Detalhe da pesquisa
1.
Gene expression cartography.
Nature
; 576(7785): 132-137, 2019 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31748748
2.
Deep learning and alignment of spatially resolved single-cell transcriptomes with Tangram.
Nat Methods
; 18(11): 1352-1362, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34711971
3.
Robust reconstruction of single-cell RNA-seq data with iterative gene weight updates.
Bioinformatics
; 39(39 Suppl 1): i423-i430, 2023 06 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37387155
4.
Revealing lineage-related signals in single-cell gene expression using random matrix theory.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(11)2021 03 16.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33836557
5.
Programming cell growth into different cluster shapes using diffusible signals.
PLoS Comput Biol
; 17(11): e1009576, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34748539
6.
Evidence for Functional Networks within the Human Brain's White Matter.
J Neurosci
; 37(27): 6394-6407, 2017 07 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28546311
7.
A defense-offense multi-layered regulatory switch in a pathogenic bacterium.
Nucleic Acids Res
; 43(3): 1357-69, 2015 Feb 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25628364
8.
Reversible functional connectivity disturbances during transient global amnesia.
Ann Neurol
; 75(5): 634-43, 2014 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24623317
9.
Global regulation of transcription by a small RNA: a quantitative view.
Biophys J
; 106(5): 1205-14, 2014 Mar 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24606944
10.
Interactions between distant ceRNAs in regulatory networks.
Biophys J
; 106(10): 2254-66, 2014 May 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24853754
11.
SiFT: uncovering hidden biological processes by probabilistic filtering of single-cell data.
Nat Commun
; 15(1): 760, 2024 Jan 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38278815
12.
Disentanglement of single-cell data with biolord.
Nat Biotechnol
; 2024 Jan 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38225466
13.
scPrisma infers, filters and enhances topological signals in single-cell data using spectral template matching.
Nat Biotechnol
; 41(11): 1645-1654, 2023 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36849830
14.
TACCO unifies annotation transfer and decomposition of cell identities for single-cell and spatial omics.
Nat Biotechnol
; 41(10): 1465-1473, 2023 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36797494
15.
Emergence of division of labor in tissues through cell interactions and spatial cues.
Cell Rep
; 42(5): 112412, 2023 05 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37086403
16.
NovoSpaRc: flexible spatial reconstruction of single-cell gene expression with optimal transport.
Nat Protoc
; 16(9): 4177-4200, 2021 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34349282
17.
ChIP-seq of plasma cell-free nucleosomes identifies gene expression programs of the cells of origin.
Nat Biotechnol
; 39(5): 586-598, 2021 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33432199
18.
Selective flexible packaging pathways of the segmented genome of influenza A virus.
Nat Commun
; 11(1): 4355, 2020 08 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32859915
19.
Single-cell analysis of germinal-center B cells informs on lymphoma cell of origin and outcome.
J Exp Med
; 217(10)2020 10 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32603407
20.
Temporal Dissociation of Neocortical and Hippocampal Contributions to Mental Time Travel Using Intracranial Recordings in Humans.
Front Comput Neurosci
; 12: 11, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29541024