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Proc Natl Acad Sci U S A ; 106(10): 3829-34, 2009 Mar 10.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-19225104

RESUMO

Using chromatin immunoprecipitation combined with genomic microarrays we have identified targets of No tail (Ntl), a zebrafish Brachyury ortholog that plays a central role in mesoderm formation. We show that Ntl regulates a downstream network of other transcription factors and identify an in vivo Ntl binding site that resembles the consensus T-box binding site (TBS) previously identified by in vitro studies. We show that the notochord-expressed gene floating head (flh) is a direct transcriptional target of Ntl and that a combination of TBSs in the flh upstream region are required for Ntl-directed expression. Using our genome-scale data we have assembled a preliminary gene regulatory network that begins to describe mesoderm formation and patterning in the early zebrafish embryo.


Assuntos
Proteínas Fetais/metabolismo , Redes Reguladoras de Genes , Mesoderma/embriologia , Proteínas com Domínio T/metabolismo , Peixe-Zebra/embriologia , Peixe-Zebra/genética , Animais , Sequência de Bases , Sítios de Ligação , Padronização Corporal/genética , Linhagem da Célula , Sequência Conservada , Proteínas Fetais/genética , Gastrulação/genética , Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento , Proteínas de Homeodomínio/genética , Proteínas de Homeodomínio/metabolismo , Dados de Sequência Molecular , Músculos/citologia , Ligação Proteica , Proteínas com Domínio T/genética , Fatores de Transcrição/genética , Fatores de Transcrição/metabolismo , Transcrição Gênica , Proteínas de Peixe-Zebra/genética , Proteínas de Peixe-Zebra/metabolismo
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