ANÁLISE GENÔMICA E DIVERSIDADE FENOTÍPICA DE GALINHAS NATURALIZADAS DO NORDESTE BRASILEIRO

RESUMO

As galinhas naturalizadas descendem de animais trazidos pelos portugueses durante o período de colonização. Aqui sofreram processos de seleção natural durante anos, o que levou a mudanças morfológicas e fisiológicas como mecanismos de adaptação às condições ambientais adversas. Embora adaptadas, estas aves são menos produtivas que as linhagens de galinhas selecionadas e tem sido substituídas gradativamente por animais melhorados, o que levou a rápida redução e/ou diluição desse germoplasma. Muitas das galinhas naturalizadas se encontram em reduzidos núcleos de criação com mínimo controle zootécnico, na agricultura familiar, constituindo ainda a base da subsistência para essa. A conservação e utilização sustentável destes recursos genéticos, por meio dos programas de conservação das espécies domésticas e incentivo para a multiplicação do uso e reconhecimento destas raças são urgentes. Objetivou-se, portanto, caracterizar a diversidade genética e fenotípica dentro e entre os grupos genéticos, bem como suas potencialidades produtivas como estratégia para a conservação e utilização desses recursos. A caracterização fenotípica foi feita por meio de morfometria geométrica (MG), técnica recente e de alta resolução, e os índices produtivos foram avaliados por meio de curvas de crescimento e características de carcaça e cortes. Para a avaliação do crescimento foi utilizado um total de 230 aves pertencentes aos grupos genéticos nativos Peloco, Caneludo do Catolé e Canela Preta e linhagem comercial CBC. As aves tiveram os pesos mensurados semanalmente a partir do primeiro dia de idade até os 150 dias para as nativas e até os 85 dias para as aves CBC. O modelo Gompertz foi considerado o mais adequado para descrever o crescimento das aves e permitiu identificar que as aves nativas dos grupos genéticos Caneludo do Catolé, Canela Preta e Peloco apresentaram crescimento lento e maturidade tardia quando comparadas à linhagem comercial CBC. Para a caracterização de carcaça,IX foi utilizado um total de 218 aves dos quatro grupos genéticos, que tiveram o peso vivo, os pesos das carcaças (PCAR) e pesos de perna (PPER), asa (PA) e peito (PP) mensurados por meio de balança eletrônica. Para o cálculo de rendimento de carcaça (CAR) foi usado como base o peso vivo obtido individualmente e para o rendimento de perna (PER), asa (ASA) e peito (PEITO) foi utilizado o peso da carcaça eviscerada sem pescoço e pés. Dentre os grupos genéticos nativos, as aves Caneludo do Catolé apresentaram maior aptidão para produção de carne, enquanto os grupos Peloco e Canela Preta caracterizamse como aves de dupla aptidão, com potencial para criação em sistemas orgânicos e/ ou alternativos. A diversidade fenotípica via MG foi realizada a partir de 13 marcos anatômicos mensurados em imagens da cabeça de um total de 263 aves dos quatro grupos genéticos. Foi possível verificar que as aves dos grupos genéticos nativos (Caneludo do Catolé, Canela Preta e Peloco), assim como as aves da linhagem comercial CBC apresentaram dissimilaridades quanto à forma da cabeça. Embora para as aves nativas ainda exista uma grande diversidade fenotípica intrapopulacional e tendo em vista as diferenças na forma devido aos diferentes sistemas de criação e sexos, ainda foi possível distinguir as aves a partir da variação da forma da cabeça. A região proximal e terminal do bico, narinas e olhos foram as que apresentaram maior variação entre os grupos. Seguindo os princípios básicos da MG foi aplicada a técnica de assimetria flutuante (AF) para medição de características em ambos os lados do indivíduo, a fim de avaliar se o seu desenvolvimento ontogenético está sendo afetado por um fator estressante externo. Uma vez que a cadeia produtiva apresenta vários fatores que podem ser estressantes para os animais, foi verificada a existência de AF na forma e tamanho da cabeça das aves nativas dos grupos genéticos Caneludo do Catolé, Peloco e Canela Preta e linhagem comercial CBC. As aves dos três grupos genéticos nativos Peloco, Caneludo do Catolé e Canela Preta, bem como as aves da linhagem comercial CBC apresentaram AF na forma e tamanho da cabeça, provavelmente relacionado ao estresse térmico crônico. Um painel de 53.313 marcadores SNP foi utilizado para avaliar a diversidade genética, estrutura populacional e acessar a história demográfica das aves nativas Caneludo do Catolé, Peloco e Canela Preta, em comparação com a linhagem comercial industrial Cobb 500® e linhagem comercial caipira CBC. Todos os grupos genéticos nativos analisados sãoX dotados de diversidade genética e baixos níveis de endogamia. As aves nativas são mais similares e diferem grandemente das linhagens comerciais, sendo que entre as nativas, os grupos Caneludo do Catolé e Peloco são mais próximos e divergem das aves Canela Preta. Por meio da análise de mistura foi possível identificar que embora compartilhem ancestrais, as aves nativas são dotadas de combinações alélicas únicas, o que ressalta a importância da conservação e uso sustentável desses recursos genéticos.

ABSTRACT

Naturalized chickens are descended from animals brought by the Portuguese during the colonization period. Here they underwent natural selection processes for years, which led to morphological and physiological changes as mechanisms of adaptation to adverse environmental conditions. Although adapted, these birds are less productive than the selected chicken lines and have been gradually replaced by improved animals, which led to the rapid reduction and / or dilution of this germoplasm. Many of the naturalized hens are found in small breeding centers with minimal zootechnical control, in family farming, still constituting the basis of subsistence for this. The conservation and sustainable use of these genetic resources, through conservation programs for domestic species and encouraging the multiplication of the use and recognition of these breeds are urgent. Therefore, the objective was to characterize the genetic and phenotypic diversity within and between genetic groups, as well as their productive potential as a strategy for the conservation and use of these resources. The phenotypic characterization was made by means of geometrics morphometrics (GM), a recent and high resolution technique, and the production indexes were evaluated through growth curves and carcass and cut characteristics. For growth evaluation, a total of 230 birds belonging to the native genetic groups Caneludo do Catolé, Peloco and Canela Preta and commercial line CBC were used. The birds had their weights measured weekly from the first day of age up to 150 days for native birds and up to 85 days for CBC birds. The Gompertz model was considered the most adequate to describe the growth of birds and allowed to identify that the native birds of the genetic groups Caneludo do Catole, Peloco and Canela Preta presented slow growth and late maturity when compared to the commercial CBC line. For the carcass characterization, a total of 218 birds from the four genetic groups were used, which had live weight, carcass weights (PCAR) and leg weights (PPER), wing (PA) and chest (PP) measured by electronic weight scale. For theXII calculation of carcass yield (CAR), the live weight obtained individually was used as a basis and for the yield of leg (PER), wing (ASA) and chest (PEITO) the weight of the eviscerated carcass without neck and feet was used. Among the native genetic groups, the Caneludo do Catole birds showed greater aptitude for meat production, while the Peloco and Canela Preta groups are characterized as dual-purpose birds, with potential for breeding in organic and / or alternative systems. Phenotypic diversity using GM was performed from 13 anatomical landmarks measured in head images of a total of 263 birds from the four genetic groups. It was possible to verify that the birds of the native genetic groups (Caneludo do Catole, Peloco and Canela Preta), as well as the birds of the commercial line CBC showed dissimilarities as to the shape of the head. Although for native birds there is still a great intrapopulation phenotypic diversity and in view of the differences in shape due to the different rearing systems and sexes, it was still possible to distinguish birds from the variation in the shape of the head. The proximal and terminal region of the beak, nostrils and eyes showed the greatest variation between groups. Following the basic principles of GM, the technique of fluctuating asymmetry (FA) was applied to measure characteristics on both sides of the individual, in order to assess whether his ontogenetic development is being affected by an external stressor. Since the production chain has several factors that can be stressful for the animals, the existence of FA in the shape and size of the heads of the native birds of the genetic groups Canela Preta, Caneludo do Catole and Peloco and commercial line CBC was verified. The birds of the three native genetic groups Peloco, Caneludo do Catole and Canela Preta, as well as the birds of the commercial CBC lineage presented FA in the shape and size of the head, probably related to chronic thermal stress. A panel of 53,313 SNP markers was used to assess the genetic diversity, population structure and demographic history of native birds Caneludo do Catolé, Peloco and Canela Preta, compared to the commercial industrial strain Cobb 500® and commercial commercial strain CBC. All analyzed native genetic groups own genetic diversity and low levels of inbreeding. The native birds are more similar and differ greatly from commercial strains, and among the native birds, the Caneludo do Catolé and Peloco groups are closer andXIII diverge from the Canela Preta breed. Through admixture analysis, it was possible to identify that although they share ancestors, native birds own unique allelic combinations, which highlights the importance of conservation and sustainable use of these genetic resources.