Detalhe da pesquisa
1.
A protocol for dynamic model calibration.
Brief Bioinform
; 23(1)2022 01 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34619769
2.
Benchmarking tools for a priori identifiability analysis.
Bioinformatics
; 39(2)2023 02 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36721336
3.
Improving dynamic predictions with ensembles of observable models.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36416122
4.
STRIKE-GOLDD 4.0: user-friendly, efficient analysis of structural identifiability and observability.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36398887
5.
Distilling identifiable and interpretable dynamic models from biological data.
PLoS Comput Biol
; 19(10): e1011014, 2023 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37851682
6.
On testing structural identifiability by a simple scaling method: Relying on scaling symmetries can be misleading.
PLoS Comput Biol
; 17(10): e1009032, 2021 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34648496
7.
PEtab-Interoperable specification of parameter estimation problems in systems biology.
PLoS Comput Biol
; 17(1): e1008646, 2021 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33497393
8.
Structural identifiability and observability of compartmental models of the COVID-19 pandemic.
Annu Rev Control
; 51: 441-459, 2021.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33362427
9.
Benchmarking optimization methods for parameter estimation in large kinetic models.
Bioinformatics
; 35(5): 830-838, 2019 03 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30816929
10.
Dynamical compensation and structural identifiability of biological models: Analysis, implications, and reconciliation.
PLoS Comput Biol
; 13(11): e1005878, 2017 Nov.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29186132
11.
Data-driven reverse engineering of signaling pathways using ensembles of dynamic models.
PLoS Comput Biol
; 13(2): e1005379, 2017 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28166222
12.
Structural Identifiability of Dynamic Systems Biology Models.
PLoS Comput Biol
; 12(10): e1005153, 2016 Oct.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27792726
13.
Enabling network inference methods to handle missing data and outliers.
BMC Bioinformatics
; 16: 283, 2015 Sep 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26335628
14.
MEIGO: an open-source software suite based on metaheuristics for global optimization in systems biology and bioinformatics.
BMC Bioinformatics
; 15: 136, 2014 May 10.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24885957
15.
Structural Identifiability and Observability of Microbial Community Models.
Bioengineering (Basel)
; 10(4)2023 Apr 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37106670
16.
Controllability and accessibility analysis of nonlinear biosystems.
Comput Methods Programs Biomed
; 242: 107837, 2023 Dec.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37837888
17.
Assessment of Prediction Uncertainty Quantification Methods in Systems Biology.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 20(3): 1725-1736, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36223355
18.
Use of a generalized fisher equation for global optimization in chemical kinetics.
J Phys Chem A
; 115(30): 8426-36, 2011 Aug 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-21711023
19.
Full observability and estimation of unknown inputs, states and parameters of nonlinear biological models.
J R Soc Interface
; 16(156): 20190043, 2019 07 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31266417
20.
Corrigendum to "Controllability and accessibility analysis of nonlinear biosystems" [Computer Methods and Programs in Biomedicine 242 (2023) 107837].
Comput Methods Programs Biomed
; 245: 108015, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38219338