Comparative analysis of methods for identifying somatic copy number alterations from deep sequencing data.

Alkodsi, Amjad; Louhimo, Riku; Hautaniemi, Sampsa

Alkodsi, Amjad; Louhimo, Riku; Hautaniemi, Sampsa.

Brief Bioinform ; 16(2): 242-54, 2015 Mar.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-24599115

Assuntos

Biologia Computacional/métodos; Variações do Número de Cópias de DNA; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala/estatística & dados numéricos; Neoplasias/genética; Algoritmos; Neoplasias da Mama/genética; Simulação por Computador; DNA de Neoplasias/genética; Exoma; Feminino; Dosagem de Genes; Genoma Humano; Humanos; Polimorfismo de Nucleotídeo Único; Análise de Sequência de DNA/estatística & dados numéricos

Palavras-chave

Somatic copy number alterations; algorithm comparison; cancer; whole-exome sequencing; whole-genome sequencing

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Biologia Computacional / Variações do Número de Cópias de DNA / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Neoplasias Limite: Female / Humans Idioma: En Revista: Brief Bioinform Assunto da revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article

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