Relevance of reviewing endpoint analysis for negative results on the Xpert Xpress Flu/RSV.

After the implementation of the Xpert Xpress Flu/respiratory syncytial virus (RSV) assay for rapid respiratory molecular testing, we investigated the significance of reported endpoint values for influenza A, influenza B, and RSV). This study prospectively analyzed nasopharyngeal swabs submitted to our virology laboratory in the 2018/19 influenza season. Initial testing was performed on the Xpress Flu/RSV assay. Samples were further tested on a laboratory-developed multiplex polymerase chain reaction (laboratory-developed multiplex respiratory test [LDT]) if the sample was reported as negative by the Xpress Flu/RSV but had an elevated endpoint value ≥5 for any respiratory virus target. There were 1040 negative results on the Xpress Flu/RSV; thirty-one had at least one endpoint value ≥5 [influenza A (25), influenza B (1), RSV (2), influenza A/RSV (1), and influenza A/B/RSV (2)]. Five samples (5/31, 16.1%) were positive on the LDT for influenza A or RSV. In contrast, the positivity rate on the LDT for negative Xpress Flu/RSV samples with endpoint values less than 5 was 0.35% (P < .0001). A threshold for endpoint values could not reliably be established to differentiate a potential influenza A positive result from a negative result on the LDT. Routine evaluation ofendpoint values should be a consideration for laboratories implementing Xpress Flu/RSV, in addition to supplementary respiratory virus testing for clinically relevant situations.

Utility of Rapid Influenza Molecular Testing in an Outpatient Hemodialysis Unit: A Prospective Cohort Study.

BACKGROUND: Early initiation of antiviral therapy for individuals at risk for severe influenza infection is important for improving patient outcomes. Current guidelines recommend empiric antiviral therapy for patients with end-stage kidney disease presenting with suspected influenza infection. Rapid molecular influenza assays may reduce diagnostic uncertainty and improve patient outcomes by providing faster diagnostics compared to traditional batched polymerase chain reaction (PCR) testing. OBJECTIVE: To determine the utility of implementing a rapid influenza PCR assay compared to the standard of care in a hemodialysis unit. DESIGN: This is a prospective cohort study. SETTING: A hospital-based dialysis unit in a tertiary care hospital. PATIENTS: Adult patients with end-stage kidney disease on intermittent hemodialysis. MEASUREMENTS: Patient characteristics, influenza PCR swab results, antibiotic prescriptions, antiviral prescriptions, emergency room visits and hospitalizations. METHODS: From November 1, 2017 to March 31, 2018, we assigned samples collected from a single center, hemodialysis unit to be processed using a rapid influenza PCR (cobas® Influenza A/B & respiratory syncytial virus assay) or the standard of care (in-house developed multiplex PCR). Samples were assigned to the rapid PCR if the patient received dialysis treatment in the morning dialysis shift, while the remainder were processed as per standard of care. Study outcomes included the time from collection to result of nasopharyngeal swab, prescription of influenza antiviral therapy, time to receiving prescription, and the need for emergency department visit or hospitalization within 2 weeks of presentation. RESULTS: During the study period, 44 patients were assessed (14 with the rapid PCR and 30 with the standard of care assay). Compared to conventional testing, the time to result was shorter using rapid PCR compared to conventional testing (2.3 vs 22.6 hours, P < .0001). Individuals who were tested using the rapid PCR had a tendency to shorter time to receiving antiviral prescriptions (0.7 days vs 2.1 days, P = .11), and fewer emergency department visits (7.1% vs 30%, P = .13) but no difference in hospitalizations (14.3% vs 30%, P = .46) within 2 weeks of testing. LIMITATIONS: This is a single center non-randomized study with a relatively small sample size. Patients who were tested using the standard of care assay experienced a delay in the prescription of antiviral therapy which deviates from recommended clinical practice. CONCLUSIONS: Rapid influenza molecular testing in the hemodialysis unit was associated with a shorter time to a reportable result and with a tendency to reduced time to prescription of antiviral therapy. Rapid molecular testing should be compared with standard of care (empiric therapy) in terms of economic costs, adverse events, and influenza-related outcomes.

CONTEXTE: L'initiation précoce d'un traitement antiviral est essentielle pour améliorer les résultats de santé des personnes exposées à un grand risque d'infection grippale. Chez les patients atteints d'insuffisance rénale terminale (IRT) suspectés d'une infection grippale, les recommandations actuelles préconisent une approche empirique de traitement antiviral. Les tests moléculaires de dépistage rapide du virus influenza peuvent réduire l'incertitude diagnostique et améliorer les résultats pour les patients en posant un diagnostic plus rapidement que les tests PCR en lots traditionnellement utilisés. OBJECTIF: Mesurer l'intérêt de mettre en place un test PCR de dépistage rapide de la grippe comparativement à la norme de soins d'une unité d'hémodialyse. TYPE D'ÉTUDE: Étude de cohorte prospective. CADRE: Une unité de dialyze hospitalière de soins tertiaires. SUJETS: Des adultes atteints d'IRT et traités par hémodialyse intermittente. MESURES: Les caractéristiques des patients, les résultats de dépistage du virus influenza, les prescriptions d'antibiotiques et d'antiviraux, les visites à l'urgence et les hospitalisations. MÉTHODOLOGIE: Entre le 1er novembre 2017 et le 31 mars 2018, les échantillons prélevés à l'unité d'hémodialyse du center ont été répartis pour être analysés soit par la méthode PCR de dépistage rapide (cobas®Essai Influenza A/B & VRS), soit par la méthode traditionnellement utilisée (PCR multiplex mises au point à l'interne). Les prélèvements des patients dialysés pendant le quart de travail du matin ont été assignés à la méthode rapide, les autres ont été testés par la méthode traditionnelle. Les résultats incluaient le délai entre le prélèvement et le résultat de l'écouvillonnage naso-pharyngé, la prescription d'un traitement antiviral, le temps requis pour obtenir la prescription et la nécessité de se rendre à l'urgence ou d'être hospitalisé dans les deux semaines suivant la présentation des symptômes. RÉSULTATS: Au cours de l'étude, 44 patients ont été diagnostiqués avec la méthode rapide par PCR (n=14) ou la méthode traditionnelle (n=30). Comparativement à la méthode traditionnelle, la méthode rapide par PCR a permis de réduire le temps d'obtention du résultat (2,3 h contre 22,6 h pour la méthode traditionnelle; P < .0001). Les patients diagnostiqués avec la méthode rapide par PCR tendaient à obtenir une ordonnance d'antiviraux plus rapidement (0,7 jour contre 2,1 pour la méthode traditionnelle; P = .11) et à avoir visité l'urgence moins souvent (7,1 % contre 30 % pour la méthode traditionnelle, P = .13), mais ne présentaient aucune différence significative dans le nombre d'hospitalisations (14,3 % contre 30 % pour la méthode traditionnelle; P = .46) dans les deux semaines de suivi. LIMITES: Il s'agit d'une étude non répartie aléatoirement, qui s'est tenue dans un seul center et sur un échantillon relativement restreint. Les patients diagnostiqués avec la méthode traditionnelle ont subi un retard dans la prescription du traitement antiviral, ce qui s'écarte de la pratique clinique recommandée. CONCLUSION: Chez les patients d'une unité d'hémodialyse, le dépistage moléculaire rapide du virus influenza a été associé à un diagnostic plus rapide et à une tendance à une réduction du délai de prescription du traitement antiviral. Il serait pertinent de comparer le dépistage moléculaire rapide avec la norme standard de soin (traitement empirique) en ce qui concerne les coûts, les événements indésirables et les issues de santé liées à la grippe.