Detalhe da pesquisa
1.
Using protein language models for protein interaction hot spot prediction with limited data.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 115, 2024 Mar 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38493120
2.
Allosteric coupling between transmembrane segment 4 and the selectivity filter of TALK1 potassium channels regulates their gating by extracellular pH.
J Biol Chem
; 298(6): 101998, 2022 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35500647
3.
PPI-HotspotDB: Database of Protein-Protein Interaction Hot Spots.
J Chem Inf Model
; 62(4): 1052-1060, 2022 02 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35147037
4.
Factors allowing small monovalent Li+ to displace Ca2+ in proteins.
Phys Chem Chem Phys
; 24(29): 17759-17769, 2022 Jul 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35848546
5.
Influence of solution ionic strength on the stabilities of M20 loop conformations in apo E. coli dihydrofolate reductase.
J Chem Phys
; 154(19): 195103, 2021 May 21.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34240890
6.
How the Local Environment of Functional Sites Regulates Protein Function.
J Am Chem Soc
; 142(22): 9861-9871, 2020 06 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32407086
7.
Free and Bound Therapeutic Lithium in Brain Signaling.
Acc Chem Res
; 52(10): 2960-2970, 2019 10 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31556294
8.
Soluble klotho regulates TRPC6 calcium signaling via lipid rafts, independent of the FGFR-FGF23 pathway.
FASEB J
; 33(8): 9182-9193, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31063704
9.
Benchmarking polarizable and non-polarizable force fields for Ca2+-peptides against a comprehensive QM dataset.
J Chem Phys
; 153(14): 144102, 2020 Oct 14.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33086838
10.
Factors Governing the Different Functions of Zn2+-Sites with Identical Ligands in Proteins.
J Chem Inf Model
; 59(9): 3946-3954, 2019 09 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31469957
11.
The Zinc Linchpin Motif in the DNA Repair Glycosylase MUTYH: Identifying the Zn2+ Ligands and Roles in Damage Recognition and Repair.
J Am Chem Soc
; 140(41): 13260-13271, 2018 10 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30208271
12.
Modeled structural basis for the recognition of α2-3-sialyllactose by soluble Klotho.
FASEB J
; 31(8): 3574-3586, 2017 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28442546
13.
How Pb2+ Binds and Modulates Properties of Ca2+-Signaling Proteins.
Inorg Chem
; 57(23): 14798-14809, 2018 Dec 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30411871
14.
How First Shell-Second Shell Interactions and Metal Substitution Modulate Protein Function.
Inorg Chem
; 57(22): 14052-14061, 2018 Nov 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29906119
15.
Factors governing when a metal-bound water is deprotonated in proteins.
Phys Chem Chem Phys
; 20(47): 29625-29636, 2018 Dec 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30465571
16.
An efficient protocol for computing the pKa of Zn-bound water.
Phys Chem Chem Phys
; 20(47): 29637-29647, 2018 Dec 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30444500
17.
Influence of the Selectivity Filter Properties on Proton Selectivity in the Influenza A M2 Channel.
J Am Chem Soc
; 138(39): 13038-13047, 2016 10 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27617954
18.
Using an Old Drug to Target a New Drug Site: Application of Disulfiram to Target the Zn-Site in HCV NS5A Protein.
J Am Chem Soc
; 138(11): 3856-62, 2016 Mar 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26928525
19.
Factors controlling the selectivity for Na(+) over Mg(2+) in sodium transporters and enzymes.
Phys Chem Chem Phys
; 18(25): 16986-97, 2016 Jun 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27297356
20.
Identifying RNA-binding residues based on evolutionary conserved structural and energetic features.
Nucleic Acids Res
; 42(3): e15, 2014 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24343026