Detalhe da pesquisa
1.
DeepFold: enhancing protein structure prediction through optimized loss functions, improved template features, and re-optimized energy function.
Bioinformatics
; 39(12)2023 12 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37995286
2.
AptaTrans: a deep neural network for predicting aptamer-protein interaction using pretrained encoders.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 447, 2023 Nov 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38012571
3.
FastqCLS: a FASTQ compressor for long-read sequencing via read reordering using a novel scoring model.
Bioinformatics
; 38(2): 351-356, 2022 01 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34623374
4.
Comprehensive, integrated, and phased whole-genome analysis of the primary ENCODE cell line K562.
Genome Res
; 29(3): 472-484, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30737237
5.
Haplotype-resolved and integrated genome analysis of the cancer cell line HepG2.
Nucleic Acids Res
; 47(8): 3846-3861, 2019 05 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30864654
6.
Authentication of differential gene expression in oral squamous cell carcinoma using machine learning applications.
BMC Oral Health
; 21(1): 281, 2021 05 29.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34051764
7.
The Saccharomyces Genome Database Variant Viewer.
Nucleic Acids Res
; 44(D1): D698-702, 2016 Jan 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26578556
8.
DISPAQ: Distributed Profitable-Area Query from Big Taxi Trip Data.
Sensors (Basel)
; 17(10)2017 Sep 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28946679
9.
Acute myocardial infarction prognosis prediction with reliable and interpretable artificial intelligence system.
J Am Med Inform Assoc
; 31(7): 1540-1550, 2024 Jun 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38804963
10.
Evaluation of methods for detecting conversion events in gene clusters.
BMC Bioinformatics
; 12 Suppl 1: S45, 2011 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21342577
11.
Conversion events in gene clusters.
BMC Evol Biol
; 11: 226, 2011 Jul 28.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21798034
12.
DNN-Boost: Somatic mutation identification of tumor-only whole-exome sequencing data using deep neural network and XGBoost.
J Bioinform Comput Biol
; 19(6): 2140017, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34895111
13.
Predicting aptamer sequences that interact with target proteins using an aptamer-protein interaction classifier and a Monte Carlo tree search approach.
PLoS One
; 16(6): e0253760, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34170922
14.
CNN-Peaks: ChIP-Seq peak detection pipeline using convolutional neural networks that imitate human visual inspection.
Sci Rep
; 10(1): 7933, 2020 05 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32404971
15.
Chromosome-level de novo assembly of the pig-tailed macaque genome using linked-read sequencing and HiC proximity scaffolding.
Gigascience
; 9(7)2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32649757
16.
Integrative Meta-Assembly Pipeline (IMAP): Chromosome-level genome assembler combining multiple de novo assemblies.
PLoS One
; 14(8): e0221858, 2019.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31454399
17.
From one to many: expanding the Saccharomyces cerevisiae reference genome panel.
Database (Oxford)
; 20162016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26989152
18.
Integration of new alternative reference strain genome sequences into the Saccharomyces genome database.
Database (Oxford)
; 20162016.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27252399
19.
AGAPE (Automated Genome Analysis PipelinE) for pan-genome analysis of Saccharomyces cerevisiae.
PLoS One
; 10(3): e0120671, 2015.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25781462
20.
Revealing mammalian evolutionary relationships by comparative analysis of gene clusters.
Genome Biol Evol
; 4(4): 586-601, 2012.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22454131