T-lex2: genotyping, frequency estimation and re-annotation of transposable elements using single or pooled next-generation sequencing data.

Fiston-Lavier, Anna-Sophie; Barrón, Maite G; Petrov, Dmitri A; González, Josefa

Fiston-Lavier, Anna-Sophie; Barrón, Maite G; Petrov, Dmitri A; González, Josefa.

Afiliação

Fiston-Lavier AS; Department of Biology, Stanford University, Stanford, CA 94305-5020, USA Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (ISEM), UMR5554 CNRS-Université Montpellier 2, France asfiston@univ-montp2.fr.
Barrón MG; Genomics, Bioinformatics and Evolution Group, Institut de Biotecnologia i de Biomedicina - IBB/Department of Genetics and Microbiology, Campus Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra 08193, Spain Institute of Evolutionary Biology (CSIC-Universitat Pompeu Fabra), Barcelona 08003, Spain.
Petrov DA; Department of Biology, Stanford University, Stanford, CA 94305-5020, USA.
González J; Institute of Evolutionary Biology (CSIC-Universitat Pompeu Fabra), Barcelona 08003, Spain.

Nucleic Acids Res ; 43(4): e22, 2015 Feb 27.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25510498

Assuntos

Técnicas de Genotipagem/métodos; Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala; Sequências Repetitivas Dispersas; Anotação de Sequência Molecular/métodos; Análise de Sequência de DNA; Software; Animais; Drosophila melanogaster/genética; Genoma Humano; Genoma de Inseto; Humanos

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Software / Análise de Sequência de DNA / Sequências Repetitivas Dispersas / Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala / Anotação de Sequência Molecular / Técnicas de Genotipagem Limite: Animals / Humans Idioma: En Revista: Nucleic Acids Res Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: França

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