Detalhe da pesquisa
1.
Integrated analysis of multimodal single-cell data.
Cell
; 184(13): 3573-3587.e29, 2021 06 24.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34062119
2.
Alevin-fry unlocks rapid, accurate and memory-frugal quantification of single-cell RNA-seq data.
Nat Methods
; 19(3): 316-322, 2022 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35277707
3.
Single-cell chromatin state analysis with Signac.
Nat Methods
; 18(11): 1333-1341, 2021 11.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34725479
4.
Airpart: interpretable statistical models for analyzing allelic imbalance in single-cell datasets.
Bioinformatics
; 38(10): 2773-2780, 2022 05 13.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35561168
5.
Compression of quantification uncertainty for scRNA-seq counts.
Bioinformatics
; 37(12): 1699-1707, 2021 Jul 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33471073
6.
Preprocessing choices affect RNA velocity results for droplet scRNA-seq data.
PLoS Comput Biol
; 17(1): e1008585, 2021 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33428615
7.
A Bayesian framework for inter-cellular information sharing improves dscRNA-seq quantification.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i292-i299, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32657394
8.
Terminus enables the discovery of data-driven, robust transcript groups from RNA-seq data.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i102-i110, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32657377
9.
Nonparametric expression analysis using inferential replicate counts.
Nucleic Acids Res
; 47(18): e105, 2019 10 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31372651
10.
Author Correction: Single-cell chromatin state analysis with Signac.
Nat Methods
; 19(2): 257, 2022 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34997233
11.
Minnow: a principled framework for rapid simulation of dscRNA-seq data at the read level.
Bioinformatics
; 35(14): i136-i144, 2019 07 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31510649
12.
A space and time-efficient index for the compacted colored de Bruijn graph.
Bioinformatics
; 34(13): i169-i177, 2018 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29949982
13.
Improved data-driven likelihood factorizations for transcript abundance estimation.
Bioinformatics
; 33(14): i142-i151, 2017 Jul 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28881996
14.
RapMap: a rapid, sensitive and accurate tool for mapping RNA-seq reads to transcriptomes.
Bioinformatics
; 32(12): i192-i200, 2016 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27307617
15.
Dictionary learning for integrative, multimodal and scalable single-cell analysis.
Nat Biotechnol
; 42(2): 293-304, 2024 Feb.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37231261
16.
Characterizing cellular heterogeneity in chromatin state with scCUT&Tag-pro.
Nat Biotechnol
; 40(8): 1220-1230, 2022 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35332340
17.
Alignment and mapping methodology influence transcript abundance estimation.
Genome Biol
; 21(1): 239, 2020 09 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32894187
18.
Alevin efficiently estimates accurate gene abundances from dscRNA-seq data.
Genome Biol
; 20(1): 65, 2019 03 27.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30917859
19.
Social Media Based Analysis of Opioid Epidemic Using Reddit.
AMIA Annu Symp Proc
; 2018: 867-876, 2018.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30815129
20.
Texture-based medical image retrieval in compressed domain using compressive sensing.
Int J Bioinform Res Appl
; 10(2): 129-44, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24589833