Detalhe da pesquisa
1.
Machine learning-driven multiscale modeling reveals lipid-dependent dynamics of RAS signaling proteins.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(1)2022 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34983849
2.
Exploring CRD mobility during RAS/RAF engagement at the membrane.
Biophys J
; 121(19): 3630-3650, 2022 10 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35778842
3.
Encapsulin carrier proteins for enhanced expression of antimicrobial peptides.
Biotechnol Bioeng
; 117(3): 603-613, 2020 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31709513
4.
ddcMD: A fully GPU-accelerated molecular dynamics program for the Martini force field.
J Chem Phys
; 153(4): 045103, 2020 Jul 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32752727
5.
Computational Lipidomics of the Neuronal Plasma Membrane.
Biophys J
; 113(10): 2271-2280, 2017 Nov 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29113676
6.
An Electrostatic Funnel in the GABA-Binding Pathway.
PLoS Comput Biol
; 12(4): e1004831, 2016 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27119953
7.
Re-directing bacterial microcompartment systems to enhance recombinant expression of lysis protein E from bacteriophage ÏX174 in Escherichia coli.
Microb Cell Fact
; 16(1): 71, 2017 Apr 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28446197
8.
GABAA receptor target of tetramethylenedisulfotetramine.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(23): 8607-12, 2014 Jun 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24912155
9.
Molecular Dynamics Simulations Reveal the Conformational Flexibility of Lipid II and Its Loose Association with the Defensin Plectasin in the Staphylococcus aureus Membrane.
Biochemistry
; 55(23): 3303-14, 2016 06 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27158738
10.
A method to predict blood-brain barrier permeability of drug-like compounds using molecular dynamics simulations.
Biophys J
; 107(3): 630-641, 2014 Aug 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25099802
11.
Identification of critical amino acids within the nucleoprotein of Tacaribe virus important for anti-interferon activity.
J Biol Chem
; 288(12): 8702-8711, 2013 Mar 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23382389
12.
Membrane lipids drive formation of KRAS4b-RAF1 RBDCRD nanoclusters on the membrane.
Commun Biol
; 7(1): 242, 2024 Feb 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38418613
13.
Identification of a possible secondary picrotoxin-binding site on the GABA(A) receptor.
Chem Res Toxicol
; 26(10): 1444-54, 2013 Oct 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24028067
14.
Advances in Computational Approaches for Estimating Passive Permeability in Drug Discovery.
Membranes (Basel)
; 13(11)2023 Oct 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37999336
15.
The confluence of machine learning and multiscale simulations.
Curr Opin Struct Biol
; 80: 102569, 2023 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36966691
16.
Martini 3 Coarse-Grained Force Field for Cholesterol.
J Chem Theory Comput
; 19(20): 7387-7404, 2023 Oct 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37796943
17.
Machine Learning-Driven Multiscale Modeling: Bridging the Scales with a Next-Generation Simulation Infrastructure.
J Chem Theory Comput
; 19(9): 2658-2675, 2023 May 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37075065
18.
Biophysical Characterization of Membrane Proteins Embedded in Nanodiscs Using Fluorescence Correlation Spectroscopy.
Membranes (Basel)
; 12(4)2022 Mar 31.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35448362
19.
Asynchronous Reciprocal Coupling of Martini 2.2 Coarse-Grained and CHARMM36 All-Atom Simulations in an Automated Multiscale Framework.
J Chem Theory Comput
; 18(8): 5025-5045, 2022 Aug 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35866871
20.
Correlated conformational dynamics of the human GluN1-GluN2A type N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor.
J Mol Model
; 27(6): 162, 2021 May 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33969428