Pesquisa | BVS Doenças Infecciosas e Parasitárias

1.

SnapShot: Intrinsic Structural Disorder.

Guharoy, Mainak; Pauwels, Kris; Tompa, Peter.

Cell ; 161(5): 1230-1230.e1, 2015 May 21.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26000490

2.

The role of ordered cooperative assembly in biomolecular condensates.

Korkmazhan, Elgin; Tompa, Peter; Dunn, Alexander R.

Nat Rev Mol Cell Biol ; 22(10): 647-648, 2021 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34349250

3.

Minimum information guidelines for experiments structurally characterizing intrinsically disordered protein regions.

Mészáros, Bálint; Hatos, András; Palopoli, Nicolas; Quaglia, Federica; Salladini, Edoardo; Van Roey, Kim; Arthanari, Haribabu; Dosztányi, Zsuzsanna; Felli, Isabella C; Fischer, Patrick D; Hoch, Jeffrey C; Jeffries, Cy M; Longhi, Sonia; Maiani, Emiliano; Orchard, Sandra; Pancsa, Rita; Papaleo, Elena; Pierattelli, Roberta; Piovesan, Damiano; Pritisanac, Iva; Tenorio, Luiggi; Viennet, Thibault; Tompa, Peter; Vranken, Wim; Tosatto, Silvio C E; Davey, Norman E.

Nat Methods ; 20(9): 1291-1303, 2023 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37400558

4.

PED in 2024: improving the community deposition of structural ensembles for intrinsically disordered proteins.

Ghafouri, Hamidreza; Lazar, Tamas; Del Conte, Alessio; Tenorio Ku, Luiggi G; Tompa, Peter; Tosatto, Silvio C E; Monzon, Alexander Miguel.

Nucleic Acids Res ; 52(D1): D536-D544, 2024 Jan 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37904608

5.

Phase Separation of C9orf72 Dipeptide Repeats Perturbs Stress Granule Dynamics.

Boeynaems, Steven; Bogaert, Elke; Kovacs, Denes; Konijnenberg, Albert; Timmerman, Evy; Volkov, Alex; Guharoy, Mainak; De Decker, Mathias; Jaspers, Tom; Ryan, Veronica H; Janke, Abigail M; Baatsen, Pieter; Vercruysse, Thomas; Kolaitis, Regina-Maria; Daelemans, Dirk; Taylor, J Paul; Kedersha, Nancy; Anderson, Paul; Impens, Francis; Sobott, Frank; Schymkowitz, Joost; Rousseau, Frederic; Fawzi, Nicolas L; Robberecht, Wim; Van Damme, Philip; Tompa, Peter; Van Den Bosch, Ludo.

Mol Cell ; 65(6): 1044-1055.e5, 2017 Mar 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-28306503

6.

A fish herpesvirus highlights functional diversities among Zα domains related to phase separation induction and A-to-Z conversion.

Diallo, Mamadou Amadou; Pirotte, Sébastien; Hu, Yunlong; Morvan, Léa; Rakus, Krzysztof; Suárez, Nicolás M; PoTsang, Lee; Saneyoshi, Hisao; Xu, Yan; Davison, Andrew J; Tompa, Peter; Sussman, Joel L; Vanderplasschen, Alain.

Nucleic Acids Res ; 51(2): 806-830, 2023 01 25.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36130731

7.

Learning of Signaling Networks: Molecular Mechanisms.

Csermely, Péter; Kunsic, Nina; Mendik, Péter; Kerestély, Márk; Faragó, Teodóra; Veres, Dániel V; Tompa, Péter.

Trends Biochem Sci ; 45(4): 284-294, 2020 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32008897

8.

PED in 2021: a major update of the protein ensemble database for intrinsically disordered proteins.

Lazar, Tamas; Martínez-Pérez, Elizabeth; Quaglia, Federica; Hatos, András; Chemes, Lucía B; Iserte, Javier A; Méndez, Nicolás A; Garrone, Nicolás A; Saldaño, Tadeo E; Marchetti, Julia; Rueda, Ana Julia Velez; Bernadó, Pau; Blackledge, Martin; Cordeiro, Tiago N; Fagerberg, Eric; Forman-Kay, Julie D; Fornasari, Maria S; Gibson, Toby J; Gomes, Gregory-Neal W; Gradinaru, Claudiu C; Head-Gordon, Teresa; Jensen, Malene Ringkjøbing; Lemke, Edward A; Longhi, Sonia; Marino-Buslje, Cristina; Minervini, Giovanni; Mittag, Tanja; Monzon, Alexander Miguel; Pappu, Rohit V; Parisi, Gustavo; Ricard-Blum, Sylvie; Ruff, Kiersten M; Salladini, Edoardo; Skepö, Marie; Svergun, Dmitri; Vallet, Sylvain D; Varadi, Mihaly; Tompa, Peter; Tosatto, Silvio C E; Piovesan, Damiano.

Nucleic Acids Res ; 49(D1): D404-D411, 2021 01 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33305318

9.

F/YGG-motif is an intrinsically disordered nucleic-acid binding motif.

Van Lindt, Joris; Lazar, Tamas; Pakravan, Donya; Demulder, Manon; Meszaros, Attila; Van Den Bosch, Ludo; Maes, Dominique; Tompa, Peter.

RNA Biol ; 19(1): 622-635, 2022.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35491929

10.

A million peptide motifs for the molecular biologist.

Tompa, Peter; Davey, Norman E; Gibson, Toby J; Babu, M Madan.

Mol Cell ; 55(2): 161-9, 2014 Jul 17.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-25038412

11.

PhaSePro: the database of proteins driving liquid-liquid phase separation.

Mészáros, Bálint; Erdos, Gábor; Szabó, Beáta; Schád, Éva; Tantos, Ágnes; Abukhairan, Rawan; Horváth, Tamás; Murvai, Nikoletta; Kovács, Orsolya P; Kovács, Márton; Tosatto, Silvio C E; Tompa, Péter; Dosztányi, Zsuzsanna; Pancsa, Rita.

Nucleic Acids Res ; 48(D1): D360-D367, 2020 01 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31612960

12.

Spontaneous driving forces give rise to protein-RNA condensates with coexisting phases and complex material properties.

Boeynaems, Steven; Holehouse, Alex S; Weinhardt, Venera; Kovacs, Denes; Van Lindt, Joris; Larabell, Carolyn; Van Den Bosch, Ludo; Das, Rhiju; Tompa, Peter S; Pappu, Rohit V; Gitler, Aaron D.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 116(16): 7889-7898, 2019 04 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30926670

13.

Integration of Data from Liquid-Liquid Phase Separation Databases Highlights Concentration and Dosage Sensitivity of LLPS Drivers.

Farahi, Nazanin; Lazar, Tamas; Wodak, Shoshana J; Tompa, Peter; Pancsa, Rita.

Int J Mol Sci ; 22(6)2021 Mar 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33809541

14.

Cellular Chaperone Function of Intrinsically Disordered Dehydrin ERD14.

Murvai, Nikoletta; Kalmar, Lajos; Szabo, Beata; Schad, Eva; Micsonai, András; Kardos, József; Buday, László; Han, Kyou-Hoon; Tompa, Peter; Tantos, Agnes.

Int J Mol Sci ; 22(12)2021 Jun 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34201246

15.

Coding Regions of Intrinsic Disorder Accommodate Parallel Functions.

Pancsa, Rita; Tompa, Peter.

Trends Biochem Sci ; 41(11): 898-906, 2016 11.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-27647212

16.

Distance-Based Metrics for Comparing Conformational Ensembles of Intrinsically Disordered Proteins.

Lazar, Tamas; Guharoy, Mainak; Vranken, Wim; Rauscher, Sarah; Wodak, Shoshana J; Tompa, Peter.

Biophys J ; 118(12): 2952-2965, 2020 06 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32502383

17.

AmyPro: a database of proteins with validated amyloidogenic regions.

Varadi, Mihaly; De Baets, Greet; Vranken, Wim F; Tompa, Peter; Pancsa, Rita.

Nucleic Acids Res ; 46(D1): D387-D392, 2018 01 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29040693

18.

MobiDB 3.0: more annotations for intrinsic disorder, conformational diversity and interactions in proteins.

Piovesan, Damiano; Tabaro, Francesco; Paladin, Lisanna; Necci, Marco; Micetic, Ivan; Camilloni, Carlo; Davey, Norman; Dosztányi, Zsuzsanna; Mészáros, Bálint; Monzon, Alexander M; Parisi, Gustavo; Schad, Eva; Sormanni, Pietro; Tompa, Peter; Vendruscolo, Michele; Vranken, Wim F; Tosatto, Silvio C E.

Nucleic Acids Res ; 46(D1): D471-D476, 2018 01 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29136219

19.

WT and A53T α-Synuclein Systems: Melting Diagram and Its New Interpretation.

Bokor, Mónika; Tantos, Ágnes; Tompa, Péter; Han, Kyou-Hoon; Tompa, Kálmán.

Int J Mol Sci ; 21(11)2020 Jun 03.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-32503167

20.

Redefining the BH3 Death Domain as a 'Short Linear Motif'.

Aouacheria, Abdel; Combet, Christophe; Tompa, Peter; Hardwick, J Marie.

Trends Biochem Sci ; 40(12): 736-748, 2015 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26541461

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