RESUMO
The loops of modular polyketide synthases (PKSs) serve diverse functions but are largely uncharacterized. They frequently contain amino acid repeats resulting from genetic events such as slipped-strand mispairing. Determining the tolerance of loops to amino acid changes would aid in understanding and engineering these multidomain molecule factories. Here, tandem repeats in the DNA encoding 949 modules within 129 cis-acyltransferase PKSs were cataloged, and the locations of the corresponding amino acids within the module were identified. The most frequently inserted interdomain loop corresponds with the updated module boundary immediately downstream of the ketosynthase (KS), while the loops bordering the dehydratase are nearly intolerant to such insertions. From the 949 modules, no repetitive sequence loop insertions are located within ACP, and only 2 reside within KS, indicating the sensitivity of these domains to alteration.
Assuntos
Proteína de Transporte de Acila/química , Aciltransferases/química , Bactérias/enzimologia , Proteínas de Bactérias/química , Policetídeo Sintases/química , Policetídeos/metabolismo , Proteína de Transporte de Acila/classificação , Proteína de Transporte de Acila/genética , Proteína de Transporte de Acila/metabolismo , Aciltransferases/classificação , Aciltransferases/genética , Aciltransferases/metabolismo , Sequência de Aminoácidos , Bactérias/genética , Proteínas de Bactérias/genética , Proteínas de Bactérias/metabolismo , Sítios de Ligação , Clonagem Molecular , Cristalografia por Raios X , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/metabolismo , Expressão Gênica , Vetores Genéticos/química , Vetores Genéticos/metabolismo , Cinética , Modelos Moleculares , Policetídeo Sintases/classificação , Policetídeo Sintases/genética , Policetídeo Sintases/metabolismo , Policetídeos/química , Ligação Proteica , Conformação Proteica em alfa-Hélice , Conformação Proteica em Folha beta , Domínios e Motivos de Interação entre Proteínas , Proteínas Recombinantes/química , Proteínas Recombinantes/genética , Proteínas Recombinantes/metabolismo , Alinhamento de Sequência , Homologia de Sequência de Aminoácidos , Especificidade por Substrato , TermodinâmicaRESUMO
An HLA variant confers protective immunity against COVID-19 through cross-reactive T cells induced by seasonal coronaviruses.