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1.
J Bacteriol ; 185(14): 4204-10, 2003 Jul.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-12837795

RESUMO

The structure of the recombinant Escherichia coli protein YbcJ, a representative of a conserved family of bacterial proteins (COG2501), was determined by nuclear magnetic resonance. The fold of YbcJ identified it as a member of the larger family of S4-like RNA binding domains. These domains bind to structured RNA, such as that found in tRNA, rRNA, and a pseudoknot of mRNA. The structure of YbcJ revealed a highly conserved patch of basic residues, comprising amino acids K26, K38, R55, K56, and K59, which likely participate in RNA binding.


Assuntos
Proteínas de Escherichia coli/química , Escherichia coli/metabolismo , RNA Bacteriano/metabolismo , Proteínas de Ligação a RNA/química , Motivos de Aminoácidos , Sequência de Aminoácidos , Escherichia coli/genética , Proteínas de Escherichia coli/genética , Proteínas de Escherichia coli/metabolismo , Modelos Moleculares , Dados de Sequência Molecular , Ressonância Magnética Nuclear Biomolecular , Conformação Proteica , Dobramento de Proteína , Estrutura Secundária de Proteína , Estrutura Terciária de Proteína , Proteínas de Ligação a RNA/genética , Proteínas de Ligação a RNA/metabolismo , Proteínas Recombinantes/química , Soluções
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