Detalhe da pesquisa
1.
Alignment of biological networks by integer linear programming: virus-host protein-protein interaction networks.
BMC Bioinformatics
; 21(Suppl 6): 434, 2020 Nov 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33203352
2.
AligNet: alignment of protein-protein interaction networks.
BMC Bioinformatics
; 21(Suppl 6): 265, 2020 Nov 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33203353
3.
A balance index for phylogenetic trees based on rooted quartets.
J Math Biol
; 79(3): 1105-1148, 2019 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31209515
4.
BioMaS: a modular pipeline for Bioinformatic analysis of Metagenomic AmpliconS.
BMC Bioinformatics
; 16: 203, 2015 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26130132
5.
Further steps in TANGO: improved taxonomic assignment in metagenomics.
Bioinformatics
; 30(1): 17-23, 2014 Jan 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23645816
6.
Reference databases for taxonomic assignment in metagenomics.
Brief Bioinform
; 13(6): 682-95, 2012 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-22786784
7.
The comparison of tree-sibling time consistent phylogenetic networks is graph isomorphism-complete.
ScientificWorldJournal
; 2014: 254279, 2014.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24982934
8.
The k-Robinson-Foulds Dissimilarity Measures for Comparison of Labeled Trees.
J Comput Biol
; 31(4): 328-344, 2024 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38271573
9.
Computational challenges of sequence classification in microbiomic data.
Brief Bioinform
; 12(6): 614-25, 2011 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21504986
10.
The Landscape of Virus-Host Protein-Protein Interaction Databases.
Front Microbiol
; 13: 827742, 2022.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35910656
11.
Flexible taxonomic assignment of ambiguous sequencing reads.
BMC Bioinformatics
; 12: 8, 2011 Jan 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21211059
12.
The Generalized Robinson-Foulds Distance for Phylogenetic Trees.
J Comput Biol
; 28(12): 1181-1195, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34714118
13.
Characterization of phylogenetic networks with NetTest.
BMC Bioinformatics
; 11: 268, 2010 May 20.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20487540
14.
An optimized TOPS+ comparison method for enhanced TOPS models.
BMC Bioinformatics
; 11: 138, 2010 Mar 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-20236520
15.
Nodal distances for rooted phylogenetic trees.
J Math Biol
; 61(2): 253-276, 2010 Aug.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19760227
16.
Alignment of virus-host protein-protein interaction networks by integer linear programming: SARS-CoV-2.
PLoS One
; 15(12): e0236304, 2020.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33284827
17.
Optimized ancestral state reconstruction using Sankoff parsimony.
BMC Bioinformatics
; 10: 51, 2009 Feb 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-19200389
18.
Characterization of reticulate networks based on the coalescent with recombination.
Mol Biol Evol
; 25(12): 2517-20, 2008 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18927089
19.
Bioinformatics approaches and tools for metagenomic analysis. Editorial.
Brief Bioinform
; 13(6): 645, 2012 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23175747
20.
A distance metric for a class of tree-sibling phylogenetic networks.
Bioinformatics
; 24(13): 1481-8, 2008 Jul 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-18477576