Detalhe da pesquisa
1.
The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism.
Nature
; 496(7443): 57-63, 2013 Apr 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23485966
2.
Phylogenetic Analysis of Klebsiella pneumoniae from Hospitalized Children, Pakistan.
Emerg Infect Dis
; 23(11): 1872-1875, 2017 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29048298
3.
The TraDIS toolkit: sequencing and analysis for dense transposon mutant libraries.
Bioinformatics
; 32(7): 1109-11, 2016 04 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26794317
4.
Rapid phylogenetic analysis of large samples of recombinant bacterial whole genome sequences using Gubbins.
Nucleic Acids Res
; 43(3): e15, 2015 Feb 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25414349
5.
Roary: rapid large-scale prokaryote pan genome analysis.
Bioinformatics
; 31(22): 3691-3, 2015 Nov 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26198102
6.
IVA: accurate de novo assembly of RNA virus genomes.
Bioinformatics
; 31(14): 2374-6, 2015 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25725497
7.
A global resource for genomic predictions of antimicrobial resistance and surveillance of Salmonella Typhi at pathogenwatch.
Nat Commun
; 12(1): 2879, 2021 05 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34001879
8.
Rapid multi-locus sequence typing direct from uncorrected long reads using Krocus.
PeerJ
; 6: e5233, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30083440
9.
SeroBA: rapid high-throughput serotyping of Streptococcus pneumoniae from whole genome sequence data.
Microb Genom
; 4(7)2018 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29870330
10.
PlasmidTron: assembling the cause of phenotypes and genotypes from NGS data.
Microb Genom
; 4(3)2018 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29533742
11.
Comparison of classical multi-locus sequence typing software for next-generation sequencing data.
Microb Genom
; 3(8): e000124, 2017 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29026660
12.
ARIBA: rapid antimicrobial resistance genotyping directly from sequencing reads.
Microb Genom
; 3(10): e000131, 2017 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29177089
13.
SNP-sites: rapid efficient extraction of SNPs from multi-FASTA alignments.
Microb Genom
; 2(4): e000056, 2016 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28348851
14.
Robust high-throughput prokaryote de novo assembly and improvement pipeline for Illumina data.
Microb Genom
; 2(8): e000083, 2016 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28348874
15.
Circlator: automated circularization of genome assemblies using long sequencing reads.
Genome Biol
; 16: 294, 2015 Dec 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26714481
16.
Phylogeographical analysis of the dominant multidrug-resistant H58 clade of Salmonella Typhi identifies inter- and intracontinental transmission events.
Nat Genet
; 47(6): 632-9, 2015 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25961941
17.
Epithelial IL-22RA1-mediated fucosylation promotes intestinal colonization resistance to an opportunistic pathogen.
Cell Host Microbe
; 16(4): 504-16, 2014 Oct 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25263220
18.
Corrigendum: SeroBA: rapid high-throughput serotyping of Streptococcus pneumoniae from whole genome sequence data.
Microb Genom
; 4(8)2018 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30175955