Validation of a novel shotgun proteomic workflow for the discovery of protein-protein interactions: focus on ZNF521.

Bernaudo, Francesca; Monteleone, Francesca; Mesuraca, Maria; Krishnan, Shibu; Chiarella, Emanuela; Scicchitano, Stefania; Cuda, Giovanni; Morrone, Giovanni; Bond, Heather M; Gaspari, Marco

Bernaudo, Francesca; Monteleone, Francesca; Mesuraca, Maria; Krishnan, Shibu; Chiarella, Emanuela; Scicchitano, Stefania; Cuda, Giovanni; Morrone, Giovanni; Bond, Heather M; Gaspari, Marco.

Afiliação

Bernaudo F; Department of Experimental and Clinical Medicine, Laboratory of Molecular Haematopoiesis and Stem Cell Biology, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Monteleone F; Department of Experimental and Clinical Medicine, Proteomics@UMG, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Mesuraca M; Department of Experimental and Clinical Medicine, Laboratory of Molecular Haematopoiesis and Stem Cell Biology, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Krishnan S; Department of Experimental and Clinical Medicine, Proteomics@UMG, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Chiarella E; Department of Experimental and Clinical Medicine, Laboratory of Molecular Haematopoiesis and Stem Cell Biology, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Scicchitano S; Department of Experimental and Clinical Medicine, Laboratory of Molecular Haematopoiesis and Stem Cell Biology, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Cuda G; Department of Experimental and Clinical Medicine, Proteomics@UMG, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Morrone G; Department of Experimental and Clinical Medicine, Laboratory of Molecular Haematopoiesis and Stem Cell Biology, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Bond HM; Department of Experimental and Clinical Medicine, Laboratory of Molecular Haematopoiesis and Stem Cell Biology, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.
Gaspari M; Department of Experimental and Clinical Medicine, Proteomics@UMG, University Magna Graecia, Catanzaro 88100, Italy.

J Proteome Res ; 14(4): 1888-99, 2015 Apr 03.

Article em En | MEDLINE | ID: mdl-25774781

Assuntos

Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo; Espectrometria de Massas/métodos; Mapeamento de Interação de Proteínas/métodos; Proteômica/métodos; Fluxo de Trabalho; Western Blotting; Proteínas de Ciclo Celular/metabolismo; Humanos; Imunoprecipitação; Marcação por Isótopo; Complexo Mi-2 de Remodelação de Nucleossomo e Desacetilase/metabolismo; Proteínas Nucleares/metabolismo; Isótopos de Oxigênio; Mapeamento de Interação de Proteínas/instrumentação; Proteínas; Succinimidas; Fatores de Transcrição/metabolismo; Fatores de Elongação da Transcrição/metabolismo

Palavras-chave

18O labeling; AP-MS; NuRD core complex; Spt16; Spt5; ZNF423; ZNF521; interactomics; mass spectrometry; proteomics; shotgun proteomics

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Texto completo: 1 Coleções: 01-internacional Base de dados: MEDLINE Assunto principal: Espectrometria de Massas / Mapeamento de Interação de Proteínas / Proteômica / Proteínas de Ligação a DNA / Fluxo de Trabalho Tipo de estudo: Prognostic_studies Limite: Humans Idioma: En Revista: J Proteome Res Assunto da revista: BIOQUIMICA Ano de publicação: 2015 Tipo de documento: Article País de afiliação: Itália

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