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Bioorg Med Chem Lett ; 25(14): 2818-23, 2015 Jul 15.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26022843

RESUMO

Bromodomains are key transcriptional regulators that are thought to be druggable epigenetic targets for cancer, inflammation, diabetes and cardiovascular therapeutics. Of particular importance is the first of two bromodomains in bromodomain containing 4 protein (BRD4(1)). Protein-ligand docking in BRD4(1) was used to purchase a small, focused screening set of compounds possessing a large variety of core structures. Within this set, a small number of weak hits each contained a dihydroquinoxalinone ring system. We purchased other analogs with this ring system and further validated the new hit series and obtained improvement in binding inhibition. Limited exploration by new analog synthesis showed that the binding inhibition in a FRET assay could be improved to the low µM level making this new core a potential hit-to-lead series. Additionally, the predicted geometries of the initial hit and an improved analog were confirmed by X-ray co-crystallography with BRD4(1).


Assuntos
Desenho de Fármacos , Ligantes , Proteínas Nucleares/antagonistas & inibidores , Fatores de Transcrição/antagonistas & inibidores , Sítios de Ligação , Proteínas de Ciclo Celular , Cristalografia por Raios X , Avaliação Pré-Clínica de Medicamentos , Humanos , Simulação de Acoplamento Molecular , Proteínas Nucleares/metabolismo , Ligação Proteica , Estrutura Terciária de Proteína , Quinoxalinas/química , Quinoxalinas/metabolismo , Relação Estrutura-Atividade , Fatores de Transcrição/metabolismo
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