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Am J Hum Genet ; 99(1): 56-75, 2016 Jul 07.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27321945

RESUMO

Knowledge of the genetic basis of the type 2 diabetes (T2D)-related quantitative traits fasting glucose (FG) and insulin (FI) in African ancestry (AA) individuals has been limited. In non-diabetic subjects of AA (n = 20,209) and European ancestry (EA; n = 57,292), we performed trans-ethnic (AA+EA) fine-mapping of 54 established EA FG or FI loci with detailed functional annotation, assessed their relevance in AA individuals, and sought previously undescribed loci through trans-ethnic (AA+EA) meta-analysis. We narrowed credible sets of variants driving association signals for 22/54 EA-associated loci; 18/22 credible sets overlapped with active islet-specific enhancers or transcription factor (TF) binding sites, and 21/22 contained at least one TF motif. Of the 54 EA-associated loci, 23 were shared between EA and AA. Replication with an additional 10,096 AA individuals identified two previously undescribed FI loci, chrX FAM133A (rs213676) and chr5 PELO (rs6450057). Trans-ethnic analyses with regulatory annotation illuminate the genetic architecture of glycemic traits and suggest gene regulation as a target to advance precision medicine for T2D. Our approach to utilize state-of-the-art functional annotation and implement trans-ethnic association analysis for discovery and fine-mapping offers a framework for further follow-up and characterization of GWAS signals of complex trait loci.


Assuntos
Glicemia/genética , Diabetes Mellitus Tipo 2/genética , Etnicidade/genética , Jejum/metabolismo , Insulina/metabolismo , Grupos Raciais/genética , Povo Asiático/genética , População Negra/genética , Elementos Facilitadores Genéticos/genética , Feminino , Frequência do Gene/genética , Estudo de Associação Genômica Ampla , Humanos , Resistência à Insulina/genética , Íntrons/genética , Ilhotas Pancreáticas/metabolismo , Masculino , Anotação de Sequência Molecular , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Locos de Características Quantitativas/genética , Fatores de Transcrição/metabolismo , População Branca/genética
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