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1.
Appl Microbiol Biotechnol ; 93(1): 285-93, 2012 Jan.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21874276

RESUMO

AmyR is commonly considered a regulator of starch degradation whose activity is induced by the presence of maltose, the disaccharide building block of starch. In this study, we demonstrate that the role of AmyR extends beyond starch degradation. Enzyme activity assays, genes expression analysis and growth profiling on D-glucose- and D-galactose-containing oligo- and polysaccharides showed that AmyR regulates the expression of some of the Aspergillus niger genes encoding α- and ß-glucosidases, α- and ß- galactosidases, as well as genes encoding α-amlyases and glucoamylases. In addition, we provide evidence that D-glucose or a metabolic product thereof may be the inducer of the AmyR system in A. niger and not maltose, as is commonly assumed.


Assuntos
Aspergillus niger/metabolismo , Proteínas Fúngicas/metabolismo , Galactose/metabolismo , Regulação Bacteriana da Expressão Gênica , Glucose/metabolismo , Polissacarídeos/metabolismo , Transativadores/metabolismo , Aspergillus niger/genética , Proteínas Fúngicas/genética , Níger , Transativadores/genética
2.
Biochem J ; 400(1): 43-52, 2006 Nov 15.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-16822232

RESUMO

The fungus Aspergillus niger is an industrial producer of pectin-degrading enzymes. The recent solving of the genomic sequence of A. niger allowed an inventory of the entire genome of the fungus for potential carbohydrate-degrading enzymes. By applying bioinformatics tools, 12 new genes, putatively encoding family 28 glycoside hydrolases, were identified. Seven of the newly discovered genes form a new gene group, which we show to encode exoacting pectinolytic glycoside hydrolases. This group includes four exo-polygalacturonan hydrolases (PGAX, PGXA, PGXB and PGXC) and three putative exo-rhamnogalacturonan hydrolases (RGXA, RGXB and RGXC). Biochemical identification using polygalacturonic acid and xylogalacturonan as substrates demonstrated that indeed PGXB and PGXC act as exo-polygalacturonases, whereas PGXA acts as an exo-xylogalacturonan hydrolase. The expression levels of all 21 genes were assessed by microarray analysis. The results from the present study demonstrate that exo-acting glycoside hydrolases play a prominent role in pectin degradation.


Assuntos
Aspergillus niger/enzimologia , Proteínas Fúngicas/metabolismo , Glicosídeo Hidrolases/metabolismo , Pectinas/metabolismo , Acetilesterase/genética , Acetilesterase/metabolismo , Sequência de Aminoácidos , Aspergillus niger/efeitos dos fármacos , Aspergillus niger/genética , Carboidratos/farmacologia , DNA Fúngico/química , DNA Fúngico/genética , Proteínas Fúngicas/genética , Regulação Enzimológica da Expressão Gênica/efeitos dos fármacos , Regulação Fúngica da Expressão Gênica/efeitos dos fármacos , Genoma Fúngico/genética , Glicosídeo Hidrolases/genética , Concentração de Íons de Hidrogênio , Isoenzimas/genética , Isoenzimas/metabolismo , Dados de Sequência Molecular , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos , Filogenia , RNA Mensageiro/genética , RNA Mensageiro/metabolismo , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Alinhamento de Sequência , Análise de Sequência de DNA , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Especificidade por Substrato
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