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1.
Biosci Biotechnol Biochem ; 75(6): 1160-6, 2011.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21670507

RESUMO

Deblocking aminopeptidase (DAP) is an exoprotease that can release N-terminal amino acids from blocked peptides. Three DAP homologous (TkDAP1, TkDAP2, and TkDAP3) are annotated in the genome data base of Thermococcus kodakarensis KOD1. TkDAP2 and TkDAP3 were identified as proteins that are overexpressed in response to heat and oxidative stress by two-dimensional electrophoresis. In this study, the TkDAP1 and TkDAP2 genes were cloned and expressed in Escherichia coli. The two proteins were purified homogeneity and analyzed by gel filtration chromatography and electron microscopy. TkDAP1 showed two oligomers, which were identified as an octodecimer and a dodecamer. TkDAP2 produced three native forms: octodecimer, dodecamer, and trimer. Dodecamer assembly was the main form in the two proteins. Finally, TkDAP1 was found to have higher deblocking aminopeptidase activity on the substrates of Ac-Leu-pNA and Ac-Ala-Ala-Ala, while TkDAP2 had higher aminopeptidase activity on the substrates of Leu-pNA and Ala-Ala-Ala-pNA.


Assuntos
Aminopeptidases/metabolismo , Proteínas Arqueais/metabolismo , Isoenzimas/metabolismo , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Thermococcus/enzimologia , Sequência de Aminoácidos , Aminopeptidases/química , Aminopeptidases/genética , Aminopeptidases/ultraestrutura , Proteínas Arqueais/química , Proteínas Arqueais/genética , Proteínas Arqueais/ultraestrutura , Cromatografia em Gel , Clonagem Molecular , Eletroforese em Gel Bidimensional , Escherichia coli , Expressão Gênica , Temperatura Alta , Isoenzimas/química , Isoenzimas/genética , Isoenzimas/ultraestrutura , Microscopia Eletrônica , Dados de Sequência Molecular , Oligopeptídeos/metabolismo , Plasmídeos , Polimerização , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/ultraestrutura , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por Matriz , Especificidade por Substrato , Thermococcus/genética , Transformação Bacteriana
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