.

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The aim of this study was to characterize the genome of Staphylococcus caprae (S. caprae), a bacterium of coagulase-negative staphylococci (CoNS) group, associated with subclinical mastitis in dairy goat herds in Paraíba state and its implications for the quality and safety goat milk. The first chapter refers to a review covering the challenges associated with subclinical mastitis in the dairy goat sector, and the technological advances applied to research in agricultural microbiology. The second chapter presents the genome analyses of S. caprae strains associated with subclinical mastitis in goat herds in Paraíba, in which virulence factors were identified by means of downstream bioinformatics tools. S. caprae strains originally isolated from milk of goats with subclinical mastitis were selected from the collection of the Laboratory for the Evaluation of Animal Products, and confirmed by MALDI-TOF. After whole genome sequencing using Illumina high-throughput sequencing, de novo assembling and annotation, comparative genomic analyses were carried out using 26 publicly available genomes of coagulase-negative Staphylococcus strains. The results showed that S. caprae associated with subclinical mastitis in goat herds in Paraíba has great capacity for biofilm production, as all strains carried the operon icaADBCR. In addition, the investigated strains may represent a burden to public health as they carried genes encoding for staphylococcal enterotoxins (sec, sed, seg) associated with food poisoning in humans. In summary, the results reinforce the need to reduce coagulase-negative staphylococci infections in goat herds, as they represent species associated with subclinical intramammary infections in small ruminants.

Biblioteca responsável: BR68.1