Detalhe da pesquisa
1.
COBREXA.jl: constraint-based reconstruction and exascale analysis.
Bioinformatics
; 38(4): 1171-1172, 2022 01 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34791064
2.
Personalized whole-body models integrate metabolism, physiology, and the gut microbiome.
Mol Syst Biol
; 16(5): e8982, 2020 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32463598
3.
The Virtual Metabolic Human database: integrating human and gut microbiome metabolism with nutrition and disease.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D614-D624, 2019 01 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30371894
4.
The Microbiome Modeling Toolbox: from microbial interactions to personalized microbial communities.
Bioinformatics
; 35(13): 2332-2334, 2019 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30462168
5.
DistributedFBA.jl: high-level, high-performance flux balance analysis in Julia.
Bioinformatics
; 33(9): 1421-1423, 2017 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28453682
6.
Visualization of automatically combined disease maps and pathway diagrams for rare diseases.
Front Bioinform
; 3: 1101505, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37502697
7.
Model-based assessment of mammalian cell metabolic functionalities using omics data.
Cell Rep Methods
; 1(3)2021 07 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34761247
8.
GigaSOM.jl: High-performance clustering and visualization of huge cytometry datasets.
Gigascience
; 9(11)2020 11 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33205814
9.
Systematic assessment of secondary bile acid metabolism in gut microbes reveals distinct metabolic capabilities in inflammatory bowel disease.
Microbiome
; 7(1): 75, 2019 05 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31092280
10.
Creation and analysis of biochemical constraint-based models using the COBRA Toolbox v.3.0.
Nat Protoc
; 14(3): 639-702, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30787451