Detalhe da pesquisa
1.
Computing linkage disequilibrium aware genome embeddings using autoencoders.
Bioinformatics
; 2024 May 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38775680
2.
StrainXpress: strain aware metagenome assembly from short reads.
Nucleic Acids Res
; 50(17): e101, 2022 09 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35776122
3.
OGRE: Overlap Graph-based metagenomic Read clustEring.
Bioinformatics
; 37(7): 905-912, 2021 05 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32871010
4.
De novo assembly of viral quasispecies using overlap graphs.
Genome Res
; 27(5): 835-848, 2017 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28396522
5.
Overlap graph-based generation of haplotigs for diploids and polyploids.
Bioinformatics
; 35(21): 4281-4289, 2019 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30994902
6.
Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction.
Bioinformatics
; 35(24): 5086-5094, 2019 12 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31147688
7.
Using the structure of genome data in the design of deep neural networks for predicting amyotrophic lateral sclerosis from genotype.
Bioinformatics
; 35(14): i538-i547, 2019 07 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31510706
8.
Characteristics of de novo structural changes in the human genome.
Genome Res
; 25(6): 792-801, 2015 Jun.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25883321
9.
Genotyping inversions and tandem duplications.
Bioinformatics
; 33(24): 4015-4023, 2017 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28169394
10.
Repeat- and error-aware comparison of deletions.
Bioinformatics
; 31(18): 2947-54, 2015 Sep 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25979471
11.
SV-AUTOPILOT: optimized, automated construction of structural variation discovery and benchmarking pipelines.
BMC Genomics
; 16: 238, 2015 Mar 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25887570
12.
Viral quasispecies assembly via maximal clique enumeration.
PLoS Comput Biol
; 10(3): e1003515, 2014 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24675810
13.
MATE-CLEVER: Mendelian-inheritance-aware discovery and genotyping of midsize and long indels.
Bioinformatics
; 29(24): 3143-50, 2013 Dec 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24072733
14.
Mapping proteins in the presence of paralogs using units of coevolution.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S18, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24564758
15.
Discovering motifs that induce sequencing errors.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 5: S1, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23735080
16.
Mirroring co-evolving trees in the light of their topologies.
Bioinformatics
; 28(9): 1202-8, 2012 May 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22399677
17.
CLEVER: clique-enumerating variant finder.
Bioinformatics
; 28(22): 2875-82, 2012 Nov 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23060616
18.
Hybrid-hybrid correction of errors in long reads with HERO.
Genome Biol
; 24(1): 275, 2023 Dec 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38041098
19.
Classifying short gene expression time-courses with Bayesian estimation of piecewise constant functions.
Bioinformatics
; 27(7): 946-52, 2011 Apr 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21266444
20.
Determining coding CpG islands by identifying regions significant for pattern statistics on Markov chains.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 10(1)2011 Sep 23.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23089814