Detalhe da pesquisa
1.
Methods to Discover and Validate Biofluid-Based Biomarkers in Neurodegenerative Dementias.
Mol Cell Proteomics
; 22(10): 100629, 2023 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37557955
2.
Structural flexibility and heterogeneity of recombinant human glial fibrillary acidic protein (GFAP).
Proteins
; 92(5): 649-664, 2024 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38149328
3.
Deciphering Protein Secretion from the Brain to Cerebrospinal Fluid for Biomarker Discovery.
J Proteome Res
; 22(9): 3068-3080, 2023 09 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37606934
4.
PIPENN: protein interface prediction from sequence with an ensemble of neural nets.
Bioinformatics
; 38(8): 2111-2118, 2022 04 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35150231
5.
INFLECT: an R-package for cytometry cluster evaluation using marker modality.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 487, 2022 Nov 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36384426
6.
SeRenDIP-CE: sequence-based interface prediction for conformational epitopes.
Bioinformatics
; 37(20): 3421-3427, 2021 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33974039
7.
The hydrophobic effect characterises the thermodynamic signature of amyloid fibril growth.
PLoS Comput Biol
; 16(5): e1007767, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32365068
8.
SeRenDIP: SEquential REmasteriNg to DerIve profiles for fast and accurate predictions of PPI interface positions.
Bioinformatics
; 35(22): 4794-4796, 2019 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31116381
9.
Tailor-made multiple sequence alignments using the PRALINE 2 alignment toolkit.
Bioinformatics
; 35(24): 5315-5317, 2019 12 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31368486
10.
Training for translation between disciplines: a philosophy for life and data sciences curricula.
Bioinformatics
; 34(13): i4-i12, 2018 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29950011
11.
Motif-Aware PRALINE: Improving the alignment of motif regions.
PLoS Comput Biol
; 14(11): e1006547, 2018 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30383764
12.
BioASF: a framework for automatically generating executable pathway models specified in BioPAX.
Bioinformatics
; 32(12): i60-i69, 2016 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27307645
13.
metaModules identifies key functional subnetworks in microbiome-related disease.
Bioinformatics
; 32(11): 1678-85, 2016 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26342232
14.
NGS-eval: NGS Error analysis and novel sequence VAriant detection tooL.
Nucleic Acids Res
; 43(W1): W301-5, 2015 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25878034
15.
Consistent Treatment of Hydrophobicity in Protein Lattice Models Accounts for Cold Denaturation.
Phys Rev Lett
; 116(7): 078101, 2016 Feb 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26943560
16.
The hydrophobic temperature dependence of amino acids directly calculated from protein structures.
PLoS Comput Biol
; 11(5): e1004277, 2015 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26000449
17.
Mapping the Protein Fold Universe Using the CamTube Force Field in Molecular Dynamics Simulations.
PLoS Comput Biol
; 11(10): e1004435, 2015 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26505754
18.
Bioinformatics and systems biology: bridging the gap between heterogeneous student backgrounds.
Brief Bioinform
; 14(5): 589-98, 2013 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23603092
19.
Unraveling the outcome of 16S rDNA-based taxonomy analysis through mock data and simulations.
Bioinformatics
; 30(11): 1530-8, 2014 Jun 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24519382
20.
Coarse-grained versus atomistic simulations: realistic interaction free energies for real proteins.
Bioinformatics
; 30(3): 326-34, 2014 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24273239