DETECÇÃO MOLECULAR DE CIRCOVÍRUS SUÍNO 3 EM FLUÍDO ORAL DE SUÍNOS EM FASE DE TERMINAÇÃO NO OESTE DE SANTA CATARINA

RESUMO

A suinocultura nacional tem evoluído de forma contínua há décadas, melhorando índices reprodutivos, zootécnicos, de biosseguridade e bem-estar animal. Da mesma forma, a intensificação do confinamento dos animais favoreceu a transmissão de agentes infeciosos, resultando em desafios sanitários. Os vírus estão entre os principais desafios para manutenção da sanidade das granjas de suínos. Um dos principais, se não o principal agente patogênico na suinocultura é o circovírus suíno 2 (PCV2). Em 2015, um novo circovírus foi descrito em suínos com quadro clínico de circovirose, incluindo inflamação multissistêmica e problemas reprodutivos. Devido as similaridades estruturais dos vírions e a doença relacionada, este agente foi denominado circovírus suíno 3 (PCV3). Desde então, diversos estudos têm demonstrado o potencial patogênico deste agente, assim como a ampla distribuição deste vírus em suínos domésticos e selvagens em diversos países. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi realizar o diagnóstico e sequenciamento molecular de PCV3 em suínos em fase de terminação de granjas no oeste de Santa Catarina, importante região produtora de suínos no Brasil. As amostras foram obtidas através de coleta de fluido oral (FO), amostra de alta qualidade e utiliza um processo não invasivo e que leva em consideração o comportamento natural dos suínos. Foram acessadas amostras de 110 granjas de fase de terminação, de animais clinicamente saudáveis com idade aproximada de 100 dias. Utilizando cordas, pools de FO de 110 granjas (um pool por baia contendo 12 animais cada), contemplando desta forma uma amostragem de 1.320 suínos. As amostras foram processadas e o DNA viral foi extraído e submetido a PCR. Um total de 79 dos 110 pools (72%) foram positivos na PCR para PCV3. A sequência parcial de nucleotídeos do gene do capsídeo (ORF2) de cinco amostras foi obtida e submetidos ao banco de dados GenBank. Quando realizada a análise filogenética utilizando sequências de amostras brasileiras e de países da Europa e Ásia, fica evidente a diversidade entre as sequências obtidas. Os resultados deste estudo demonstram que o PCV3 está amplamente distribuído no oeste de Santa Catarina, maior produtor de suínos do Brasil.

ABSTRACT

National swine farming has evolved continuously for decades, improving reproductive, zootechnical, biosecurity and animal welfare rates. Likewise, the intensification of the animals' confinement favored the transmission of infectious agents, resulting in health challenges. Viruses are among the main challenges for maintaining the health of pig farms. One of the main, if not the main pathogenic agent in swine farming is the porcine circovirus 2 (PCV2). In 2015, a new circovirus was described in pigs with a clinical condition of circovirus associated disease, including multisystemic inflammation and reproductive failure. Due to the virion structure similarities and related disease, this agent was named porcine circovirus 3 (PCV3). Since then, several studies have demonstrated the pathogenic potential of this agent, as well as the worldwide distribution of this virus in domestic and wild pigs, including Brazil. Thereby, the objective of this study was to perform the molecular diagnosis of PCV3 in finishing swine of farms in Western Santa Catarina State. The samples were obtained through the collection of oral fluid (OF), a non-invasive process based on the natural behavior of swine. Samples from 110 finishing swine farms were accessed from clinically healthy animals. Using ropes, pools of FO from 110 farms (one pool per pen contain 12 animals each), contemplating a sampling of 1,320 swine. Together, the 110 farms housed approximately 74,805 pigs at the time of collection. The samples were processed and the viral genome was extracted and subjected to PCR. A total of 79 out of 110 pools (72%) were positive for PCV3 by PCR. The nucleotide sequence of the capsid gene (ORF2) from five samples was obtained and submitted to the GenBank database. When phylogenetic analysis was performed using sequences from Brazilian samples and from countries in Europe and Asia, the diversity between the sequences obtained in the present study was observed. The results of this study demonstrate that PCV3 is widely distributed in Western Santa Catarina, the largest pork producer in Brazil.