Pesquisa | BVS Doenças Infecciosas e Parasitárias

1.

Ovarian cancer mutational processes drive site-specific immune evasion.

Vázquez-García, Ignacio; Uhlitz, Florian; Ceglia, Nicholas; Lim, Jamie L P; Wu, Michelle; Mohibullah, Neeman; Niyazov, Juliana; Ruiz, Arvin Eric B; Boehm, Kevin M; Bojilova, Viktoria; Fong, Christopher J; Funnell, Tyler; Grewal, Diljot; Havasov, Eliyahu; Leung, Samantha; Pasha, Arfath; Patel, Druv M; Pourmaleki, Maryam; Rusk, Nicole; Shi, Hongyu; Vanguri, Rami; Williams, Marc J; Zhang, Allen W; Broach, Vance; Chi, Dennis S; Da Cruz Paula, Arnaud; Gardner, Ginger J; Kim, Sarah H; Lennon, Matthew; Long Roche, Kara; Sonoda, Yukio; Zivanovic, Oliver; Kundra, Ritika; Viale, Agnes; Derakhshan, Fatemeh N; Geneslaw, Luke; Issa Bhaloo, Shirin; Maroldi, Ana; Nunez, Rahelly; Pareja, Fresia; Stylianou, Anthe; Vahdatinia, Mahsa; Bykov, Yonina; Grisham, Rachel N; Liu, Ying L; Lakhman, Yulia; Nikolovski, Ines; Kelly, Daniel; Gao, Jianjiong; Schietinger, Andrea.

Nature ; 612(7941): 778-786, 2022 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36517593

2.

Single-cell genomic variation induced by mutational processes in cancer.

Funnell, Tyler; O'Flanagan, Ciara H; Williams, Marc J; McPherson, Andrew; McKinney, Steven; Kabeer, Farhia; Lee, Hakwoo; Salehi, Sohrab; Vázquez-García, Ignacio; Shi, Hongyu; Leventhal, Emily; Masud, Tehmina; Eirew, Peter; Yap, Damian; Zhang, Allen W; Lim, Jamie L P; Wang, Beixi; Brimhall, Jazmine; Biele, Justina; Ting, Jerome; Au, Vinci; Van Vliet, Michael; Liu, Yi Fei; Beatty, Sean; Lai, Daniel; Pham, Jenifer; Grewal, Diljot; Abrams, Douglas; Havasov, Eliyahu; Leung, Samantha; Bojilova, Viktoria; Moore, Richard A; Rusk, Nicole; Uhlitz, Florian; Ceglia, Nicholas; Weiner, Adam C; Zaikova, Elena; Douglas, J Maxwell; Zamarin, Dmitriy; Weigelt, Britta; Kim, Sarah H; Da Cruz Paula, Arnaud; Reis-Filho, Jorge S; Martin, Spencer D; Li, Yangguang; Xu, Hong; de Algara, Teresa Ruiz; Lee, So Ra; Llanos, Viviana Cerda; Huntsman, David G.

Nature ; 612(7938): 106-115, 2022 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36289342

3.

Clonal fitness inferred from time-series modelling of single-cell cancer genomes.

Salehi, Sohrab; Kabeer, Farhia; Ceglia, Nicholas; Andronescu, Mirela; Williams, Marc J; Campbell, Kieran R; Masud, Tehmina; Wang, Beixi; Biele, Justina; Brimhall, Jazmine; Gee, David; Lee, Hakwoo; Ting, Jerome; Zhang, Allen W; Tran, Hoa; O'Flanagan, Ciara; Dorri, Fatemeh; Rusk, Nicole; de Algara, Teresa Ruiz; Lee, So Ra; Cheng, Brian Yu Chieh; Eirew, Peter; Kono, Takako; Pham, Jenifer; Grewal, Diljot; Lai, Daniel; Moore, Richard; Mungall, Andrew J; Marra, Marco A; McPherson, Andrew; Bouchard-Côté, Alexandre; Aparicio, Samuel; Shah, Sohrab P.

Nature ; 595(7868): 585-590, 2021 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34163070

4.

RNA editing with endogenous ADARs.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(4): 285, 2019 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30923387

5.

Human immunity to Cas9.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(4): 286, 2019 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30923392

6.

HACs with non-repetitive centromeres.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(10): 959, 2019 Oct.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31562474

7.

High-fidelity nucleases.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(10): 958, 2019 Oct.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31562485

8.

Solid-state nanopores read DNA.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(3): 217, 2019 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30814693

9.

Inhibiting CRISPR.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(3): 218, 2019 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30814697

10.

Spotlight on Cas12.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(3): 215, 2019 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30814702

11.

Pan-African genome.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(2): 143, 2019 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30700891

12.

Tagged reprogramming.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(2): 144, 2019 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30700894

13.

Creating epigenetic memory.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(2): 141, 2019 Feb.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30700899

14.

Tuning by degradation.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(7): 574, 2019 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31249410

15.

Expanded CIBERSORTx.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(7): 577, 2019 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31249418

16.

CRISPR inhibitors.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(7): 577, 2019 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31249419

17.

Variability in genome structure.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(5): 359, 2019 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31040422

18.

Optically mapping methylation.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(5): 362, 2019 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31040427

19.

Mitochondrial barcodes.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(5): 361, 2019 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31040429

20.

Tuning GPCR-based sensors.

Rusk, Nicole.

Nat Methods ; 16(6): 457, 2019 06.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31147640

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Human immunity to Cas9.

HACs with non-repetitive centromeres.

High-fidelity nucleases.

Solid-state nanopores read DNA.

Inhibiting CRISPR.

Spotlight on Cas12.

Pan-African genome.

Tagged reprogramming.

Creating epigenetic memory.

Tuning by degradation.

Expanded CIBERSORTx.

CRISPR inhibitors.

Variability in genome structure.

Optically mapping methylation.

Mitochondrial barcodes.

Tuning GPCR-based sensors.