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Heterogeneidade de variâncias e interação genótipo x ambiente no desempenho de animais Nelore em diferentes regiões do Mato Grosso do Sul

Simonelli, Sandra Maria.
Tese em Português | VETTESES | ID: vtt-7097

Resumo

Foram obtidos componentes de (co)variâncias, utilizando o amostrador de Gibbs, via cadeias de Markov, por meio do programa MTGSAM (Multiple Trait Gibbs Sampling) para as características peso à desmama, ajustado para 205 dias (P205), peso ao ano, ajustado para 365 dias (P365) e peso ao sobreano, ajustado para 550 dias de idade (P550). O conjunto inicial continha 105000 observações em bovinos da raça Nelore, criados nas cinco regiões do estado do Mato Grosso do Sul, provenientes do Centro Nacional de Pesquisa em Gado de Corte (CNPGC) da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa). Após restrições impostas no conjunto original de dados, obteve-se um conjunto final de 68345 observações. As características estudadas foram consideradas características distintas em cada região, em um modelo que incluiu como efeitos fixos o grupo contemporâneo, o sexo dos animais além da covariável idade da mãe ao parto (linear e quadrático), sendo a covariável considerada somente para P205. Como efeitos aleatórios para P205, foram considerados os efeitos genéticos direto, materno e permanente de ambiente e para P365 e P550, foi considerado somente o efeito genético direto. Para os efeitos fixos, foi assumida distribuição uniforme e, para os componentes de variância genética direta e materna, permanente de ambiente e residual, foi assumida distribuição de Wishart Invertida. Um primeiro estudo foi realizado com o objetivo de estudar a convergência das cadeias geradas pelo amostrador de Gibbs, utilizando diferentes intervalos de retirada. Foram adotados intervalos de retirada de 40, 200, 400, 600, 800, 1000 e 1200 iterações, sendo consideradas amostras de uma cadeia de 530000 iterações, com período de descarte de 5000 iterações, e foi verificada a convergência das distribuições das cadeias geradas em cada um destes intervalos, somente para P205. Foram calculadas as médias e desvios padrão para os valores gerados. A verificação da convergência das distribuições das cadeias geradas pelo amostrador de Gibbs foi realizada pela biblioteca CODA (Convergence Diagnosis and Output Analysis) e o método adotado foi o de Heidelberg & Welch (1983). Para efeito de comparação, foram tomados componentes de (co)variâncias que atingiram e que não atingiram a convergência. A convergência para os componentes de (co)variâncias ocorreu a diferentes intervalos. O componente de covariância entre o efeito genético direto da região 5 e materno da região 2 foi o único que não obteve a convergência com nenhum intervalo de retirada, não atingindo, assim, distribuição estacionária. O comportamento das médias posteriores nos diferentes intervalos foi bastante semelhante, tanto para as cadeias que obtiveram como para as cadeias que não obtiveram a convergência e, ao considerar os desvios padrão posteriores do componente de variância, as médias posteriores são abrangidas em todos os intervalos. Pôde-se concluir neste trabalho que uma cadeia não atingindo a convergência, depois de um grande número de iterações, não implicou em modificações expressivas nas estimativas obtidas, não causando modificações importantes nas estimativas dos valores genéticos dos animais. O segundo trabalho foi realizado com o objetivo de verificar a existência de heterogeneidade de variâncias entre as cinco regiões do Estado do Mato Grosso do Sul. As características estudadas neste trabalho foram o P205, o P365 e o P550. Para o P205, foram realizadas 530000 iterações, com intervalo de retirada de 600 iterações
Biblioteca responsável: BR68.1