Homology modeling of T. cruzi and L. major NADH-dependent fumarate reductases: ligand docking, molecular dynamics validation, and insights on their binding modes.

Merlino, Alicia; Vieites, Marisol; Gambino, Dinorah; Coitiño, E Laura

Merlino, Alicia; Vieites, Marisol; Gambino, Dinorah; Coitiño, E Laura.

Afiliação

Merlino A; Laboratorio de Química Teórica y Computacional, Instituto de Química Biológica, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Iguá 4225, 11400 Montevideo, Uruguay. Electronic address: amerlino@fcien.edu.uy.
Vieites M; Cátedra de Química Inorgánica, Facultad de Química, Universidad de la República, Gral. Flores 2124, C. C. 1157, 11800 Montevideo, Uruguay.
Gambino D; Cátedra de Química Inorgánica, Facultad de Química, Universidad de la República, Gral. Flores 2124, C. C. 1157, 11800 Montevideo, Uruguay.
Coitiño EL; Laboratorio de Química Teórica y Computacional, Instituto de Química Biológica, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Iguá 4225, 11400 Montevideo, Uruguay. Electronic address: laurac@fcien.edu.uy.

J Mol Graph Model ; 48: 47-59, 2014 Mar.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24370672

Assuntos

Leishmania major/enzimologia; Simulação de Acoplamento Molecular; Oxirredutases atuantes sobre Doadores de Grupo CH-CH/química; Proteínas de Protozoários/química; Succinato Desidrogenase/química; Trypanosoma cruzi/enzimologia; Sequência de Aminoácidos; Domínio Catalítico; Sequência Conservada; Fumaratos/química; Ligação de Hidrogênio; Dados de Sequência Molecular; NAD/química; Ligação Proteica; Estrutura Secundária de Proteína; Homologia de Sequência de Aminoácidos; Homologia Estrutural de Proteína; Ácido Succínico/química

Palavras-chave

Anti-trypanosomatids rational design; Computational modeling; NADH-dependent fumarate reductase 3D structure; NADH/fumarate binding mode; Trypanosoma cruzi/Leishmania major fumarate reductases inhibitors

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Succinato Desidrogenase / Trypanosoma cruzi / Proteínas de Protozoários / Leishmania major / Oxirredutases atuantes sobre Doadores de Grupo CH-CH / Simulação de Acoplamento Molecular Idioma: En Revista: J Mol Graph Model Assunto da revista: BIOLOGIA MOLECULAR Ano de publicação: 2014 Tipo de documento: Article

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