Pesquisa | BVS Doenças Infecciosas e Parasitárias

1.

Methylation guide RNA evolution in archaea: structure, function and genomic organization of 110 C/D box sRNA families across six Pyrobaculum species.

Lui, Lauren M; Uzilov, Andrew V; Bernick, David L; Corredor, Andrea; Lowe, Todd M; Dennis, Patrick P.

Nucleic Acids Res ; 46(11): 5678-5691, 2018 06 20.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29771354

2.

C/D box sRNA-guided 2'-O-methylation patterns of archaeal rRNA molecules.

Dennis, Patrick P; Tripp, Vanessa; Lui, Lauren; Lowe, Todd; Randau, Lennart.

BMC Genomics ; 16: 632, 2015 Aug 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26296872

3.

Thermodynamic modeling of variations in the rate of RNA chain elongation of E. coli rrn operons.

Fange, David; Mellenius, Harriet; Dennis, Patrick P; Ehrenberg, Måns.

Biophys J ; 106(1): 55-64, 2014 Jan 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-24411237

4.

Discovery of Pyrobaculum small RNA families with atypical pseudouridine guide RNA features.

Bernick, David L; Dennis, Patrick P; Höchsmann, Matthias; Lowe, Todd M.

RNA ; 18(3): 402-11, 2012 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22282340

5.

Control of rRNA synthesis in Escherichia coli: a systems biology approach.

Dennis, Patrick P; Ehrenberg, Mans; Bremer, Hans.

Microbiol Mol Biol Rev ; 68(4): 639-68, 2004 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-15590778

6.

Small non-coding RNAs in Archaea.

Dennis, Patrick P; Omer, Arina.

Curr Opin Microbiol ; 8(6): 685-94, 2005 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-16256421

7.

Free RNA polymerase in Escherichia coli.

Patrick, Michael; Dennis, Patrick P; Ehrenberg, Mans; Bremer, Hans.

Biochimie ; 119: 80-91, 2015 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26482806

8.

Medium-dependent control of the bacterial growth rate.

Ehrenberg, Måns; Bremer, Hans; Dennis, Patrick P.

Biochimie ; 95(4): 643-58, 2013 Apr.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-23228516

9.

Comparative genomic and transcriptional analyses of CRISPR systems across the genus Pyrobaculum.

Bernick, David L; Cox, Courtney L; Dennis, Patrick P; Lowe, Todd M.

Front Microbiol ; 3: 251, 2012.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22811677

10.

Diversity of Antisense and Other Non-Coding RNAs in Archaea Revealed by Comparative Small RNA Sequencing in Four Pyrobaculum Species.

Bernick, David L; Dennis, Patrick P; Lui, Lauren M; Lowe, Todd M.

Front Microbiol ; 3: 231, 2012.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22783241

11.

Modulation of Chemical Composition and Other Parameters of the Cell at Different Exponential Growth Rates.

Bremer, Hans; Dennis, Patrick P.

EcoSal Plus ; 3(1)2008 Sep.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26443740

12.

Probing the structure and function of an archaeal C/D-box methylation guide sRNA.

Omer, Arina D; Zago, Maria; Chang, Alex; Dennis, Patrick P.

RNA ; 12(9): 1708-20, 2006 Sep.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-16861619

13.

The expanding world of small RNAs in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus solfataricus.

Zago, Maria A; Dennis, Patrick P; Omer, Arina D.

Mol Microbiol ; 55(6): 1812-28, 2005 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-15752202

14.

RNA-guided nucleotide modification of ribosomal and non-ribosomal RNAs in Archaea.

Ziesche, Sonia M; Omer, Arina D; Dennis, Patrick P.

Mol Microbiol ; 54(4): 980-93, 2004 Nov.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-15522081

15.

In vitro reconstitution and activity of a C/D box methylation guide ribonucleoprotein complex.

Omer, Arina D; Ziesche, Sonia; Ebhardt, Holger; Dennis, Patrick P.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 99(8): 5289-94, 2002 Apr 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-11959980

16.

RNA-modifying machines in archaea.

Omer, Arina D; Ziesche, Sonia; Decatur, Wayne A; Fournier, Maurille J; Dennis, Patrick P.

Mol Microbiol ; 48(3): 617-29, 2003 May.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12694609

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