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Hemoparasitos em mamíferos silvestres oriundos da Mata Atlântica-Bahia: Um estudo de revisão sistemática, meta-análise e detecção molecular.

PATRICIA HERCILIA ARCANJO DE ALMEIDA.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-220797

Resumo

DE ALMEIDA, P.H.A. Hemoparasitos em mamíferos silvestres oriundos da Mata Atlântica-Bahia: Um estudo de revisão sistemática, meta-análise e detecção molecular. 2020, 93p. Tese (Doutorado em Ciência Animal nos Trópicos) - Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia Universidade Federal da Bahia. A Mata Atlântica é um bioma que apresenta uma grande diversidade de espécies endêmicas, como também a que possui o maior índice de espécies com perigo de extinção, fato este que torna o bioma como um hotspot para a preservação da biodiversidade. O desequilíbrio ambiental possui um forte poder na difusão e no aparecimento de doenças parasitárias em mamíferos silvestres, e dentre as parasitoses encontradastem-se aquelas causadas por protozoários. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar as taxas de infecção entre diferentes ordens de mamíferos no Brasil, através da revisão sistemática e meta-análise e conhecer a diversidade de protozoários em pequenos mamíferos oriundos do litoral Sul baiano no Estado da Bahia. Para a revisão foi realizada uma busca nas bases de dados Pubmed, Medline, Lilacs, Science direct e Scielo, sem filtro de idioma e com filtro de tempo de 2000-2020. Para condução desse processo, adotou-se a ferramenta StArt. Com base nos critérios de seleção todos os estudos que relatavam a infecção de T. cruzi em mamíferos silvestres no Brasil foram escolhidos. Para análises estatísticas foi utilizada a estatística descritiva e a meta-análise do evento dicotômico com a distribuição binominal, conduzida em Microsoft Excel. Para avaliar a heterogeneidade entre os estudos foi utilizado o cálculo das estatísticas Q e I 2 . Depois de ler todos os resumos e com base nos critérios de seleção, 35 estudos continha informações importantes da infecção em mamíferos silvestres. Entre as nove ordens de mamíferos silvestres identificadas como reservatório para o T. cruzi, três dessas ordens apresentaram maior frequência combinada: Chiroptera (55,57%); Carnívora (38,10%) e Primata (27,85%), pelo diagnóstico molecular. A detecção de protozoários foi realizada a partir de amostras de tecidos de mamíferos silvestres das ordens Rodentia e Didelphimorphia, em pool de órgãos (coração, encéfalo, pulmão, fígado e baço) de cada animal, que foram macerados e armazenados a -20oC. Para a detecção de T. cruzi foi realizada extração de DNA utilizando kit comercial e quantificação em NanoDrop®, seguida de nested-PCR para amplificação de sequências de kDNA com uso dos iniciadores S17 e S18. Dos 153 mamíferos silvestres identificados na ordem Didelphimorphia e Rodentia, foram examinados exemplares de seis e treze espécies de cada ordem, respectivamente. Um Didelphis aurita apresentou amplificação de DNA compatível com Trypanosoma ssp, correspondendo a 0,65% das amostras examinadas. Para a análise dos pools obtidos foi utilizada a técnica de sequenciamento de nova geração a partir da Plataforma Ion Torrent, foram retiradas as suspensões de tecidos que compuseram pools de até 25 amostras, agrupadas considerando as espécies de mamíferos e o seu local de origem: Una, Ilhéus, Belmonte e Mascote, resultando num total de 15 pools. Os pools obtidos foram sequenciados na Plataforma Ion Torren, sendo detectados Plasmodium berghei e P. yeolli yeolli em roedores (Hylaeamys laticeps e Thaptomys nigrita) e marsupiais (Marmosa murina) e Besnoitia besnoiti em marsupiais (Marmosa demerarae) e roedores (Akodon cursor). Nesse estudo, não houve associação entre a espécie de protozoário detectado e o município de origem da amostra, bem como a espécie. O presente estudo permitiu verificar a presença de protozoários em mamíferos silvestres no litoral Sul do Estado da Bahia, utilizando técnicas moleculares. Além disso, a revisão sistemática e meta-análise servirão como base para informar o atual contexto da infecção de T. cruzi em mamíferos silvestres noBrasil.
DE ALMEIDA, P.H.A. Molecular detection of protozoa in wild animals from Atlantic Forest. 2020, 92p. Thesis (PhD in Animal Science in the Tropics) - Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia Universidade Federal da Bahia. The Atlantic Forest is a biome that presents a great diversity of endemic species, as well asthe one that has the highest index of endangered species, a fact that makes the biome a hotspot for the preservation of biodiversity. The environmental imbalance has a strong power in the diffusion and the appearance of parasitic diseases in wild mammals, and among the parasites found there are those caused by protozoa. Thus, the objective of this work was to evaluate the infection rates among different orders of mammals in Brazil, through systematic review and meta-analysis and to know the diversity of protozoa in small mammals from the south coast of Bahia in the State of Bahia. For the review, a search was carried out in the databases Pubmed, Medline, Lilacs, Science direct and Scielo, without language filter and with 2000-2020 time filter. To conduct this process, the StArt tool was adopted. Based on the selection criteria, all studies that reported T. cruzi infection in wild mammals in Brazil were chosen. For statistical analysis, descriptive statistics, and meta-analysis of the dichotomous event with binomial distribution were used, conducted in Microsoft Excel. To assess the heterogeneity between the studies, the calculation of the Q and I 2 statistics was used. After reading all the abstracts and based on the selection criteria, 35 studies contained important information on infection in wild mammals. Among the nine orders of wild mammals identified as a reservoir for T. cruzi, three of these orders had the highest combined frequency: Chiroptera (55.57%); Carnivorous (38.10%) and Primate (27.85%), due to molecular diagnosis. The detection of protozoa was performed using tissue samples from wild mammals of the orders Rodentia and Didelphimorphia, in an organ pool (heart, brain, lung, liver and spleen) of each animal, which were macerated and stored at -20oC. For the detection of T. cruzi, DNA extraction was performed using a commercial kit and quantification in NanoDrop®, followed by nested-PCR for amplification of kDNA sequences using primers S17 and S18. Of the 153 wild mammals identified in the order Didelphimorphia and Rodentia, specimens of six and thirteen species of each order, respectively, were examined. A Didelphis aurita showed amplification of DNA compatible with Trypanosoma ssp, corresponding to 0.65% of the samples examined. For the analysis of the pools obtained, the new generation sequencing technique was used from the Ion Torrent Platform, the suspensions of tissues that composed pools of up to 25 samples were removed, grouped considering the mammal species and their place of origin: Una , Ilhéus, Belmonte and Mascote, resulting in a total of 15 pools. The pools obtained were sequenced on the Ion Torren Platform, with Plasmodium berghei and P. yeolli yeolli being detected in rodents (Hylaeamys laticeps and Thaptomys nigrita) and marsupials (Marmosa murina) and Besnoitia besnoiti in marsupials (Marmosa demerarae) and rodents (Akodon cursor). In this study, there was no association between the detected protozoan species and the municipality of origin of the sample, as well as the species. The present study allowed to verify the presence of protozoa in wild mammals on the southern coast of the State of Bahia, using molecular techniques. In addition, the systematic review and meta-analysis will serve as a basis to inform the current context of T. cruzi infection in wild mammals in Brazil.
Biblioteca responsável: BR68.1