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Exome sequencing of only seven Qataris identifies potentially deleterious variants in the Qatari population.
Rodriguez-Flores, Juan L; Fuller, Jennifer; Hackett, Neil R; Salit, Jacqueline; Malek, Joel A; Al-Dous, Eman; Chouchane, Lotfi; Zirie, Mahmoud; Jayoussi, Amin; Mahmoud, Mai A; Crystal, Ronald G; Mezey, Jason G.
Afiliação
  • Rodriguez-Flores JL; Department of Genetic Medicine, Weill Cornell Medical College, New York, New York, USA.
PLoS One ; 7(11): e47614, 2012.
Article em En | MEDLINE | ID: mdl-23139751
ABSTRACT
The Qatari population, located at the Arabian migration crossroads of African and Eurasia, is comprised of Bedouin, Persian and African genetic subgroups. By deep exome sequencing of only 7 Qataris, including individuals in each subgroup, we identified 2,750 nonsynonymous SNPs predicted to be deleterious, many of which are linked to human health, or are in genes linked to human health. Many of these SNPs were at significantly elevated deleterious allele frequency in Qataris compared to other populations worldwide. Despite the small sample size, SNP allele frequency was highly correlated with a larger Qatari sample. Together, the data demonstrate that exome sequencing of only a small number of individuals can reveal genetic variations with potential health consequences in understudied populations.
Assuntos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de DNA / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Exoma / Genética Populacional Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans País/Região como assunto: Asia Idioma: En Revista: PLoS One Assunto da revista: CIENCIA / MEDICINA Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos

Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Análise de Sequência de DNA / Polimorfismo de Nucleotídeo Único / Exoma / Genética Populacional Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans País/Região como assunto: Asia Idioma: En Revista: PLoS One Assunto da revista: CIENCIA / MEDICINA Ano de publicação: 2012 Tipo de documento: Article País de afiliação: Estados Unidos