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1.
Bioinformatics ; 20(18): 3638-40, 2004 Dec 12.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-15247099

RESUMO

SUMMARY: SARGE is a tool for creating, visualizing and manipulating a putative genetic network from time series microarray data. The tool assigns potential edges through time-lagged correlation, incorporates a clustering mechanism, an interactive visual graph representation and employs simulated annealing for network optimization. AVAILABILITY: The application is available as a .jar file from http://www.bioinformatics.cs.ncl.ac.uk/sarge/index.html.


Assuntos
Perfilação da Expressão Gênica/métodos , Regulação da Expressão Gênica/fisiologia , Modelos Genéticos , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos/métodos , Transdução de Sinais/fisiologia , Software , Interface Usuário-Computador , Algoritmos , Reconhecimento Automatizado de Padrão/métodos
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